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1.
微卫星标记OarAE101和BM1329承五个绵羊品种中的初步研究   总被引:77,自引:6,他引:71  
储明星  程金华  过纬 《遗传学报》2001,28(6):510-517
选择与Booroola羊高繁殖力主效基因FecB紧密连锁的两个微卫星标记OarAE101和BM1329,分析其在小尾寒羊、湖羊、夏洛来羊、乌珠穆沁羊、多赛特羊和多赛特公羊×小尾寒羊母羊杂一代中的多态分布情况.结果表明微卫星标记OarAE101在5个绵羊品种中的等位基因数为5或4,BM1329在5个绵羊品种中的等位基因数均为4,OarAE101#21;#27;/#21;#27;BM1329在小尾寒羊、湖羊、夏洛来羊、乌珠穆沁羊、多赛特羊和多赛特公羊×小尾寒羊母羊杂一代中的多态信息含量值分别为0.57#21;#27;/#21;#27;0.54、0.62#21;#27;/#21;#27;0.67、0.61#21;#27;/#21;#27;0.59、0.62#21;#27;/#21;#27;0.66、0.56#21;#27;/#21;#27;0.67和0.62#21;#27;/#21;#27;0.68.小尾寒羊OarAE101基因型为107bp#21;#27;/#27;113bp#27;所对应的产羔数最小二乘平均值显著高于基因型为109bp#21;#27;/#21;#27;109bp#27;和107bp#21;#27;/#21;#27;111bp#27;所对应的最小二乘平均值(P<0.05),产羔数最小二乘平均值在OarAE101其余基因型之间没有显著差异;OarAE101等位基因107bp与小尾寒羊产羔数有显著正相关,109bp和111bp与小尾寒羊产羔数有显著负相关.小尾寒羊BM1329基因型为146bp#21;#27;/#21;#27;158bp#27;所对应的产羔数最小二乘平均值都显著高于其余3种基因型所对应的最小二乘平均值(P<0.05),产羔数最小二乘平均值在BM1329其余3种基因型之间没有显著差异;BM1329等位基因146bp与小尾寒羊产羔数有显著正相关,148bp与小尾寒羊产羔数有显著负相关.  相似文献
2.
何平HE  Ping 《遗传》1998,20(4):42-47
真核生物中的微卫星及其应用何平(中国科学院遗传研究所,北京100101)Abundance,PolymorphismandApplicationsofMicrosateliteinEukaryoteHEPing(InstituteofGenetics...  相似文献
3.
鲤鱼微卫星分子标记的筛选   总被引:66,自引:3,他引:63       下载免费PDF全文
微卫星 (microsatellite)是近十几年来发展起来的一种新的分子标记 ,它是指以少数几个核苷酸 ( 1~ 6个 )为单位多次重复的简单序列 ,以双核苷酸重复最为常见 ,而其中又以 (CA/GT) n 居多。由于微卫星在真核生物基因组中是随机分布的 ,而作为分子遗传标记又有着非常高的多态性和共显性 ,因此在构建遗传连锁图谱时备受青睐 (Brooketal ,1994 )。目前 ,在人类和多种动物中已经构建了以微卫星为主的遗传连锁图谱。但在鲤鱼等水产动物的遗传连锁图谱中 ,微卫星分子标记还较少 (孙效文和梁利群 ,2 0 0 0 )。为了摸索…  相似文献
4.
大熊猫微卫星DNA的筛选及其应用   总被引:62,自引:3,他引:59       下载免费PDF全文
经DpnⅡ限制酶消化大熊猫基因组DNA后,选取150-500bp大小的片段构建了DNA文库。用合成的(CA)(15)探针从这一文库中克隆筛选了10个大熊猫特异的微卫星DNA座位。在测定DNA序列的基础上设计并合成了10个座位特异的引物,以PCR技术扩增了7份抽提自组织细胞和6份抽提自毛发的大熊猫DNA样品。发现除座位g(007)外,其余9个座位均呈多态性,而且所有座位均为偶数碱基的长度变异。对有准确谱系记录的家系的研究结果证明,这10个微卫星DNA座位严格按孟德尔方式遗传。因而这些座位能有效地应用于大熊猫的亲子鉴定,从而为建立各地大熊猫谱系和制定有效的繁殖计划提供了一个有效的遗传学手段。根据这10个微卫星座位的分析,我们澄清了两组未知的父系关系。  相似文献
5.
