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1.
微生物生态学研究方法进展   总被引:38,自引:6,他引:32       下载免费PDF全文
微生物培养及显微技术作为鉴定微生物种群的手段有很大的局限性,因为环境中大多数微生物处于“存活但不能培养”的状态。因此.不依赖于微生物培养的生物化学以及分子生物学方法正被广泛地用于微生物生态学研究。主要介绍了荧光技术。基于PCR的分析技术和PLFA等技术在表征微生物多样性研究中的某些进展。  相似文献
2.
3.
齐鸿雁  薛凯  张洪勋 《生态学报》2003,23(8):1576-1582
应用磷脂脂肪酸谱图分析技术对微生物群落进行定量分布,克服了传统的微生物培养方法和显微技术的局限性。介绍了磷脂脂肪酸谱图分析方法及其在微生物生态学领域中的应用,包括对微生物群落的生物量、群落结构、营养状况和新陈代谢活动等方面的研究。  相似文献
4.
磷脂脂肪酸方法在土壤微生物分析中的应用*   总被引:19,自引:0,他引:19       下载免费PDF全文
王曙光  侯彦林   《微生物学通报》2004,31(1):114-117
磷脂脂肪酸(PLYA)是活体微生物细胞膜的重要组分,不同类群的微生物能通过不同的生化途径合成不同的PLFA,部分PLFA可以作为分析微生物量和微生物群落结构等变化的生物标记。在土壤微生物分析中,越来越多地采用了PLFA方法。主要对PLFA方法在土壤微生物分析中的应用做一综述。  相似文献
5.
土壤微生物群落磷脂脂肪酸PLFA生物标记多样性   总被引:12,自引:0,他引:12       下载免费PDF全文
磷脂脂肪酸(PLFA)生物标记法是一种可定性和定量分析土壤中微生物群落多样性的方法.研究以烟田土壤为例,应用生态学评价方法,即丰富度 (S)、均匀度(J)、Simpson优势度(D)、Shannon-Wiener(H1)、Brillouin(H2)和McIntosh(H3)多样性指数等测度方法,分析土壤中微生物群落PLFAs生物标记的多样性.研究结果表明,供试土壤微生物群落中,先后出现了43种PLFAs,将其聚类分析,可以将所获得的PLFAs分成五大类:第Ⅰ类为高含量、高频次和多样性,PLFA为18:1ω9c的真菌生物标记;第Ⅱ类为高含量、高频次和多样性,PLFA为16:0的假单胞菌生物标记;第Ⅲ类为高含量、高频次,多样性中等,PLFA为16:1ω5c的甲烷氧化菌生物标记;第Ⅳ类为中等含量,频次较高,多样性中等,含有表征好氧菌的i15:0、a15:0、i16:0和a17:0的PLFA,还有表征厌氧菌的18:1ω7c以及硫酸盐还原菌的16:0 10Me;第Ⅴ类为低含量,低频次和多样性,其特征生物标记有表征好氧菌的I 15:0 3OH、15:1 I G、a16:0、i16:1 G、i16:1 H、17:0、i17:0、15:0 2OH、15:0 3OH、17:0和17:0 2OH的PLFAs,存在有表征真菌的18:3ω6c (6,9,12)、放线菌的17:0 10Me和18:0 10Me以及表征原生动物的20:4ω6,9,12,15c.说明供试土壤中能够起主导作用的功能菌依次是真菌、假单胞菌、甲烷氧化菌和部分的好氧菌、厌氧菌及硫酸盐还原菌,将为合理调节土壤微生态系统提供指导,是一种可行的评价土壤微生物群落多样性的新方法.  相似文献
6.
陈承利  廖敏  曾路生 《生态学报》2006,26(10):3404-3412
土壤微生物在促进土壤质量和植物健康方面发挥着重要的作用,土壤微生物群落结构和组成的多样性及其变化在一定程度上反映了土壤质量.为了更好地了解土壤健康状况,非常有必要发展有效的方法来研究污染土壤微生物的多样性、分布以及行为等.回顾了近年来国内外污染土壤微生物群落结构多样性及功能多样性的测定方法,包括生物化学技术和分子生物学技术,现将它们的原理、优缺点、实用性及其发展动态作一阐述,同时指出结合这两种技术可为微生物群落分析提供一个更全面的、精确的方法.  相似文献
7.
