ISSR分子标记技术及其在植物遗传多样性分析中的应用

ISSR分子标记技术是近年发展而来的一种DNA多态性分子标记，具有简单、经济、信息量大、稳定性高等特点。本文论述了ISSR的反应原理及ISSR实验过程中的技术要点．并总结了ISSR在植物品种鉴定、亲缘关系分析，群体遗传结构、遗传多样性检测，以及植物育种研究中的应用。  

微卫星及其应用

微卫星是广泛分布于真核生物基因组中的短串联重复序列（1-5bp)，具有突变速率快、多态性高等特性，已被广泛应用于生物遗传作图、群体遗传研究、个体间亲缘关系鉴定等方面。简要论述了微卫星的突变、位点的分离、数据的收集、在生物学中的应用及其存在的缺陷。  

10种披碱草属植物的RAPD分析及其系统学意义

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术分析了10种披碱草属植物，即：Elymus sibiricus L.，E． caninus(L．)L¨E．lanceolatus(Scribner et Smith)Gould，E．nutans Griseb，E．dahuricus Turcz，， E．tangutorum(Nevski)Hand．-Mazz., E．brachyaristatus ALöve，E.submuticus(Keng)Keng f.，E． cylidricus(Franch)Honda和E．excelsus Turcz. 。对34个OPRON公司十聚体随机引物进行多态性筛 选，25个(75．53％)能产生多态性。16个引物产生的136个DNA片断，用于计算种间Nei氏遗传相似 性系数分析，在NTSYS程序中利用UPGMA构建系统发育树状图。分析结果表明：(1)四倍体和六倍体 物种各自聚为一支，它们之间的亲缘关系较远；(2)E．sibiricus和E. caninus；亲缘关系较近，支持把 Roegneria caninus (L．)Nevski归入Elymus；(3)E．nutans和E．dahuricus亲缘关系密切；(4)形态相 似、地理分布一致的E．brachyaristatus和E．submuticus存在着一定程度的核苷酸序列的差异，它们与 E．nutans和E．dahuricus有一定的亲缘关系；(5)E．excelsus 与 E．cylindricus的亲缘关系较近，它们 又与E．tangutorum有亲缘关系；(6)RAPD结果与形态学和细胞学等分析结果基本一致，RAPD分析方法将为Elymus系统分类提供DNA水平上丰富的资料。  

用SSR分子标记研究大豆属种间亲缘进化关系

利用SSR标记技术对大豆属11个种37份材料的遗传多样性进行分析，不同位点在种间的等位基因数为6－29，平均生个位点15．9个等位基因，Soja亚属的等位基因数是Glycine亚属的71．5％，并且Glycine亚属种间指纹 谱的差异大于Soja亚属种间的指纹图谱，SSR等位基因的主成分分析结果表明，大豆属中的Glycine亚属和Soja亚属的分类界限是比较明确的，利用第一主成分和第二主成分可较明显地区分开Glycine 亚属的分类界限是比较明显的，利用第一主成分和第二主成分可较明显地区分开Glycine亚属和Soja亚属，通过UPGMA方法构建了大豆属11个种的遗传进化关系，Soja亚属中G.max,G.soja和G.gracilis3个种在系统分化树上界限是比较明显的，由此看来这3个种是独立存在的。  

利用RAPD标记研究荔枝品种的新缘关系

采用改进的ＣＴＡＢ方法提取３４个荔枝品种的基因组ＤＮＡ为模板，从５０个１０碱基的随机引物中获得了３７个多态性ＲＡＰＤ标记，聚类分析结果表明这３４个荔枝品种可以分成４组，第一组有“状元红”、“元红”、“桂林”、“宋家香”、“台湾荔”、“下番枝”、“东刘一号”、“妃子笑”、“白糖罂”、“香丸”、“绿沙”；第二组有“无栗子”、“水东”、“乌叶”、“蔡家肉丸”、“青壳糯米糍”、“糯米糍”；第三组有“桂味”  

