西藏拉萨拉鲁湿地生态系统服务功能价值估算

青藏高原是“世界屋脊”,也是我国及南亚、东南亚地区江河水系的主要水源区。该区分布有13.3×104km2的天然湿地,仅西藏自治区就有6×104km2的各种类型湿地。这些湿地对于维护青藏高原地区的生态功能,保证下游地区江河水生态安全具有重要的战略地位。但是由于许多湿地紧邻人类活动密集的城市地区,也被视为重要的城市建设土地后备资源,他们的开发与保护,长期以来一直存在着争议。以拉萨拉鲁湿地为例,对高寒草甸沼泽湿地的生态服务功能进行了定量估算。研究发现,拉鲁湿地生态系统每年的服务功能总价值达到5481万元,其中物质生产功能价值仅有315万元,占总生态服务功能价值的5.75%;如果将该湿地开发为城市建设用地,平均每年的增值也只有1391万元,仅为生态系统功能总价值的25.38%。可以看出,保护这些湿地的生态价值要远比直接开发的价值高得多,因此在西藏地区经济发展和城市扩张的过程中,必须从整个生态系统的角度出发,科学合理地保护和利用湿地资源。  

橡胶林固定CO2和释放O2的服务功能及其价值估计

橡胶树除生产橡胶和提供优质木材外，还有长期不为人们注意的生态服务功能。以中国的橡胶林为研究对象，采用标准标木生物量法，对橡胶林固定CO2和释放O2的生态服务功能及其价值估计进行了研究。结果表明中国橡胶林目前每年从大气中固定的CO2总量为411万t，所释放的O2为299万t。经分别采用C税法和工业制氧成本法估计了CO2和O2的价值达到1238亿元和12亿元。二者价值之和相当于中国橡胶林每年生产橡胶和提供木材等直接产品价值的28.7倍。橡胶林CO2的固定能力是热带山地雨林的4.7倍。50a来中国橡胶林已累计固定CO2达到11292万t，释放O2达8212万t，对短期内缓解大气的温室效应发挥了巨大的作用。  

Towards better accuracy for missing value estimation of epistatic miniarray profiling data by a novel ensemble approach

Epistatic miniarray profiling (E-MAP) is a powerful tool for analyzing gene functions and their biological relevance. However, E-MAP data suffers from large proportion of missing values, which often results in misleading and biased analysis results. It is urgent to develop effective missing value estimation methods for E-MAP. Although several independent algorithms can be applied to achieve this goal, their performance varies significantly on different datasets, indicating different algorithms having their own advantages and disadvantages. In this paper, we propose a novel ensemble approach EMDI based on the high-level diversity to impute missing values that consists of two global and four local base estimators. Experimental results on five E-MAP datasets show that EMDI outperforms all single base algorithms, demonstrating an appropriate combination providing complementarity among different methods. Comparison results between several fusion strategies also demonstrate that the proposed high-level diversity scheme is superior to others. EMDI is freely available at www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/EMDI/.  

基因组选择及其应用

品种选育在农业生产中占有十分重要的地位,育种值估计是品种选育的核心。随着遗传标记的发展,尤其是高通量的基因分型技术,使得从基因组水平估计育种值成为可能,即基因组选择。文章将基因组选择的方法分为两类:一是基于估计等位基因效应来预测基因组估计育种值(GEBV),如最小二乘法,随机回归-最佳线性无偏预测(RR-BLUP)、Bayes、主成分分析等方法;二是基于遗传关系矩阵来预测GEBV,通过采用高通量标记构建个体间的遗传关系矩阵,然后用线性混合模型来预测育种值,即GBLUP法,并以这两种分类简要介绍了基因组选择各种方法的大致原理。影响基因组选择准确性的因素主要有标记类型和密度、单倍型长度、参考群体大小和标记-数量性状基因座(QTL)连锁不平衡(LD)大小等;在基因组选择的各种方法中,一般说来Bayes方法和GBLUP方法具有较高的准确性,最小二乘法最差;GBLUP计算速度快,能够将标记和系谱结合起来,因而比其他方法更具优势。尽管基因组选择取得了很大进展,但在理论方面还面临着一些挑战,如联合育种、长期选择的遗传进展及如何解析与性状有关和无关的标记等。基因组选择在一些动植物育种上已经开始应用,在人类遗传倾向预测和进化动力学研究中也有潜在的应用前景。基因组选择在个体间亲缘关系的量化上有了突破,比传统方法更加精确,因此,基因组选择将会是动植物育种史上革命性的事件。  

羌塘地区草食性野生动物的生态服务价值评估——以藏羚羊为例

随着羌塘草原野生动物种群规模的扩大,草食性野生动物与家畜争夺草场的矛盾愈来愈突出.生态补偿无疑是解决这一矛盾的重要途径之一,而进行野生动物的生态服务价值评估是建立生态补偿标准的基础.通过羌塘地区社会经济资源环境现状调查和人群支付意愿调查,并采用直接市场法和虚拟市场法,对西藏自治区羌塘地区草食性野生动物藏羚羊的生态经济价值进行了评估.把藏羚羊的生态经济价值分为利用价值包括商业价值、游憩娱乐价值、维持生物多样性的价值、教育美学价值和科学研究价值,以及非利用价值包括存在价值、遗产价值、选择价值两大类.对野生动物生态价值的评估结果表明,羌塘地区藏羚羊的生态服务价值高达7.51亿元/a.其中,藏羚羊的利用价值为6.35亿元/a,非利用价值为1.16亿元/a.也就是说,羌塘地区15万只藏羚羊每年产生的生态服务价值远高于羌塘自然保护区涉及的6个县域2007年的总产值4.79亿元.