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1.
TF-1细胞凋亡相关基因的研究   总被引:14,自引:0,他引:14       下载免费PDF全文
利用近年来发展起来的代表差异分析(cDNA representational differences analysis, cDNA-RDA)技术研究了在人红白血病细胞株TF-1细胞撤除细胞因子后进入凋亡时诱导表达的基因.发现了6个新基因片段.其中有三个经与GenBank nr和dbEST查询均没有发现同源性,已经向GenBank进行登记,登记号分别为U83208,U83279,U83397.此外还发现一批已知基因的表达与凋亡相关,其中包括Hou和人硫氧还原蛋白等, 提示它们在凋亡中可能起作用.这项工作为进一步研究凋亡相关基因打下了良好基础.通过RDA的研究结果,有可能发现人白血病细胞凋亡的特异标记蛋白或发挥作用的重要蛋白,以期为白血病治疗提供理论基础.  相似文献
2.
分离差异表达基因的方法   总被引:10,自引:0,他引:10       下载免费PDF全文
了解不同细胞或同类细胞在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况,可以为研究生命活动过程提供重要信息。以差别筛选,扣除杂交等基本方法为出发点,研究基因表达差异的方法不断完善,先后出现了DDRT-PCR,RDA,SSH,cDNA微阵列(基因芯片)等技术。这里着重对这些方法的优缺点及改进进行了论述和评介,并对技术的发展趋势进行了分析。  相似文献
3.
 采用cDNA代表性差异分析 (RDA)技术 ,对盐藻在盐胁迫时差异表达的基因进行了分离鉴定 .在分离到的 10个基因中 ,有 5个与已知基因同源 (包括叶绿素a b结合蛋白基因、蛋白磷酸酶I催化亚基基因和 3个核糖体蛋白基因 ) ,还有 5个未知功能基因则是首次在盐藻中被分离 .值得注意的是 ,所有这 5个已知基因的功能都与细胞分裂或盐胁迫有关 .结果表明 :取样时盐藻细胞仍处于恢复阶段 ,所分离到的基因对于盐藻耐盐可能具有重要意义 ;蛋白磷酸酶I的下调表达可能是盐藻调节离子平衡的一个重要过程和细胞分裂受阻的原因所在 ;盐藻减缓细胞分裂速度可能是为了减少能量消耗 ,以留出足够的能量来应对盐胁迫 ;其它 5个未知基因可能也与盐藻适应盐胁迫机制有关 .  相似文献
4.
Soil chemical properties for a subtropical rain forest in the Nanjenshan Reserve, southern Taiwan, were examined to determine soil-landscape and soil-vegetation relationships. Soil sampling sites were separated into four groups based on landscape features and exposure to the prevailing northeasterly monsoon winds. Corresponding vegetation types were delimited along the first DCA axis. The forest showed a drastic change both in structure and floristic composition along the wind-stress gradient. Redundancy analysis (RDA) showed that both topographic variables and vegetation types were needed to explain the variation in soil data. Soil properties that differed significantly among landforms were pH, available N, CEC, exchangeable Al, K, Ca and Mg. Levels of pH, exchangeable Ca and Mg increased in a downslope direction, and exchangeable Al tended to be higher in the upper slope soils. These trends pointed to the importance of slope processes in redistribution of soil minerals. The main differences in soil properties attributed to the influence of the occupying vegetation were apparently aspect dependent. The contents of available N, exchangeable K, and CEC in the 0–40 cm depth of soils under windward low-stature (mostly sclerophyllous) forest were consistently lower compared to those under the leeward forest. For a given catena, however, soil variability associated with vegetation differences seemed to be confounded by the slope processes.  相似文献
5.
