第九届亚太生物化工会议（APBioChEC，09）报道

2009年11月24日至29日,第九届亚太生物化工会议（AsiaPacifiCBiochemicalEngineeringConference2009．APBioChEC’09）在日本神户的神户国际会议中心隆重举行。来自中国、日本、中国台湾、韩国、印度、马来西亚、印度尼西亚、新加坡、瑞典、德国、澳大利亚、美国、新西兰、泰国等20多个国家和地区的550余位学者和学生参加了本次亚太生物化工盛会。     

分子动力学模拟尿素对水溶液中蛋白质构象转变的影响

采用分子动力学方法和全原子模型研究尿素和水分子对模型蛋白S-肽链结构转化的影响。模拟结果显示S-肽链的变性速率常数k值随着尿素浓度的增加而先降低后升高,在尿素浓度为2.9 mol/L时达到最低值。模拟了不同尿素浓度下尿素-肽链、水-肽链以及肽链分子氢键的形成状况。结果表明:尿素浓度较低时,尿素分子与S-肽链的极性氨基酸侧链形成氢键,但不破坏其分子内的骨架氢键,尿素在S-肽链水化层外形成限制性空间,增强了S-肽链的稳定性。随着尿素的升高,尿素分子进入S-肽链内部并与其内部氨基酸残基形成氢键,导致S-肽链的骨架氢键丧失,S-肽链发生去折叠。上述模拟结果与文献报道的实验结果一致,从分子水平上揭示了尿素对蛋白质分子结构变化的影响机制,对于研究和发展蛋白质折叠及稳定化技术具有指导意义。