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1.
应用DGGE法对青海相邻两盐湖中细菌多样性的快速检测   总被引:9,自引:0,他引:9  
分别对青海相邻两盐湖柯柯盐湖、茶卡盐湖土样、泥样进行富集培养后,从中提取的DNA用两套不同的细菌通用引物进行扩增,分别得到包含V8和V9高变区的16SrDNA片断。经变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析,结果显示这两个盐湖富集样品中细菌多样性具有较大的差异,而且同一盐湖不同性质样品中的细菌多样性差异也较大,两湖的泥样富集样品中均表现出了稍丰富的多样性。  相似文献
2.
云南腾冲热海两热泉菌藻席细菌多样性的研究   总被引:7,自引:1,他引:6       下载免费PDF全文
应用显微形态观察和变性梯度凝胶电泳(DGGE)对云南腾冲热海两热泉菌藻席的细菌多样性进行了比较分析.直接从环境样品中提取总DNA,用两套细菌通用引物进行PCR扩增,得到包含V8和V9高变区的16S rDNA片段,进行DGGE分析,结合形态观察,结果显示,热泉菌藻席中存在丰富的细菌多样性,且不同温度范围的菌藻席细菌组成差异显著.  相似文献
3.
高温环境样品总DNA直接和间接提取方法的比较   总被引:6,自引:0,他引:6       下载免费PDF全文
分别采用两种环境总DNA直接提取法和一种间接提取法从6种温泉菌席样品中提取总DNA,以DNA粗产物的纯度、能否用于后续PCR扩增及PCR-DGGE(变性梯度凝胶电泳)所反映的微生物多样性为评价指标对两类方法进行比较和评价。研究发现,虽然间接提取法效率低下,但对于高温极端环境中生物量较小的样品,间接法能得到有研究价值的、纯度较高的环境样品总DNA,而直接法得到的DNA量小且不适于PCR扩增操作。在使用这2类方法都能得到可用于研究操作的DNA的情况下,间接提取法能更好的体现环境样品中微生物的多样性。  相似文献
4.
腾冲热海眼镜泉粉红色菌藻席的细菌组成分析   总被引:3,自引:2,他引:1       下载免费PDF全文
应用免培养法系统研究眼镜泉粉红色菌藻席的细菌组成。经过克隆筛选,测定了23个克隆的16S rDNA插入片段的近全序列。与GenBank的序列进行比对和相似性分析,结果表明,组成该菌藻席的细菌分属于Proteobacteria、Firmicutes、Bacteroidetes、Actinobacter、Deinococcus-thermus、Aquificals 6个类群(phylum),表现出了高度的细菌多样性。结合分析温度相近的5个热泉:Octopus spring、Haegindi and Fluidir spring、Olkelduhals、Grendalur spring中的菌藻席细菌组成,表明生态位相近的不同环境中,其物种组成相近。Aquificales是中性或弱碱性高温热泉菌藻席群落的优势物种。  相似文献
5.
苝醌类化合物的杀线虫活性*   总被引:3,自引:0,他引:3       下载免费PDF全文
采用液体浸泡方法首次测定了菌寄生菌属Hypomyces sp.的次级代谢物苝醌类化合物竹红菌甲素和痂囊羟菌素对松材线虫的致病率。结果表明竹红菌甲素对松材线虫的半致病率为18小时50g/mL,痂囊羟菌素对松材线虫的半致病率为18小时15g/mL,对比(啊维菌素)对松材线虫的半致病率为18小时0.8g/mL。在红外光照射下竹红菌甲素和痂囊羟菌素具有良好的光敏杀伤松材线虫的作用。  相似文献
6.
云南腾冲热海三热泉细菌多样性的研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
应用变性梯度凝胶电泳(DGGE)对云南腾冲热海3个高温热泉中菌藻席和泉底沉积物的细菌多样性进行了初步研究。直接从环境样品中提取总DNA,用两套细菌通用引物进行PCR扩增,分别得到包含V8和V9高变区的16SrDNA片段,进行DGGE分析。结果表明:菌藻席和泉底沉积物中不仅物种组成差异较大,而且都存在丰富的细菌多样性;一些关键的生态因子,如氧气、温度等会对群落中微生物的物种组成有很大影响。  相似文献
7.
狮子头热泉菌席样品环境总DNA提取方法的比较研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
通过对狮子头热泉7个环境菌席样品所提取的总DNA进行纯度检测、提取得率计算和DGGE分析,比较了3种直接和1种间接DNA提取方法。结果表明:综合利用多种裂解方式比单一裂解方式更能充分释放环境DNA;其中3种方法获得的DNA片段能够进行后续16S rDNA扩增;针对同一样品,不同方法提取的环境DNA,可获得不同DGGE群落指纹图谱;间接提取法提取的总DNA,能更好地反映狮子头热泉菌席的微生物多样性。  相似文献
8.
运用纯培养法和基于16S rRNA基因序列的系统发育分析对云南省一平浪盐矿古老岩盐沉积中可培养细菌的多样性进行了研究。用补充0.5~3.5mol/L NaCl的MBA和ISP2琼脂培养基从卤水、岩盐和盐土样品中分离到38株细菌,用细菌通用引物进行16S rRNA基因扩增和序列测定,用相关软件进行序列相似性搜索、比对和系统发育分析。结果表明,38个分离菌株可分为31个物种,属于4个大的系统发育类群(Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes,Actinobacteria)、17个科、24个属。多数菌株属于Proteobacteria门(18株,47.3%;Gamma-Proteobacteria,31.5%;Alpha-Proteobacteria,15.8%)和Firmicutes门(13株,34.2%)。这些分离菌株中,至少有3个菌株可能代表3个不同属的3个新物种:Y3、Y15和Y25分别代表Idiomarina属、Salinicoccus属和Saccharospirillum属的新物种;而菌株Y21有可能代表Staphylococcaceae科的一个新属。从以上结果可以看出,一平浪盐矿古老岩盐沉积中存在较为丰富的微生物物种多样性和系统发育多样性,并且潜藏着新的微生物资源。  相似文献
9.
研究热泉水化学成分与菌藻席群落结构的关系。直接提取四种菌藻席(mat)总DNA,PER扩增获得16S rDNA的V8高变区片段,进行DGGE分析。结果:四种菌藻席的细菌组成差异很大,DGGE条带数目最低为20,最高为47;4种菌藻席共有的条带为1。结合文献报道的3个热泉的水化学性质分析,表明水化学成分是热泉生态系统中重要的生态因子,直接影响菌藻席的群落结构和物种组成。  相似文献
10.
对腾冲热海眼镜泉中粉红色丝状菌藻席进行ARDRA指纹图谱分析,获得其细菌多样性的部分信息。直接提取菌藻席总DNA,以之为模板PCR扩增出细菌的16S rDNA,将其克隆、转化进入大肠杆菌,获得120个克隆子。用限制性内切酶(RsaⅠ、HhaⅠ、HapⅡ)筛选出了29个16S rDNA插入片段酶切带型差异明显的克隆,表明眼镜泉菌藻席细菌组成丰富。聚类分析显示这29个克隆聚为A、B两个大类,表明该菌藻席可能主要由两个遗传多样性丰富的分类群组成。  相似文献
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