基于DNA池测序法筛选奶牛高信息量SNP标记的可行性

首先选择139个牛SNP标记,利用DNA池测序法,根据测序峰图中不同碱基信号峰高的比值确定了92个SNP为高信息量标记(比值1/2);为了进一步验证筛选的准确性,对其中59个标记采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix-assisted laser desorption/ionisation time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术检测了122头荷斯坦牛的基因型。结果显示,检出率高于85%的标记有56个,其平均最小等位基因频率(Minor allele frequency,MAF)为0.41,最小值为0.27,最大值为0.5;MAF0.3的标记有54个,占96.4%(54/56)。文章结果表明,采用DNA池测序法筛选高信息量SNP标记是可行和可信的。     

中国荷斯坦牛CVM的基因检测及其与产奶性状的关联分析

脊椎畸形综合征(Complex vertebral malformation,CVM)是由位于牛第3号染色体(BTA3)的SLC35A3基因外显子4的一个单碱基突变(G559T)所致。该致病基因在世界许多国家的荷斯坦牛群中都有一定的比例。文章对北京地区38头优秀种公牛进行分析,发现了4头携带者,进而检测了这些携带者公牛的555头女儿的基因型,其中携带者占检测母牛数的44.0%。此外,关联分析结果表明,携带者母牛与非携带者母牛的生产性能之间存在显著差异(P0.01)。携带者母牛的5个产奶性状育种值均显著高于非携带者,泌乳持续力和体细胞评分SCS的育种值也比非携带者略高。CVM致病基因可能与BTA3上影响产奶性状的QTL或基因连锁。因此,建议生产中对CVM携带者进行逐步淘汰。