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VP1 gene of chicken anemia virus in liver of infected chicken from Harbin was amplified by polymerase chain reaction and cloned into pUC18The recombinant vector was identified by restriction digestionThree clones were sequenced with sequencing kit ABI PRISM by TaKaRa CoLtdThe open reading frame of the VP1 gene is made up of 1,350bpIt encodes 449 amino acid residuesIt was found that there is an abundant Arg region from position 3 to 46Its isoelectric point is up to 107 because of its abundant basic amino acidsComparing this Harbin isolate with 26p4,Cux-1,82-2,Del-rose,A2,Connb,L-028,TR20,CIA-1,CAV15,2A9 showed there were 168 nucleoside differences which lead to 26 amino acid changes of the VP1The amino acid changes may influence the antigenic character of different VP1sIt was also found that there is a hyper-mutation region from amino acids position 139-157,its mutation frequency is up to 42% among these CAV's VP1s.It is necessary to research the function of this region 相似文献
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鸡贫血病毒哈尔滨分离株全基因克隆和序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
通过PCR方法克隆了从哈尔滨分离的一株鸡贫血病毒(CAV)的全基因,并对其进行了测序,该病毒基因组为环状,全长2298bp,含有三个互相重叠的开放读码框和一个调控区。将克隆的基因与GenBank收录的CAV基因比较,同源性至少为97%,未发现与本次克隆的CAV基因完全一致的分离株。与德国分离株Cuxla、26p4和马来西亚分离株分别有42、42和72个核苷酸不同,同源性分别为98.2%、98.2%和96.9%。与德国分离株Cux1b相比,除在调控区内少一个类似增强子的重复序列外,尚有39处核苷酸不同。它与分离于欧洲的几株CAV的亲源性要比来自亚洲的马来西亚株近。对CAV哈尔滨分离株、26p4、Cux1b、Cux1a和马来西亚株的VP1、VP2和VP3蛋白比较,VP2的保守性最高。 相似文献
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从GenBank数据库中获得在我国分离的16株口蹄疫病毒全基因组序列,进而运用常规的系统发生方法分析了这16株病毒的同源重组情况,发现5株重组毒株.这些重组病毒主要来源于亚洲Ⅰ型(Asia1)和O型病毒间的重组.这些重组事件的鉴定也表明口蹄疫病毒间的交叉感染在我国比较常见.另外,在我国还出现了由于Asia1型和O型病毒重组后导致病毒血清型发生转化的现象.这些结果解释了我国口蹄疫病毒(FMDV)遗传多样性和抗原多变性的成因,提示了我国在口蹄疫预防、治疗方面所面临的复杂局面. 相似文献
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PPARδ启动子克隆及活性分析 总被引:1,自引:0,他引:1
过氧化物酶体活化的受体(peroxisome proliferator-activated receptors,PPARs)α、δ、γ是核受体超家族成员,它们是配体调节的转录因子,在脂类代谢过程中起非常重要的作用.PPARδ在骨骼肌中的表达分别要比PPARα和PPARγ高10倍和50倍,它的活化将导致骨骼肌细胞中有氧代谢相关的基因表达升高.为研究PPARδ在骨骼肌中的表达调节,克隆了PPARδ基因5′侧翼区2kb的DNA片段,体外实验证明该片段可以启动GFP表达.然后通过不同的限制酶消化获得不同长度的PPARδ启动子,经启动子活性实验分析发现,转录起始位点5′侧翼区上游179bp的片段就具有启动子活性.通过在线工具对2kb启动子上潜在的转录因子和结合位点进行分析,发现有4个肌细胞增强因子2(myocyte enhancer factor2,MEF2)潜在的结合位点,在MEF2A共转染实验中,发现随着MEF2A浓度升高,2kb的PPARδ启动子转录活性增强,表明MEF2A确实能提高PPARδ启动子活性.上述结果为研究PPARδ在肌肉中的表达调节和功能提供了依据. 相似文献
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