新疆8个绵羊品种遗传多样性和系统发生关系的微卫星分析   总被引:60,自引:0,他引:60  
为分析新疆北疆地区主要绵羊品种的遗传多样性和系统发生关系,利用10个微卫星标记,采用PCR扩增,12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳、Sanguinetti银染法显色,对新疆北疆地区8个品种、1个杂交一代绵羊群体遗传多样性进行了检测,统计了各群体的等位基因组成、平均有效等位基因数(E)和平均基因纯合率,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、多态信息含量(PIC)和群体间的遗传距离。利用分子进化遗传分析软件,采用邻结法构建系统发生树;同时根据等位基因频率,利用PHYLIP(3.6)分析软件,采用最大似然法构建系统发生树,应用白举检验估计系统树中结点的白引导值,并进行了系统发生分析。结果表明:10个微卫星位点在9个绵羊群体中的多态信息含量除BMI824、MAF65为低、中度多态外,其余8个微卫星均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于各绵羊品种的遗传多样性和系统发生关系的分析;所有绵羊群体的平均PIC(0.5631)、h(0.5721)和E(2.9)均低于国外其他品种的绵羊,其基因多态性和遗传多样性相对贫乏;新疆本地土种阿勒泰羊、哈萨克羊和巴什拜羊与国外引进绵羊品种及混有外血的本地培育品种遗传距离较远,他们聚为不同的两类,各绵羊品种的分子系统发生关系与其来源、育成史、分化及地理分布基本一致。  相似文献
6.
小尾寒羊五个微卫星基因座遗传多态性研究   总被引:60,自引:5,他引:55  
小尾寒羊是我国优良的地方绵羊品种,具有极高的繁殖力,平均每胎产羔2.6只。利用与绵羊高繁殖力主效基因Fec^B和FecX^1连锁的5个微卫星标记(OarAE101,BM1329,BMS2508,TGLA54t TGLA68)对244小尾寒羊母羊进行了遗传检测。用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测同卫星的PCR扩增产物,计算了5个同卫星基因座的等位基因频率,多态信息含量,基因纯合度和杂合度。在小尾寒羊中检测到BM1329有6个等位基因,片段大小为160-180bp,164bp等位基因频率最高(0.6320);检测到OarAE101有9个等位基因,片段大小为97-135bp,97bp等位基因频率最高(0.7930);检测到TGLA54有5个等位基因,片段大小为116-136bp,134bp等位基因频率最高(0.8500);检测到TGLA68有2个等位基因,片段大小为98-100bp,2个等位基因频率相近,检测到BMS2508有6个等位基因,片段大小为93-115bp,99bp等位基因频率最高(0.4795)。BM1329,OarAE101,TGLA54,TGLA68,BMS2508的多态信息含量/基因纯合度/杂合度分别为0.4481/0.4840.0.5160,0.3516/0.6375/0.3625,0.2528/0.7326/0.2674,0.3733/0.5034/0.4966,0.5809/0.3581/0.6419。可见BMS2508的遗传变异最大,TGLA54的遗传变异最小。这些结果可为小尾寒羊种质特性研究提供分子基础数据。  相似文献
7.
微卫星及其应用   总被引:58,自引:7,他引:51       下载免费PDF全文
微卫星是广泛分布于真核生物基因组中的短串联重复序列(1-5bp),具有突变速率快、多态性高等特性,已被广泛应用于生物遗传作图、群体遗传研究、个体间亲缘关系鉴定等方面。简要论述了微卫星的突变、位点的分离、数据的收集、在生物学中的应用及其存在的缺陷。  相似文献
8.
