免疫细胞浸润在非小细胞肺癌诊断与预后中的应用

免疫细胞浸润对癌症的诊断与预后有着重要意义。文中收集TCGA数据库已收录的非小细胞肺癌肿瘤与正常组织基因表达数据,利用CIBERSORT工具得到22种免疫细胞占比来评估免疫细胞浸润情况。以22种免疫细胞占比为特征,用机器学习方法构建了非小细胞肺癌肿瘤与正常组织的分类模型,其中随机森林方法构建的模型分类效果AUC=0.987、敏感性0.98及特异性0.84。并且用随机森林方法构建的肺腺癌和肺鳞癌肿瘤组织分类模型效果AUC=0.827、敏感性0.75及特异性0.77。用LASSO回归筛选22种免疫细胞特征,保留8种强相关特征组成的免疫细胞评分结合临床特征构建了非小细胞肺癌预后模型。经评估及验证,预后模型C-index=0.71并且3年和5年的校准曲线拟合良好,可以对预后风险度进行准确预测。本研究基于免疫细胞浸润所构建的分类模型与预后模型,旨在对非小细胞肺癌的诊断与预后研究提供新的策略。     

探访保德

保德是山西省西北角的一个县，位于黄河晋陕峡谷北端的东岸、黄土高原的腹地。在古生物学上，保德是中国新近纪最名的一个哺乳动物化石地点。1914年，曾担任瑞典地质调查局局长的安德生博士来到中国，并被聘为中国政府的矿业顾问和中国地质调查局博物馆馆长。1919年，安德生的两位     

Canopy closure estimation in a temperate forest using airborne LiDAR and LANDSAT ETM+ data

Aims　Forest canopy closure is one of the essential factors in forest survey, and plays an important role in forest ecosystem management. It is of great significance to study how to apply LiDAR (light detection and ranging) data efficiently in remote sensing estimation of forest canopy closure. LiDAR can be used to obtain data fast and accurately and therefore be used as training and validation data to estimate forest canopy closure in large spatial scale. It can compensate for the insufficiency (e.g. labor-intensive, time-consuming) of conventional ground survey, and provide foundations to forest inventory.Methods　In this study, we estimated canopy closure of a temperate forest in Genhe forest of Da Hinggan Ling area, Nei Mongol, China, using LiDAR and LANDSAT ETM+ data. Firstly, we calculated the canopy closure from ALS (Airborne Laser Scanning) high density point cloud data. Then, the estimated canopy closure from ALS data was used as training and validation data to modeling and inversion from eight vegetation indices computed from LANDSAT ETM+ data. Three approaches, multi-variable stepwise regression (MSR), random forest (RF) and Cubist, were developed and tested to estimate canopy closure from these vegetation indices, respectively.Important findings The validation results showed that the Cubist model yielded the highest accuracy compared to the other two models (determination coefficient (R²) = 0.722, root mean square error (RMSE) = 0.126, relative root mean square error (rRMSE) = 0.209, estimation accuracy (EA) = 79.883%). The combination of LiDAR data and LANDSAT ETM+ showed great potential to accurately estimate the canopy closure of the temperate forest. However, the model prediction capability needs to be further improved in order to be applied in larger spatial scale. More independent variables from other remotely sensed datasets, e.g. topographic data, texture information from high-resolution imagery, should be added into the model. These variables can help to reduce the influence of optical image, vegetation indices, terrain and shadow and so on. Moreover, the accuracy of the LiDAR-derived canopy closure needs to be further validated in future studies.     

古脊椎动物学报 第54卷 2016年 总目次

正~~     

华裔科学家研究新型免疫疗法？有望两年内攻克癌症

据英国《每日电讯报》9月20日报道，美国维克森林大学医学院的崔征博士近日在剑桥大学举行的抗衰老会议上公布了他在免疫细胞研究方面的新发现。即在不同人身上提取的免疫细胞在抗癌方面的能力大不相同，疗效可以相差近50倍。[第一段]     

化石猎人与恐龙研究历史(下)

客观的说，在上世纪初至第二次世界大战之间，有关恐龙的科学没有出现富有意义的进展。多数的时间都被用来分析研究在“恐龙热潮”中所发现的恐龙化石。在此期间仍不断有新的发现。例如，1902年在蒙大拿发现了赫赫有名的霸王龙。在1900年到1945年之间无论有怎样的新观点提出，都要归功于两次大规模的古生物考察活动。     

扶绥观龙

姚锦仙欢快地走过时直时弯的田埂，嘴里还轻轻地哼着那首曾经风靡大陆的台湾校园歌曲“赤足走在窄窄的田埂上，听着脚步劈啪劈啪响……”。跟在后面的老师潘石似乎受到了学生的感染，也不知不觉地唱出“遥远的东方有一条龙……”/作向导的县旅游局长施家强被这一老一少逗乐了，打趣道：“别太高兴咯．一会儿见着‘真龙’你们俩可别表演‘叶公好龙’哟。”     

常用的找矿方法

无论是煤炭、石油、天然气等化石燃料,还是金银铜铁锡等金属矿,都深埋于地下。若要开发,人们必须首先圈定矿产资源的分布位置。在长期的实践活动中,人们已经总结了十分丰富的找矿经验,并形成了独立、