应用高通量测序技术对我国东海带鱼肠道菌群的研究

带鱼（Trichiurus spp.）是我国东海区重要的经济鱼类,通过研究分析我国东海带鱼肠道内容物的菌群结构,了解其所携带的自身特有的病原微生物情况。采集我国东海海域捕获的带鱼,提取肠道内容物DNA,采用Ion S5TM XL高通量测序平台和生物信息学分析方法,构建10个样本的16S rRNA V3-V4区基因测序文库。结果显示,10个样本共得到 1 221 个OTU（operational taxonomic unit）,分属28个菌门345个菌属。从门水平上看,柔膜菌门（Tenericutes）和变形菌门（Proteobacteria）丰度较高,分别为51.30%和29.58%;从属水平上看,支原体属（Mycoplasma）和弧菌属（Vibrio）占比较高,相对丰度分别为50.95%和13.79%。研究结果提示我国东海带鱼肠道内容物微生物菌群中支原体属含量可能较高,在食品加工过程中存在交叉污染的可能,相关生产过程需提高警惕并采取一定控制措施,同时为新病原的发现和防控提供了参考。