开放的差异基因表达技术研究进展   总被引:6,自引:2,他引:4       下载免费PDF全文
 自 90年代早期发展以来 ,差异基因表达 (DGE)技术在许多领域得到了应用 .“开放”结构系统的DGE技术不需原始的生物学或序列信息 ,而且可应用于任何种群 .主要介绍 6项开放的DGE技术 :cDNA代表性差示分析 (cDNA RDA)、基因表达系统分析 (SAGE)、表达序列标签串联排列连接(TALEST) ,和早期的DGE技术差异显示 (DD)、随机引物聚合酶链反应 (AP PCR) ,以及一项受专利保护的技术———GeneCalling .通过几项重要的参数对这些技术进行了比较 ,认为DD虽然有其致命的弱点 ,但在目前仍然应用得非常广泛 .cDNA RDA能有效富增特异片段 ,扣除共有序列 ,如能和SAGE结合 ,将能进一步促进其发展 .TALEST和GeneCalling操作较简便 ,一次试验能获得大量的数据 ,但是分析这些数据比较麻烦 ,须借助另外的分析软件 .最后介绍了应用DGE技术取得的最新成果 .  相似文献
6.
By means of cDNA-RDA method. some cDNA fragments were found to have high levels of expression during deprivation of GM-CSF (granulocyte macrophage-colony stimulating factor) in a human myeloid cell line, TF-1 cells. One of these tragments was identified as a novel gene. To get the full length of cDNA, rapid amplification of cDNA ends (RACE) and expressed sequence tags (EST) overlapping fragments assembling strategies were used. The novel gene was named TRAF15 (TF-1 cell apoptosis related gene-15), which consists of 1218 nueleotides and encodes 212 amino acids. The putative protein protein product of TFAR15 is partially homologous to C. elegans protein C14A4. 11. TFAR15 mRNA is expressed in fetal liver, kidney, spleen and lung. and also in some human myeloid cell lines. Both of the TFAR15 mRNA and protein were highly expressed in TF-(?) cells after GM-CSF withdrawal. In vitro analysis showed that the recombinant TFAR15 protein co(?)ld inhibit the natural cell death of 293 cells, an embryonic kidney cell  相似文献
7.
Molecular cloning of GA-suppressed G2 pea genes by cDNA RDA   总被引:5,自引:0,他引:5       下载免费PDF全文
GA-treated and non-treated G2 pea cDNAs were compared using a newly developed method called cDNA representational difference analysis (cDNA-RDA), and several GA-suppressed mRNAs were found. After cloning of the larger fragments PGAS1-3 ( pea GA-suppressed cDNA 1-3), they were demonstrated to be expressed only in pea tissue not treated with GA3 through Northern analysis. Compared with subtractive hybridization and differ-ential display techniques, this method not only can be easily manipulated but also has a relatively low rate of false posi-tive and is highly repetitive. It is the major progress in molecular cloning techniques.  相似文献
8.
9.
采用冗余分析法对弃耕一年稻田湿地生态系统的植物群落与土壤因子进行了分析.结果表明:在亚热带湿地生态系统中,土壤水分条件、有效钾、有效磷和pH是影响物种分布的最主要土壤因子.试验区的主要植物物种可以划分为3个物种组:丁香蓼-水竹叶物种组(组1)、牛鞭草-圆叶节节菜-稻槎菜物种组(组2)和小白酒草-辣蓼-双穗雀稗物种组(组3).其中,组1主要分布于土壤有效钾含量较高的区域;组2主要分布于阶段性淹水区域;组3主要分布于排水区域,且与土壤有效磷和pH呈正相关.物种多样性与土壤pH、植被地上生物量与土壤全钾含量呈显著正相关,均匀度与土壤有效氮含量呈显著负相关,与其他指标的相关性均不显著.  相似文献
10.
筛选差异表达基因方法的新进展   总被引:3,自引:0,他引:3  
了解不同细胞或同类细胞在不同发育阶段、不同生理状态下的基因表达状况,可以为研究生命活动过程提供重要信息。以差别筛选、削减杂交等基本方法为出发点,研究基因表达差异的方法不断完善,先后出现了DDRT—PCR、RDA、SSH、cDNA微阵列(基因芯片)、基因表达的系统分析(SAGE)等技术。本着重对这些方法的优缺点及改进进行论述和评介,并对技术的发展趋势进行了分析。  相似文献
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