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基于454 GS FLX高通量测序的团头鲂ESTs中微卫星特征分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
微卫星或简单重复序列(Simple Sequence Repeat, SSR)广泛存在真核生物的基因组中,因其数量丰富、多态性高、共显性等特点[1], SSR标记被公认为目前遗传学研究中最令人信赖的分子标记之一,被广泛应用于动植物的遗传研究和育种实践中。其中,表达序列标签(Expressed Sequence Tag, EST)微卫星(EST-SSR)反映基因的编码部分,可以为功能基因提供绝对标记,充分反映基因组功能区域的相似程度。所以它在遗传作图、资源多样性、功能基因的发现与定位、物种起源与进化和比较基因组学研究等方面都有重要的利用价值。近年来,功能基因组学的发展促进了 EST 测序工作的开展,而新一代高通量测序技术更是为 EST 测序带来了革命性的变化。与传统的Sanger测序技术相比,新一代测序平台最大的变化是无需克隆这一繁琐的过程,而是使用接头进行高通量的并行PCR、测序反应,并结合微流体技术,利用高性能的计算机对大规模的测序数据进行拼接和分析,从而可获得大量的序列数据。  相似文献
2.
研究以线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)部分序列(614 bp)为分子标记,对捞刀河浏阳段河蚬Corbicula fluminea(n=40)的种群遗传多样性进行评价,并分别从性腺组织学和精子形态学两方面分析其生殖特征,以期丰富河蚬的繁殖生物学信息,为开展其人工繁殖及资源保护提供参考。结果显示,40条河蚬COⅠ基因序列共检出4种单倍型,17个变异位点,平均单倍型多样性、平均核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别为0.664±0.042、0.014±0.006和8.595。捞刀河浏阳段河蚬存在雌雄同体和雌雄异体2种性别系统,雌雄同体、雄性和雌性的性比约为6﹕3﹕1。雌雄同体个体生殖滤泡存在滤泡混合型和滤泡并存型2种类型。23个雌雄同体和8个雄性个体的精子均为双鞭毛。结果表明,捞刀河浏阳段河蚬种群的遗传多样性相对较低,生殖方式多样且以雄核生殖为主。  相似文献
3.
两栖动物性别决定类型和性染色体具有多样性的特点。在已发现异形性染色体两栖动物中,大部分物种Y或W染色体大于其对应的X或Z染色体,少数物种具有高度分化的Y或W染色体。同时两栖动物类群内基因组大小差异大,性染色体间分子水平上也存在差异。高频转换、偶然重组和染色体重排可能是两栖动物性染色体进化过程中的关键机制。本综述通过对两栖动物性染色体进化的深入探讨,揭示其遗传性别决定的机理,有助于对两栖动物性别人工调控的进一步探索。  相似文献
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