玉米SSR遗传图谱的构建及产量性状基因定位

利用中国农大培育的高产，多抗性玉米杂交组合农大3138的F2：3家系为材料，构建了具有80对SSR标记的玉米遗传图谱，标记间平均距离25．42，覆盖玉米基因组的2033.4cm，采用随机区组田间设计，考察了230个家系的穗长，秃尖长，穗粗，穗行数，千粒重，穗重，单株粒重，利用区间作图法分析了影响各性状的数量性状基因座位（QTL），共检测到30个QTLs，单个性状的QTLs为3－5个，QTLs解释变异量占总变异量的比例变化范围为9．5％－55．3％。  

开发SSR引物方法之研究动态Research Progress of Methods of SSR Primers Development

SSR标记是一种基于DNA长度多态性的分子标记技术，是进行群体遗传结构分析、构建遗传连锁图谱非常有效的工具。由于SSR标记是特异引物标记，必须在知道某个物种DNA序列的前提下，才能设计引物进行PCR扩增，故而存在一个引物开发的问题。从SSR标记的发展历程来看，开发SSR引物的方法有经典的构建与筛选基因组文库的方法、微卫星富集法、省略筛库法和数据库搜索法等四种。本文综述了这四种方法的操作流程及其在实际应用中的优缺点,并对近年来SSR引物在相近的物种间转移使用的情况作了介绍. Abstract: SSRs is one of molecular markers technology based on DNA length polymorphism and an efficient tool for population genetic studies and primary genetic linkage maps construction. Because of a special primer marker, It’s necessary to know a species DNA sequence in order to design primers for PCR testing. That is to say, there is a problem of SSR primer development. For the progress of SSR marker technology, the methods of developing SSR primer could be divided into four kinds: traditional constructing and screening genome library procedure, the SSR richment procedure, avoiding screening genome library procedure and database search procedure. This paper reviewed these four methods’operation processes and their advantages and disadvantages. In addition, transferability of SSR primers in closely related species were introduced in recent years.  

用SSR分子标记研究大豆属种间亲缘进化关系

利用SSR标记技术对大豆属11个种37份材料的遗传多样性进行分析，不同位点在种间的等位基因数为6－29，平均生个位点15．9个等位基因，Soja亚属的等位基因数是Glycine亚属的71．5％，并且Glycine亚属种间指纹 谱的差异大于Soja亚属种间的指纹图谱，SSR等位基因的主成分分析结果表明，大豆属中的Glycine亚属和Soja亚属的分类界限是比较明确的，利用第一主成分和第二主成分可较明显地区分开Glycine 亚属的分类界限是比较明显的，利用第一主成分和第二主成分可较明显地区分开Glycine亚属和Soja亚属，通过UPGMA方法构建了大豆属11个种的遗传进化关系，Soja亚属中G.max,G.soja和G.gracilis3个种在系统分化树上界限是比较明显的，由此看来这3个种是独立存在的。  

长江春大豆核心种质构建及分析

利用长江春大豆初选核心种质SSR(simple sequence repeat）标记和农艺性状表型等基础数据，对用不同个体取样方法以及不同数据类型建立的核心种质进行评价，目的是确定中国大豆（Glycine max）核心种质的最佳取样策略提供依据，结果表明，根据SSR分子数据聚类，采用类内随机取样，类内以遗传相似性系数取样以及仅依据遗传相似性系数取样都可用于大豆核心种质构建，但是综合不同评价参数发现，以类内随机取样最佳，类内按遗传相似性系数取样次之，单独以遗传相似性系数取样较差。分析不同SSR等位变异保留比例的遗传多样性指数发现，当保留90%和80%的SSR等位变异时，核心种质具有更高的遗传多样性，由于与SSR分子数据种质遗传关系评价的不一致性，农艺性状等基础数据虽然可用来构建核心种质，但其SSR分子水平代表性相对较低，本研究结果还表明，用不同方法或同一方法不同重复次数取样建立的核心种质具有异质性，且这种异质性随核心种质取样比例的降低而增大，因此，虽然可依据不同数据类型确定相应的方法建立核心种质，但综合表型和分子数据建立的核心种质更具有代表性。  

利用wx基因分子标记辅助选择培育糯性小麦

利用中国春及其缺体-四体对wx-B1基因的STS标记和wx-A1、wx-D1的微卫星(SSR)标记进行了定位.联合应用这2种分子标记,对12个小麦品种和5个高代糯麦株系做了鉴定,与Wx蛋白的SDS-PAGE结果一致;从组合江苏白火麦×关东107的F2分离群体中筛选出8种wx基因型,其中3种基因型(AD同缺型,BD同缺型和糯型)为自然界中所没有,并且培育出了国内首批糯性小麦品系.另外,应用SSR标记对江苏白火麦回交改良群体中个体进行辅助选择,得到了含wx-D1b的7D单体,为将来进一步改良糯性小麦的农艺性状提供广泛的遗传材料.利用wx基因分子标记辅助选择,可以加速培育糯性小麦的进程.  

