秦岭细鳞鲑群体遗传结构

秦岭细鳞鲑（Brachymystax lenok tsinlingensis）是秦岭地区特有鱼类，近年来由于环境恶化及人类活动的加剧，已对其造成严重影响，种群处于濒危状态，因此研究秦岭细鳞鲑的群体遗传结构、演化历史、分布动态等对其进行有效保护具有重要意义。本研究用线粒体D-loop区序列对秦岭地区6个群体（n =112）进行了遗传结构和群体演化分析。D-loop区扩增出的891bp 序列在112个个体中，检测到42个变异位点，共26个单倍型；碱基序列总的单倍型多样度较高为0.883，核苷酸多样度为0.00799。AMOVA分析显示，60.05%的分子差异位于群体内，39.95%的分子差异位于群体间，F_st值统计检验表明，除那布大河群体与漳河群体和千河群体之间差异不显著之外，其余两两群体之间F_st值统计检验均为显著。系统树和单倍型网络图分析表明，6 个地理群体的单倍型按照渭河上游和渭河中游两个河段形成两个大的类群，且5个群体共享一个单倍型H2，表明这些群体具有相同的演化历史，为同一个祖先群体演化而来。中性检验和歧点分布显示，秦岭细鳞鲑种群大小保持相对稳定， 未经历明显的种群扩张。同时建议将渭河上游秦岭细鳞鲑群体作为一个整体进行重点保护。  

秦岭细鳞鲑人工繁育群体与野生群体遗传变异分析

研究利用线粒体DNA(细胞色素b基因序列和D-loop区序列)序列对秦岭细鳞鲑(Brachymystax lenok tsinlingensis)野生群体和人工繁育群体的种群遗传结构进行了分析。结果表明,在86个个体扩增出的线粒体D-loop区730 bp片段中,A+T含量(63.5%)明显高于G+C含量(36.5%)。Cyt b基因序列扩增1141 bp,A+T含量(52.8%)明显高于G+C含量(47.2%)。野生群体43个个体共检测到18个单倍型,繁育群体43个个体中共检测到24个单倍型,两个群体共享8个单倍型;秦岭细鳞鲑野生群体的单倍型多样性和核苷酸多样性(h=0.907±0.026;π=0.00287±0.00074)低于繁育群体(h=0.917±0.035;π=0.00349±0.00083),AMOVA分析显示,98.37%的分子差异位于群体内,1.63%的分子差异位于群体间,两群体之间的遗传分化水平较低(Fst=0.01631,P=0.1075;Nm=30.16)。采用邻接法构建的系统发育树和单倍型网络图分析表明,各群体内的个体不形成单系群,两者之间互有交叉。总之,秦岭细鳞鲑野生群体与繁育群体之间基因交流充分,未出现遗传分化。