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1.
R-环是由一个RNA:DNA杂交体和一条单链状态的DNA分子共同组成的三链核酸结构。其中,RNA:DNA杂交体的形成起因于基因转录所合成的RNA分子不能与模板分开,或RNA分子重新与一段双链DNA分子中的一条链杂交。在基因转录过程中,当转录泡遇到富含 G 碱基的非模板链区或位于某些与人类疾病有关的三核苷酸卫星 DNA时,转录泡后方累积的负超螺旋可促进 R环形成。同时,新生 RNA分子未被及时加工、成熟或未被快速转运到细胞质等因素也会催生 R 环。研究表明,细胞拥有多种管理 R 环的方法,可以有效地管理R环的形成和处理已经形成的R环,以尽量避免R环对DNA复制、基因突变和同源重组产生不利影响。文章重点分析了R-环的形成机制及R环对DNA复制、基因突变和同源重组的影响,并针对R-环诱导的DNA复制在某些三核苷酸重复扩增有关的神经肌肉退行性疾病发生过程中的作用进行了分析和讨论。  相似文献
2.
目的:综合应用生物信息学技术,从分子水平对龋坏牙髓与正常牙髓的差异基因进行筛选分析,初步探讨其作用机制。方法:从GEO基因表达数据库中下载龋坏牙髓相关芯片数据集,采用MORPHEUS在线筛选差异表达基因,结合DAIVID、STRING等在线分析工具对差异表达基因进行GO功能富集分析及KEGG通路分析,后用Cytoscape软件构建蛋白质相互作用网络。结果:共筛选出375个差异表达基因,其中表达上调253个、下调122个,主要涉及免疫应答、炎症反应、细胞因子应答和生物矿化组织发育等生物过程,以及抗原加工提呈和NF-κB信号等生物通路。通过蛋白质互作网络构建分析发现,MMP9、IL-8、PTPRC、CXCR4等10个基因处于核心节点位置。结论:借助生物信息学方法能得到可靠的相关差异基因信息,能够有效指导进一步的研究。得到的差异基因可以作为龋病诊断的指示因子和机制研究的候选基因。  相似文献
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