磷脂脂肪酸分析方法在微生物生态学中的应用   总被引:10,自引:0,他引:10  
磷脂脂肪酸分析方法(PLFA)是基于生物化学手段的一种微生物生态学研究新技术,它具有对细胞生理活性没有特殊的要求,对样品保存时间也要求不高等优点,由样品中所有微生物提供信息,是一种快捷、可靠的分析方法。本文介绍了PLFA在微生物生态学研究中的应用,主要包括对微生物群落生物量、群落结构和功能及其变化,指示特定微生物以及营养状况方面的研究。  相似文献
8.
In order to achieve sustainability in managed ecosystems we must understand management impacts on soil processes and clarify the regulatory role of the microbial community on these processes. Crop rotation and organic management practices are thought to have positive impacts on the microbial biomass; however, the specific impacts of crop rotation organic management on soil microbial ecology are largely unknown. The effect of organic management on soil microbial ecology was investigated using soils collected from the Rodale Institute Research Center's long-term Farming Systems Trial (FST) experiment. The FST, begun in 1981, included a manured and a cover cropped organic rotation and a conventionally managed grain based rotation. Soil respiration rates and13C-isotope fate in a companion study suggest that the biomass characteristics of the FST treatment soils were different in November 1991. However, direct measurement of the microbial community at this time using Phospholipid Fatty Acid Analysis (PLFA) did not identify statistically significant treatment based differences in soil biomass characteristics. Variability among the PLFA profiles of treatment replicates was as great as variability between farming systems. Treatment based trends were observed among selected PLFAs, particularly those present in large amounts, that were consistent with indirect biomass and biomass-dependent measures. Overall, PLFA profiles, soil respiration rates and13C-cycling suggested that the organic cover cropped soil had the Largest and most heterogeneous microbial population while the biomass of the organic-manure amended soil was the least heterogeneous, and the most metabolically active. Present address: University of Illinois, 11025. Goodwin ave. Urbana, IL 61801, USA  相似文献
9.
尿素肥斑扩散对土壤微生物群落结构的影响   总被引:7,自引:0,他引:7       下载免费PDF全文
王曙光  侯彦林 《生态学报》2004,24(10):2269-2274
磷脂脂肪酸 (PL FA)被认为是有效指示活体土壤微生物群落结构变化的标记物之一 ,该方法已在土壤微生物的研究中被大量应用。采用特制容器 ,模拟尿素肥斑在土壤中的扩散行为 ,观察距尿素肥斑不同距离微域中养分形态和浓度变化及其对土壤微生物群落结构的影响。试验结果表明 ,培养 7d后 ,No.7(距肥斑 7cm)和 No.8(距肥斑 8cm )微域的 NH 4、NO- 2 、NO- 3浓度最高 ,NO- 2 是尿素扩散区域的主要离子存在形态。对提取到的 2 5种 PL FA进行主成分分析 (PCA) ,发现 PL FA组成随不同微域养分浓度变化而变化 ,说明微生物群落结构发生了改变。就标记性 PL FA而言 ,尿素扩散导致真菌 PL FA在高浓度养分微域浓度增加 ,细菌 PL FA浓度下降 ,其中 ,No.7微域的真菌 PL FA18∶ 2ω6 ,9和 PL FA18∶ 1ω9浓度分别比对照 (No.2 0微域 )增加 173%和 4 7.2 %。然而 ,放线菌 PL FA 10 Me18∶ 0浓度变化不大  相似文献
10.
Root controls on soil microbial community structure in forest soils   总被引:7,自引:0,他引:7  
Brant JB  Myrold DD  Sulzman EW 《Oecologia》2006,148(4):650-659
We assessed microbial community composition as a function of altered above- and belowground inputs to soil in forest ecosystems of Oregon, Pennsylvania, and Hungary as part of a larger Detritus Input and Removal Treatment (DIRT) experiment. DIRT plots, which include root trenching, aboveground litter exclusion, and doubling of litter inputs, have been established in forested ecosystems in the US and Europe that vary with respect to dominant tree species, soil C content, N deposition rate, and soil type. This study used phospholipid fatty-acid (PLFA) analysis to examine changes in the soil microbial community size and composition in the mineral soil (0–10 cm) as a result of the DIRT treatments. At all sites, the PLFA profiles from the plots without roots were significantly different from all other treatments. PLFA analysis showed that the rootless plots generally contained larger quantities of actinomycete biomarkers and lower amounts of fungal biomarkers. At one of the sites in an old-growth coniferous forest, seasonal changes in PLFA profiles were also examined. Seasonal differences in soil microbial community composition were greater than treatment differences. Throughout the year, treatments without roots continued to have a different microbial community composition than the treatments with roots, although the specific PLFA biomarkers responsible for these differences varied by season. These data provide direct evidence that root C inputs exert a large control on microbial community composition in the three forested ecosystems studied.  相似文献
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