基于最大熵模型预测气候变化下河蚬在中国的潜在分布

河蚬是一类在我国广泛分布的底栖贝类,具有重要的经济价值及生态价值。近年来,河蚬野生资源量锐减,了解河蚬在国内的潜在分布能为河蚬的保护和合理利用提供重要参考。基于河蚬在中国的136个分布点和8个环境因子,采用ENMeval包和biasfile优化后的最大熵模型(MaxEnt)预测分别河蚬现代和未来(2041—2060年和2081—2100年) 6个气候情景下的潜在分布。综合Jackknife检验、置换重要值和环境因子贡献率评估影响现代河蚬潜在分布的主要因子,比较未来气候情景下潜在适生区差异从而分析预测河蚬适宜分布的变化。结果表明：(1)优化后的MaxEnt模型预测准确度极高,平均AUC值为0.900±0.037,平均AUC_DIFF值为0.019,现代河蚬潜在分布区域总面积为188.33×10⁴ km²,主要集中在长江流域、海河流域、淮河流域、珠江流域、东南沿海区域以及黄河流域下游和渤海湾沿岸区域。(2)影响河蚬潜在分布的主要环境因子为海拔、温度(年均温和温度年较差)和降水(年降水量)。(3)在未来6种气候情景下,河蚬主要潜...     

沅江常德段蚬属贝类的谱系、倍性与性别特征

研究以沅江常德段蚬Corbicula为例, 采用线粒体COⅠ分子标记对其进行谱系构建, 梳理谱系与形态、倍性、性别和遗传多样性之间的关系, 以期为蚬属的系统分类和生殖特征研究提供理论参考。结果显示, 99条COⅠ序列(526 bp)中存在12个单倍型, 共有17个变异位点, 单倍型多样性、核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别为0.599、0.01236和6.503。12个单倍型在系统进化树中被聚为独立的两支(谱系RA和RlcB), 但谱系间壳长、壳高和壳宽没有显著差异(P>0.05)。99个样品中有二倍体50个、三倍体49个、 雌雄同体71个、 雌性21个、 雄性7个。卡方检验发现, 谱系与性别及倍性与性别之间均存在显著的相关性(P<0.05)。谱系RlcB的单倍型数、变异位点数、单倍型多样性、核苷酸多样和平均核苷酸变异数均高于谱系RA。结果表明, 虽然形态、倍性、性别和遗传多样性在谱系RA和RlcB蚬之间存在一定的差异, 但均不足以作为区分两个谱系的生物学特征, 而不同谱系是否为不同的种还有待于进一步的证实。     

基于454 GS FLX高通量测序的团头鲂ESTs中微卫星特征分析

微卫星或简单重复序列(Simple Sequence Repeat, SSR)广泛存在真核生物的基因组中,因其数量丰富、多态性高、共显性等特点[1], SSR标记被公认为目前遗传学研究中最令人信赖的分子标记之一,被广泛应用于动植物的遗传研究和育种实践中。其中,表达序列标签(Expressed Sequence Tag, EST)微卫星(EST-SSR)反映基因的编码部分,可以为功能基因提供绝对标记,充分反映基因组功能区域的相似程度。所以它在遗传作图、资源多样性、功能基因的发现与定位、物种起源与进化和比较基因组学研究等方面都有重要的利用价值。近年来,功能基因组学的发展促进了 EST 测序工作的开展,而新一代高通量测序技术更是为 EST 测序带来了革命性的变化。与传统的Sanger测序技术相比,新一代测序平台最大的变化是无需克隆这一繁琐的过程,而是使用接头进行高通量的并行PCR、测序反应,并结合微流体技术,利用高性能的计算机对大规模的测序数据进行拼接和分析,从而可获得大量的序列数据。     

捞刀河浏阳段河蚬的遗传多样性及生殖特征研究

研究以线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ) 部分序列(614 bp)为分子标记, 对捞刀河浏阳段河蚬Corbicula fluminea (n=40)的种群遗传多样性进行评价, 并分别从性腺组织学和精子形态学两方面分析其生殖特征, 以期丰富河蚬的繁殖生物学信息, 为开展其人工繁殖及资源保护提供参考。结果显示, 40条河蚬COⅠ基因序列共检出4种单倍型, 17个变异位点, 平均单倍型多样性、平均核苷酸多样性和平均核苷酸差异数分别为 0.664±0.042、0.014±0.006和8.595。捞刀河浏阳段河蚬存在雌雄同体和雌雄异体2种性别系统, 雌雄同体、雄性和雌性的性比约为6﹕3﹕1。雌雄同体个体生殖滤泡存在滤泡混合型和滤泡并存型2种类型。23个雌雄同体和8个雄性个体的精子均为双鞭毛。结果表明, 捞刀河浏阳段河蚬种群的遗传多样性相对较低, 生殖方式多样且以雄核生殖为主。     

两栖动物性染色体的多样性及其 进化机制的研究进展

两栖动物性别决定类型和性染色体具有多样性的特点。在已发现异形性染色体两栖动物中,大部分物种Y或W染色体大于其对应的X或Z染色体,少数物种具有高度分化的Y或W染色体。同时两栖动物类群内基因组大小差异大,性染色体间分子水平上也存在差异。高频转换、偶然重组和染色体重排可能是两栖动物性染色体进化过程中的关键机制。本综述通过对两栖动物性染色体进化的深入探讨,揭示其遗传性别决定的机理,有助于对两栖动物性别人工调控的进一步探索。     

蛋白质组氨酸磷酸化研究进展

摘要：蛋白质磷酸化是一种可逆的翻译后修饰,这种翻译后修饰可以改变蛋白质的构象,进而使蛋白质活化或者失活。组氨酸磷酸化在细胞信号传导过程中发挥着重要作用,且组氨酸磷酸化与人类某些疾病密切相关,然而,由于组氨酸磷酸化含有P-N键,具备不稳定性,有关于组氨酸磷酸化的报道远远少于其它磷酸化的报道。本综述系统的总结了组氨酸磷酸化在生物学过程中的作用,以及近些年取得的重要研究进展,以期对深入研究组氨酸磷酸化提供理论参考。