用EST-SSR标记对茶树种质资源的研究

采用16对EST-SSR引物对42份茶树品种资源进行了分析。在这些引物中, 有13对可扩增出清晰条带, 其中10对引物具有多态性, 占76.9%。各多态性引物的PIC值变化范围为0.522~0.866, 平均PIC值为0.730。10对多态性引物共检测到84种等位基因型和74个等位变异, 每对引物可检测到基因型和等位基因数分别为4~12和3~10种。42份供试材料间遗传距离为0.074~0.667, 平均遗传距离为0.363, 说明本实验所测试的材料具有较广的遗传变异。在相似系数为0.55的水平可将这些材料聚为3类, 多数材料包含在第一类中。本研究表明, 利用EST-SSR标记进行茶树资源评价是有效的。  

利用SSR标记分析玉米轮回选择群体的遗传多样性

利用SSR标记技术分析了玉米基础群体DC0及其选择两轮后的群体HSC2和MSC2以及基础群体XFC0和其选择一轮后的群体XFC1的遗传多样性。结果表明：49对引物在5个玉米群体中共扩增出185个等位位点，每个SSR座位的等位基因数目为1～7个，平均为3．8个；基础群体多态性位点总数和多态性位点比例比其改良群体的略高；DC0、HSC2和MSC2 3个群体的基因平均杂合度相似，XFC0与XFC1的基因平均杂合度相似；基础群体与改良群体的平均遗传距离也相似；累加各引物扩增的基因型种类，改良群体的基因型种类偏少，但这些差异均不显著。以上结果说明轮回选择的基础群体与其改良后群体的遗传变异相似，轮回选择可以保持群体的遗传变异范围，改变群体的遗传组成，增加群体内个体间的异质性。  

荔枝SSR标记的研究

以无核荔枝A4号为实验材料，应用选择性扩增微卫星（SAM）法分离、克隆了100个简单序列重复（SSR）序列，其中88个非重复，可用。加上搜索数据库所获得的1个SSR序列，一共89个序列用于特异引物的设计。仅从71个序列的82个基因座设计出特异引物。合成41条特异引物(与5′锚定简并引物配对，个别相互配对)，对其中的39个基因座进行检测。其中15对引物扩增出相应大小的片段，另外11对引物扩增出非预期片段。最后，以37个荔枝种质的基因组DNA为模板，从26对出带的引物中，筛选出多态性引物21对，获得了22个荔枝基因座特异性SSR标记。  

从CIMMYT引进的人工合成六倍体小麦D染色体组微卫星分子标记的遗传差异

采用微卫星（SSR）分子标记技术，选用23个D染色体组特异性引的对来自CIMMYT的26份人工合成六倍体小麦D染色体组的遗传多样性进行了分析。研究发现，26份材料在D染色体组上存在丰富的等位基因变异（92个），平均每个基因座为4个。遗传距离计算结果也显示，26份材料D染色体组之间具有较大的遗传差异，平均遗传距离高达0．4955。因此，人工合成六倍体小麦D染色体组中存在丰富的遗传多样性，可以作为拓宽普通小麦遗传基础的新的遗传变异来源。研究还发现，由同一个粗山羊草基因型与不同硬粒小麦杂交合成的人工合成六倍体小麦（如合成种17和18）在所用检测的23个基因座中有3个存在差异，说明小麦在多倍化后，供体基因组在重复序列区域会发生遗传分化。  

大豆SSR技术研究进展

微卫星DNA是重复单位少于 6个核苷酸的简单重复序列。在大部分真核细胞的基因组中有着广泛分布 ,呈孟德尔式遗传。以此为基础发展起来的SSR标记是一种共显性分子标记 ,遗传多态性丰富。本文着重介绍近年来SSR技术应用在大豆遗传图谱构建、基因研究、品种鉴定和分子标记辅助育种等方面取得的进展 ,并初步预测该方法在大豆研究中的发展方向。