植物分子系统学近五年的研究进展概况

本文综述了与分子系统学发展密切相关的4个因素：1.分子生物学方法的不断改进；2.基因组的全序列测定；3.用于分子系统学研究的基因种类不断增加，对这些基因进化规律的认识不断深入；4.化石DNA的研究。本文还阐述了核基因及叶绿体基因在系统学研究中的应用，例举了rbcL、matk、18s rDNA和ITS序列分析在植物系统发育研究中取得的重要成果，同时提出了分子系统学研究中应注意的一些问题。  

线粒体DNA序列特点与昆虫系统学研究

昆虫线粒体DNA是昆虫分子系统学研究中应用最为广泛的遗传物质之一，线粒体DNA具有进化速率较核DNA快，遗传过程不发生基因重组，倒位，易位等突变，并且遵守严格的母系遗传方式等特点，本文概述了mtDNA中的rRNA,tRNA，蛋白编码基因和非编码区的一般属性，分析了它们在昆虫分子系统学研究中的应用价值。以及应用DNA序列数据来推导分类阶（单）元的系统发育关系时，基因或DNA片段选择的重要性。  

核rDNA ITS区序列在无脊椎动物分子系统学研究中的应用

在无脊椎动物的分子系统学研究中，作为对线粒体DNA信息的重要补充，人们越来越多采用核DNA的核糖体内转录间隔区（ITS）作为分子标记。本文介绍了ITS的组成和性质，并对近年来ITS在无脊椎动物分子系统学研究中的应用进行了总结，同时提出并讨论了目前在该领域存在的一些问题。  

分子系统学研究中分子位点数与遗传差异信息可靠性的关系 The Correlation Between the Number of RAPD-loci and theReliability of the Information on Genetic Variation in MolecularPhylogenetic Studies

用桑蚕(包括不同生态地理品种59个及野桑蚕)和桑属植物(包括12个种和2个变种)两类截然不同的材料,探讨了分子系统学研究中RAPD分子位点数与遗传差异信息可靠性间的关系。发现:(1)所分析的位点数多少与所能提供系统信息的量及可靠性之间有明显的关系;(2)当位点数在20以下时,得到的遗传差异的结果极不可靠,随着位点数的增加所提供的信息量及可靠性增加。当位点数超过70个时,所提供的信息可靠性趋于稳定;(3)对桑蚕和桑属植物两种截然不同的材料的分析,均得相似结果。由此推论:在用RAPD进行生物系统学研究中,以分析70个左右位点数为好;这一结论受研究对象的影响小,在其它类似的研究中或许具有一定的参考价值。 Abstract:We studied the correlation between the number of RAPD-loci investigated and the reliability of the information on genetic variation analysis using quite different two-kind materials,silkworms(including 59 geographic varieties of Bombyx mori belonging to different ecotype,as well as Bombyx mandarina M.)and mulberries(including 12 species and 2 varieties).The results showed as follows:(1)There was obvious correlation between the numbers of RAPD-loci investigated and the reliability of the information on genetic variation analysis.(2)The data were not suitable for the genetic variation analysis when the number of RAPD-loci in vestigated was smaller than 20.The more RAPD loci were analyzed,the more accurate genetic diversity would be identified when the number of the locus was varied from 20 to 70.Furthermore,the stable information to be available is shown when the number exceeded 70.(3)The similar regularities mentioned above were observed in both silkworm and mulberry.In order to get reliable information of genetic variation in molecular phylogenetic studies,at least 70 RPD loci would be investigated.And the results obtained in this study might be referential for AFLP and RFLP analysis.  

