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一种高密度基因芯片的优化方法 总被引:1,自引:0,他引:1
基因芯片 (genechip) ,又称DNA微阵列(microarray) ,是分子生物学和微电子、微机械学科交叉的产物。基因芯片技术将生命科学研究中所涉及的许多不连续的分析过程 ,如探针制备、杂交反应和检测分析等 ,通过采用微电子、微机械等工艺集成到芯片中 ,使之连续化、集成化和微型化。这一技术的成熟和应用将在新世纪里给遗传研究、疾病诊断和治疗、新药发现和环境保护等生命科学相关领域带来一场革命。本文探讨高密度基因芯片的优化技术。1 高密度基因芯片高密度基因芯片是由大量DNA或寡核苷酸探针密集排列所形成的探针阵… 相似文献
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单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)在对复杂疾病遗传易感性以及基于群体基因识别等方面的研究中起着非常重要的作用,尤其是对复杂疾病遗传易感性的研究,需要对大量样本进行分型.为了满足这种要求,亟待需要发展一种操作简单、成本较低、适于自动化和高通量的分型技术.利用磁性颗粒"在位"固相PCR(insituMPs-PCR)扩增的靶序列,通过与野生、突变标签探针以及双色荧光(Cy3,Cy5)通用检测子杂交实现对样本的分型.应用该方法,对96个样本的亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因C677T位点的多态性进行了检测,其野生型和突变型样本的正错配信号比大于4.5,杂合型正错配信号比接近1,分型结果与测序结果一致. 相似文献
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生物信息学在基因芯片中的应用 总被引:14,自引:1,他引:13
生物信息学和基因芯片是生命科学研究领域中的两种新方法和新技术,生物信息学与基因芯片密切相关,生物信息学促进了基因芯片的研究与应用,而基因芯片则丰富了生物信息学的研究内容。本论文探讨生物信息学在基因芯片中的应用,将生物信息学方法运用到高密度基因芯片设计和芯片实验数据管理及分析。从信息学的角度提出基因芯片设计准则,提出寡核苷酸探针的优化设计方法,将该方法运用于再测序型芯片和基因表达型芯片的设计,在此基础上研制出高密度基因芯片设计软件系统和实验结果分析系统。 相似文献
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