东北虎微卫星DNA遗传标记的筛选及在亲子鉴定中的应用   总被引:56,自引:0,他引:56  
利用18个家猫微卫星基因座,在东北虎(Panthera tigris sibilia)DNA中扩增结果有4个基因座没有产物,8个基因座为单态,6个基因座为多态性。同时利用苏门答腊虎的微卫星序列设计了8对引物,在东北虎DNA中有4对具有多态性。微卫星基因座的多态性百分率为38.5%。在供试的27只东北虎中,发现等位基因间的变异均为偶数碱基长度变化,对有准确谱系记录的个体研究表明,这10个微卫星DNA遗传标记符合孟德尔遗传规律,所以这些微卫星DNA可以有效的应用于东北虎的亲子鉴定。利用这10对多态性引物,我们成功地鉴定了7个父子关系不清的后代。收集的样品包括23只毛发样品和4只血液样品,实验结果表明,毛发和血液样品均可以得到清晰的微卫星条带[动物学报49(1):118—123.2003]。  相似文献
9.
利用微卫星标记分析山东地方鸡品种的遗传多样性   总被引:54,自引:1,他引:53  
微卫星是近几年来应用较多的一种分子标记,可有效地进行基因鉴定与系谱分析,并可估算群体间的遗传距离。通过选用5个微卫星标记,检测了山东省5个地方鸡种:日照麻鸡、寿光鸡、莱芜黑鸡、济宁百日鸡、鲁西斗鸡以及一个外来鸡种——安卡黄鸡和一个外省地方鸡种——广西黄鸡共7个鸡种的遗传多样性。根据测试结果计算了每个等位基因的频率,以基因频率为基础分析了品种内的遗传变异和品种间的DA遗传距离,并讨论了微卫星多态性在应用于群体遗传变异及亲缘关系等方面的意义。结果表明:共检测到40个等位基因,其中等位基因数最多的位点为。ADL0136(10个);等位基因数最低的位点为ADL0146(5个);而且每个位点的等位基因分布并不均匀,都有一种或几种优势基因存在。在7个品种中,杂合度最低的为寿光鸡,杂合度值为0.3327,因为此鸡种多年来一直由寿光市慈伦种鸡场进行纯繁保种,未与其他鸡种杂交,因此杂合度最小;其他鸡种杂合度也都低于0.4,据分析可能是由于日照麻鸡、济宁百日鸡群体较小;莱芜黑鸡是正在选育的一个品种,个体间遗传关系也不远;安卡黄鸡和广西黄鸡自从引人嘉明公司后,群体近交现象普遍,因此各鸡种杂合度都偏低。由此可见,通过对杂合度的计算,微卫星可以较好地反应群体内的变异。各品种PIC值的变动范围从0.6196(寿光鸡)到0.7027(莱芜黑鸡),PIC值的大小与杂合度的高低体现了较高的一致性。对DA遗传距离的计算表明:日照麻鸡与济宁百日鸡的距离最近,而鲁西斗鸡与其他鸡种距离均较远。用UPGMA法进行聚类分析,结果7个鸡种被聚为3类:山东的4个地方鸡种寿光鸡、日照麻鸡、莱芜黑鸡与济宁百日鸡聚为一类;安卡黄鸡和广西黄鸡聚在一起;鲁西斗鸡独自为一类。这与几个鸡种的分化与选育历史是一致的,因此聚类图能够比较正确地反映7个品种之间的亲缘关系。  相似文献
10.
基于表达序列标签的微卫星标记(EST-SSRs)研究进展   总被引:54,自引:0,他引:54  
作为一种新型分子标记,EST-SSR来自表达基因,因而除具备传统基因组来源的SSR标记所有优势外,可能与基因功能表达具有直接或间接关系,从而强化了SSR标记在遗传研究中的应用.本文综述了近几年来EST-SSR用于遗传图谱构建、基因定位、比较基因组学及重要基因筛选和发掘等方面的研究.  相似文献
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