中国鲿科鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析

采用PCR技术获得了中国鲿科鱼类代表种类线粒体DNA控制区基因的全序列，对控制区基因结构进行了分析，并选用粒鲇科的中华粒鲇，鮡科的三线纹胸鮡作为外类群，用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建了系统发育树。结果显示鲿科鱼类中控制区基因适于系统发育分析，鲿科鱼类构成一个单系类群；圆尾拟鲿应该放入鮠属里。  

植物遗传多样性和系统学研究中的等位酶分析

本文对“等位酶”概念、等位酶分析方法在植物遗传多样性和系统学研究中应用的范围（包括种上和种下）进行了介绍和讨论，并对其优点和缺点进行了评论。认为等位酶分析是研究生物遗传多样性的重要方法，并为系统学和进化研究进入分子水平开辟了广阔而实用的前景，但使用分子资料并不意味着可以抛弃形态、细胞等其他方面的资料，它们的关系是互相补充，而决不是互相代替。  

AFLP分子标记及其应用

扩增片段长度多态性(Amplified fragment length polymorphism，AFLP)，是Zabeau等(1992)发展的一种新DNA指纹技术。该技术原理简单，引物设计巧妙，既具有RFLP技术的可靠性又具有RAPD技术的高效性，被称为“最有力的分子标记”。系统介绍了AFLP分子标记的基本原理、技术流程和优化措施，对AFLP标记在植物居群生物学、保护生物学、分子系统学等领域中的应用作了简要介绍，并对其应用前景进行了展望。  

通过Cyt b基因同源序列比较评估厦门文昌鱼的分类学地位

白氏文昌鱼Branchiostomabelcheri (Gray)在我国和日本沿海均有分布 ,由于南、北方文昌鱼形态学上有一定差异 ,且二者间存在一些过渡类型 ,其分类地位问题仍有待进一步澄清。本文测定了厦门欧厝海域产的文昌鱼mtDNACytb基因序列 ,并与日本产的文昌鱼以及另外产于大西洋的两种文昌鱼Cytb基因序列比较。分子系统学分析结果表明 :厦门欧厝海域产的文昌鱼与日本产的文昌鱼平均遗传距离为 2 1 12 % ,达到了种间分化的水平 ;经过对已有文献和文昌鱼地理分布的综合分析 ,作者建议将原来的白氏文昌鱼青岛亚种B belcheritsingtauense提升为种 ,南、北方所产文昌鱼分别作为两个独立的种存在 ,即南方的B belcheri (Gray)和北方的B tsingtauenseTchangetKoo  

从12S rRNA基因序列研究中国蛙科24种的进化关系

测定了中国蛙科动物24种和蟾蜍科的中华大蟾蜍线粒体12S rRNA基因长约400bp片段的序列。采用邻接法，对其数据的系统发生分析表明24种可分成3个支系：第一个支系包括棘腹蛙、合江棘蛙、棘胸蛙、大头蛙、虎纹蛙、倭蛙、泽陆蛙共７种，其中３种棘蛙组成一个单系；第二个支系由３种湍蛙，即戴云湍蛙、华南湍蛙和武夷湍蛙组成，应属于湍蛙亚科；第三支系包含余下的１４种蛙，其中５种林蛙和４种臭蛙分别组成一个单系；２种侧褶蛙先聚合后，再与弹琴水蛙聚合，２种粗上先聚合在一起，再与由林蛙组成的单系群聚合。第三支系首先与第二支系相聚，然后它们与第一支系形成姐妹群，即由蛙亚科的７个物种组成的第一支系，不与蛙亚科另１４个物种组成的第三支系直接聚合，表明第一支系的物种可能不属于蛙亚科。此外，分子证据提示把陆蛙属、大头蛙属、虎纹蛙属、棘棘属、臭蛙属、粗皮蛙属和侧褶蛙属从原来的蛙属分出有其合理性。、  

核糖体rDNA ITS序列在真菌学研究中的应用

rDNA序列的同源性和变化性使其用于真菌各级水平的系统学研究，其中ITS区进化速率较快、长度适中，广泛用于属内种间或种内群体的系统学研究。该文就rDNA序列结构特点、ITS序列在真菌分子系统学及病原学中的应用等方面进行综述。