屯昌猪MYLPF基因序列分析及其组织表达量检测

为获得屯昌猪MYLPF基因的CDS区序列并分析其分子结构特征,研究屯昌猪、杜洛克猪以及其杂交F1代猪不同组织中的MYLPF mRNA表达水平,本研究以GenBank上公布的猪MYLPF基因序列(登录号:NM_001006592)为参考设计引物,通过RT-PCR扩增、测序获得屯昌猪MYLPF基因CDS区.结果显示:该基因CDS区长度510 bp,编码169个氨基酸,在CDS区存在33 G＞T的同义突变;该基因编码产物既没有跨膜结构,也不存在信号肽,属于非分泌型蛋白,主要在细胞质中发挥作用,预测存在1个潜在的糖基化位点和9个磷酸化位点,α螺旋区域在预测的二级结构中占比最大.荧光定量PCR检测结果显示MYLPF基因在屯昌猪背最长肌中表达量最高,屯昌猪背最长肌中MYLPF mRNA的表达量均显著高于杜洛克猪及其杂交F1代猪.本研究为探明MYLPF基因对猪肌内脂肪的影响提供了分子理论依据.     

五指山猪和长白猪背最长肌差异基因的筛选与注释

为了筛选五指山猪和长白猪背最长肌组织差异表达基因,本研究采用RNA-seq技术和生物信息学方法对6月龄、8月龄五指山猪和长白猪的背最长肌进行转录组测序分析,并对差异表达基因进行GO和KEGG Pathway显著性富集分析。通过与猪基因组比对分析后发现,在6月龄和8月龄五指山猪和长白猪均有约44 000 000条Clean reads能够比对到猪基因组上相关基因,每个文库均获得约18 200个表达基因,而转录本的数据为25 000个。在6月龄五指山猪与长白猪中共有30个基因差异表达,在8月龄五指山猪与长白猪中获得29个差异表达的基因。这些差异表达的基因主要富集在与糖酵解代谢、MAPK信号代谢通路和胰岛素信号通路等肌肉发育信号通路,通过筛选获得了与肌肉生长发育有关的候选基因,为探索五指山猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。     

粗纤维对定安鹅MSTN基因表达量及肌纤维发育的影响

为研究日粮粗纤维水平对生长中期定安鹅腿肌MSTN基因表达量及肌纤维发育的影响,选遗传背景相近、体重一致的30日龄定安鹅120只,采用单因子随机试验设计,共分3个处理组,每处理组设4个重复,每重复10只鹅.分别饲喂粗纤维水平为4.29％,5.29％和6.29％的三种日粮.试验期为35 d.结果表明:(1)日粮粗纤维水平为5.29％时,可以提高生长中期定安鹅试验末重和平均日增重,并且与6.29％组比较达到了显著水平(P＜0.05);(2)日粮粗纤维水平可以显著影响生长中期定安鹅腿肌中MSTN的基因表达量(P＜0.05),且腿肌中MSTN的基因表达量与生长中期定安鹅的试验末体重和平均日增重呈负相关关系;(3)日粮粗纤维水平为5.29％时,与6.29％组相比可显著提高生长中期定安鹅血清中IgA和IgG的含量(P＜0.05);(4)日粮粗纤维水平显著影响生长中期定安鹅腿肌纤维数量和腿肌纤维密度的影响(P＜0.05).综上所述,日粮粗纤维水平为5.29％可以显著影响生长中期定安鹅的试验末体重、平均日增重和腿肌中MSTN基因的表达水平,对腿肌纤维的发育也有一定的促进作用.