植物基因组表达序列标签(EST)计划研究进展

植物表达序列标签(EST)计划是随机挑选cDNA克隆，并对其3′或5′端进行大规模一次性测序，将得到的150～500 bp长度的DNA片段与数据库中的序列进行比较，获得对基因组结构、组织、表达等认识的基因组研究策略.就近年来国际植物EST计划的实施情况、植物EST计划的研究范围、生物信息学在EST研究中的应用、EST数据库及查询、植物EST研究中遇到的问题等方面内容进行了综述.  

生物信息学

近年来，随着人类基因组计划（ＨＧＰ）在世界范围内的开展，破译人类及多种模式生物的遗传密码已成为生物学领域的重要学科。同时产生了巨量的基因组信息。分析这些信息是人类基因组研究必不可少的重要内容，从而也促成了生物信息学的产生与发展。生物信息学作为一门新的...  

功能基因组学的研究内容与方法

基因组学的研究已从结构基因组学转向功能基因组学.综述了功能基因组学研究的内容和方法，主要包括应用微点阵、基因表达系列分析(SAGE)、蛋白质组、生物信息学等方法来研究基因组表达概况、基因组多样性、模式生物体等.  

蛋白质组学研究中的双向电泳技术

蛋白质组学研究已经成为后基因组时代的研究热点，其两大支柱是双向凝胶电泳技术和生物质谱技术。尽管双向电泳技术近几年已经取得了突破性进展，是当前蛋白质分离的最常用技术，但其本身还有一些难以克服的问题。随着质谱技术的快速发展，双向电泳逐渐成为蛋白质组学研究的瓶颈。本综述双向电泳主要技术步骤的现状、存在问题及其改进方向。  

SSRHunter，一个本地化的SSR位点搜索软件的开发

基因组研究的发展，使得利用生物信息学方法在一个相对狭小的基因组区段内开发新的SSR标记成为可能。要实现这一点，首先面临的任务就是潜在的SSR位点的搜索。已有的方法或多或少存在这样或那样的缺陷。文章介绍了利用Visual Basic语言开发本地化的SSR位点搜索软件的尝试。所编制的SSRHunter软件能够较出色地完成这一任务。此外，SSRHunter还提供了自动序列预处理，常规的序列整理和序列变换功能以及方便的结果输出方式。  

基于生物信息学的SNP候选位点搜寻方法

单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism,SNP)是人类基因组中最常见的遗传多态，在遗传学研究的很多方面具有重要的作用。它的搜寻正受到广泛关注。近年来，国际上出现了一种基于生物信息学的发掘SNP新方法，本对方法的两种策略及其各自所存在的问题作一介绍。  

人脑内-含有ACP样结构域新基因的发现

为寻找脑内新基因，以正常成人全脑cDNA为模板，采用锚定PCR方法进行扩增，将经琼脂糖DNA电泳 鉴定获得的一约1200bp大小的特异性条带回收，并克隆入Teasy载体.用310 Genetic Analyzer进行自动测序. 所得序列进行生物信息学分析BLAST相似性分析结果证明所得序列为新序列，读框分析表明，该序列中存在 一完整编码区，编码含357个氨基酸的蛋白质.ProDom软件分析发现其含有酰基携带蛋白(ACP)样结构域. 随后，经3'RACE法克隆到该基因的全长cDNA，其全长为2024bp，染色体定位在14q11.2，含有16个外显子， 15个内含子，该基因已登录到GenBank.经设计编码区引物，从Teasy载体扩增出编码区后再克隆入pGEX-4T1 表达载体，经异丙基硫代-D-乳糖苷(IPTG)化学诱导表达.其编码区克隆人pGEX-4T1表达载体后，转入 JM109宿主菌，经IPTG诱导已得到表达.点杂交及RNA印迹表明，该基因在正常成人脑内广泛高表达.  

生物芯片、生物传感器和生物信息学

近年来，在生物技术和医学研究领域涌现出了许多新技术平台，其中就包括生物芯片技术和生物传感器技术。生物芯片和生物传感器的构建都必须以生物信息学为基础，而两种技术平台应用所得出的数据和结果又反过来大大丰富和充实了生物信息学本身。本分析概述了生物芯片和生物传感器两种技术平台以及生物信息学，对三之间的相互关系进行了讨论。  

后基因组时代的生物信息学

随着人类基因组计划的完成,不断积累的巨量的生物学数据和快速发展的信息学技术,给后基因组时代的生物信息学研究带来了新的挑战。该文对后基因组时代的生物信息学研究内容进行了比较全面的描述,分别就其研究对象和研究方向作了区别讨论,分析了生物信息学研究的现状和趋势,比较了国内外的研究发展情况和差距。针对我国在研究中所存在的主要问题,提出了建议并做了展望。  

基于知识发现的生物信息学

生物信息学的研究热点及方面的基本工具是知识发现，而知识发现是计算机科学近期研究的热点，具有一定的理论基础，基于知识发现的生物信息学是理论，应用相结合的必由之路。