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1.
荠菜LEAFY同源基因的克隆与进化分析   总被引:2,自引:0,他引:2       下载免费PDF全文
LEAFY同源基因是高等植物花的分生组织分化的重要调节基因。根据已发表的LEAFY同源基因序列保守区设计引物,以荠菜(Capsellabursa-pastoris(L.)Medic.)基因组DNA序列为模板,克隆了一条长2866bp的LEAFY同源基因。序列分析表明,该基因含有3个外显子和2个内含子,外显子编码424个氨基酸组成的多肽。其单个外显子核苷酸序列与拟南芥(Arabidopsisthaliana)LEAFY基因同源性在90%以上,氨基酸序列同源性为86%,而与琴叶拟南芥(Ara-bidopsislyrata)的氨基酸序列同源性高达90%。不同植物物种的LEAFY同源氨基酸序列在C端高度保守,而N端则有较大程度的变异。3个外显子进化速率不同可能是由于所受选择压力不同所致。存在于荠菜CapLFY基因346位上的精氨酸突变可能是造成荠菜两种生态型花期不同的原因。  相似文献
2.
判定直系同源关系的进化分析方法   总被引:1,自引:0,他引:1  
如何正确判定基因之间的直系同源 (ortholog)和旁系同源 (paralog)关系 ,仍是基因组功能诠释和比较基因组学中有待更好解决的关键问题。在以前的工作中 ,曾用进化分析方法解决多基因家族的直系 /旁系同源关系的判定问题 ,现进而完整地展开判定直系同源关系的进化分析方法。从 44个同源蛋白质家族的案例观察表明 ,与流行的COG方法 (直系同源蛋白质的聚类 )比较 ,本方法能一般的判定直系同源关系以及能准确的诠释基因组的分子功能  相似文献
3.
内含子在生物信息学研究和基因工程中的应用   总被引:1,自引:0,他引:1  
内含子在真核生物基因组中广泛存在。已有的研究虽揭示出内含子对基因的表达有着重要的调节作用,并参与了基因的进化,但内含子的功能还远没有弄清楚,对其本身的起源与演化问题也还存在很大争论。尽管如此,目前内含子在生物信息学研究和基因工程中的应用已蓬勃展开。本文就人们目前对内含子的基因组分析、分子进化与分子系统分析研究以及内含子在转基因工程中的应用作一概述。  相似文献
4.
5.
In this paper we report on the molecular cloning, sequencing and partially characterisation of a lectin from bulb of the Chinese medicinal plant Zephyranthes grandiflora. The full-length cDNA of Z. grandiflora bulb lectin (ZGBL) consisted of 986 bp and contained a 576 bp ORF encoding a 191 amino acid protein. Bioinformatics analysis results clearly indicate that ZGBL belongs to the monocot mannose-binding lectin family, which contains 3 putative mannose-binding sites per subunit. RT-PCR analysis results indicate that ZGBL is constitutively expressed in all the tested tissue types including root, bulb, leaf and flower. Interestingly, ZGBL is more closely related to the Orchidaceae rather than the Amaryllidaceae family on molecular evolution.  相似文献
6.
The genes were cloned for the two apoprotein subunits, and ,of phycocyanin from the cyanobacterium Spirulina maxima = Arthrospiramaxima) strain F3. The - and -subunit gene-coding regionscontain 489 bp and 519 bp, respectively. The -subunit gene is upstreamfrom the -subunit gene, with a 111-bp segment separating them.Similarities between the -subunits of S. maxima and nine othercyanobacteria were between 58% and 99%, as were those between the -subunits. The maximum similarity between the - and -subunits from S. maxima was 27%.  相似文献
7.
The genes were cloned for the two apoprotein subunits, and, of phycocyanin from the cyanobacterium Spirulina maxima(=Arthrospira maxima) strain F3. The - and -subunitgene-coding regions contain 489 bp and 519 bp,respectively. The -subunit gene is upstream from the -subunitgene,with a 111 -bp segment separating them. Similarities between the-subunits of S. maxima and seven othercyanobacteriawere between 63% and 99%, as were those between the -subunits. Themaximumsimilarity between the - and -subunits from S.maxima was 27%.  相似文献
8.
选取竹亚科中两个超族、六个族和三个亚族的10个竹种为材料,分别是泰竹、凤尾竹、青皮竹、大叶慈、慈竹、野龙竹、毛竹、香竹、苦竹、菲白竹,分离克隆了它们的lea3基因,并将它们与外类群物种水稻进行序列比对和进化分析。结果发现在分支模型与分支位点模型的检测中,不同竹种所含lea3基因承受了不同的正选择压力,清除选择作用在lea3基因编码区中占主导地位(ω<1)。在位点模型的检测中,共检测出了18个显著性正选择位点,占总氨基酸数目的111%。对这18个显著性正选择位点进行定位后,发现其中的15个位于11个氨基酸串联重复序列附近。这说明lea3基因中的11个氨基酸串联重复序列区比基因其它区域更容易受自然选择作用影响。同时,在位点模型检测结果的基础上,通过对强烈清除选择位点的定位,发现在11个氨基酸串联重复序列区内存在一长段无强烈清除位点的序列区。  相似文献
9.
多肽激素类基因是对植物生长发育起重要作用的一类基因,RALF 是其中的重要一员,而十字花科在中国蔬菜作物中是重要的一大类群。为了摸清十字花科多种蔬菜作物的 RALF 同源基因信息,该文根据前期研究从油菜中扩增到的多肽激素类基因 RALFbn 的序列设计引物,从提取的十字花科芸薹属、萝卜属、蔊菜属、山芥属的7份重要蔬菜作物的基因组 DNA 中分别克隆到了 RALF 的同源序列。结果表明:7种蔬菜作物的 RALF 同源基因编码区均在300 bp 左右,且无内含子,编码的蛋白质由79个氨基酸组成,说明 RALF在十字花科4个属内的保守性较强;对 RALF 同源基因在十字花科4个属中的表达分析表明,该类基因在根、茎、叶、花序轴等营养器官中不表达或弱表达,但主要在生殖器官中表达,其中在总花蕾和开放花中的表达量普遍高于嫩角果中的表达量,表明该类基因在十字花科中的生理活跃期是花发育时期。同时,构建了十字花科4个属中 RALF 同源基因的系统树,芸薹属的油菜、甘蓝和芥蓝形成一个分支,而茎瘤芥和分蘖芥形成另外一个分支,且与萝卜属、山芥属、蔊菜属的材料聚在一支,该基因的进化途径在一定程度上也反映出这几种作物的遗传背景关系。该研究结果丰富了 RALF 家族信息,增添了十字花科植物的分子进化数据。  相似文献
10.
Oct4 is one of the key pluripotent factors essential for embryonic stem cells and induced pluripotent stem (iPS) cells.Oct4 belongs to the POU domain family,which contains multiples genes with various ...  相似文献
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