信息熵方法大批量分析成熟体及前体miRNA序列的重要位点

为了寻找miRNA连续序列上的位点保守性和碱基关联性的证据,本研究通过信息熵分析研究了一些已报告的miRNA和它们前体上的一些重要位点,根据miRNA的来源（动物、植物和病毒）和序列在miRNA前体上的位置（头部和尾部）,把得到的数据分为12组,然后通过计算单个碱基信息的冗余度（D1（L））和相邻碱基相关信息冗余（D2（L））的方法来分析这些数据,研究结果表明D2（L）比D1（L）含有更多的信息,尽管在各个组里面D1（L）和D2（L）值的变化基本呈正相关,病毒的前体miRNA比来源于动物和植物的前体miRNA在这些关键位点上更具有保守性,另外,和其他碱基相比,U在所研究的位点中占有很大比例,研究发现在一些组的中间位点（即Dicer酶在前体miRNAs上的剪切位点）十分保守,这个现象表明保守性在miRNAs的成熟过程中很重要,而且可能参与了Dicer酶的识别和剪切过程,以上这些结果从另外一个角度理解了miRNA前体的一级结构。     

大卫鼠耳蝠线粒体控制区串联重复序列变异

中国特有种大卫鼠耳蝠线粒体D-loop区串联重复序列以81bp为重复单元,重复3～7次。54%的个体具有4个串联重复序列,与5～7个串联重复序列的现有模式具有较大的差异。重复单元的遗传差异受所在位次影响,具有明显的家族性或区域性特点。串联重复序列和相对保守的第一重复单元构建的ML树均形成了3个明显的分支,分别定名为东南区、西南区和南方区。线粒体重复序列区域间的差异暗示其可能经历了多次进化,并以东南区变异最为显著。     

用于金刚石表面单分子有序固定的DNA折纸制备

近年来兴起的以金刚石氮-空位(NV)色心为量子传感器的微观磁共振技术得到快速发展,已经实现单个生物分子磁共振谱的探测,正在向单分子结构和功能的研究推进.这其中需要解决一个重要的技术问题,即单分子在金刚石表面的有序分散和固定. DNA的自组装为解决这一问题提供了可行途径,本文使用DNA折纸技术,制备了一种60 nm边长的正方形双层DNA折纸作为单分子载体,并与金刚石表面结合.首先采用双层结构提高了DNA折纸的稳定性,其次通过在DNA折纸边缘添加发卡结构减少了DNA折纸结构间的聚团,最终成功将DNA折纸装配到金刚石表面.通过原子力显微镜图像进行表征显示其结构完整、分散均匀.本工作为后续的单分子磁共振技术在单分子生物物理领域的应用推广奠定了样品制备的基础.