5个泥蚶群体遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术 ,对 5个泥蚶群体的遗传多样性进行了研究。在选择的 2 0个随机引物中共检测到 15 4个扩增片段 ,长度在 30 0bp～ 2 30 0bp之间 ,每个个体扩增条带在 1～ 11条不等。利用Popgen3.2和PHILIP统计软件 ,获得实验数据 ,确立了 5个群体间的亲缘关系。结果表明 :( 1)泥蚶的 5个地理群体分化不明显 ,没有形成不同的地理种群 ;( 2 )聚类分析显示 ,韩国群体与浙江群体亲缘关系最近 ,然后依次为山东群体和福建群体 ;( 3) 5个群体无论是在多态位点比例还是在平均遗传杂合度上都处于较高水平 ,说明泥蚶当前种质资源状况良好 ,遗传多样性水平较高 ,泥蚶养殖有很好的发展前景 ;( 4)与韩国野生群体相比 ,其他 4个泥蚶群体在多态位点比例和遗传平均杂合度上都有不同程度的降低 ,表明人为等因素已经开始影响到泥蚶的种质资源状况。因此 ,为持续发展泥蚶养殖业 ,必须加强保护泥蚶现有的种质资源并制定相应的渔业管理措施。  

三品系小型猪35个微卫星基因座的遗传学研究 Genetic Analysis of 35 Microsatellite Loci in Three Miniature Pig Breeds

利用35个微卫星基因座对中国三个品系的小型猪（贵州小型香猪、广西巴马小型猪、版纳小耳猪近交系）进行了遗传检测。计算出三个小型猪品系个体样本在35个微卫星基因座的纯合率，并对其进行t检验。计算出各品系的平均杂合度，多态信息含量（PIC）及品系间的遗传距离，并进行了系统聚类。结果表明三个品系的小型猪其基因纯合率均较高，其中版纳小耳猪近交系的基因纯合率最高；PIC和平均杂合度均较低；贵州小型香猪和广西巴马小型猪亲缘关系较近，并均与版纳小耳猪近交系的亲缘关系略远。 Abstract：The polymorphism of 35 microsatellites in the three miniature pig breeds in China(Guizhou miniature pig, Guangxi Bama miniature pig, Banna miniature pig inbred) was analysed. Rates of homozygote for 35 microsatellite loci in three miniature pig breeds were calculated,and t-test for them were performed. Mean heterozygosity and polymorphism information content(PIC) were calculated for all breeds, and genetic distances between these breeds were estimated. The dendrograms were obtained based on genetic distances. The results suggest that rates of homozygote in the three breeds are all high, and that is the highest in Banna miniature pig inbred. The results also suggest that polymorphism information content and mean heterozygosity in all the three breeds are low, and the genetic relationship between Guizhou miniature pig and Guangxi Bama miniature pig is closer than their relationship with Banna miniature pig inbred.  

RAPD重建的大豆属植物的亲缘关系

利用８种ＲＡＰＤ引物（ＯＰＨ－２、ＯＰＨ－３、ＯＰＨ－５、ＯＰＨ－１２、ＯＰＨ－１５、ＯＰＨ－１６、ＯＰＨ－１８和ＯＰＨ－２０）对大豆属的２１份植物材料，其中包括Ｇｌｙｃｉｎｅ亚属的１０个种和Ｓｏｊａ亚属的３个种，进行了基因组指纹图谱构建。通过对获得的基因组指纹图谱的量化分析，利用Ｕｎｗｅｉｇｈｔｅｄｐａｉｒｇｒｏｕｐｗｉｔｈｍａｔｈｅｍａｔｉｃａｖｅｒａｇｅ（ＵＰＧＭＡ）对大豆属中的各个种进行了亲缘关系重建。重建的亲缘关系表明：Ｇ．ｔｏｍｅｎｔｅｌｌａ种中存在３种不同的进化类型，其分化距离已大于某些种种间的分化距离，它们可能是被形态遮蔽的３个种。Ｓｏｊａ亚属内３个种的分化关系同前人的研究推断相同，其亲缘关系很近，这一结果支持将这３个种归并为一个种的观点。但是重建的亲缘关系未能显示出大豆属两个亚属的划分格局。  

关于停止使用"同翅目Homoptera" 目名的建议

长期以来，在我国昆虫学界，“同翅目Homoptera”和半翅目Hemiptera一直被作为2个并列的昆虫目被广泛使用。传统的“同翅目”被分为3亚目10总科，即鞘喙亚目Coleorrhyncha(包括膜翅蝽总科Peloridioidea)、胸喙亚目Stemorrhyncha(包括木虱总科Psylloidea、粉虱总科Aleyrodoidea、蚧总科Coccoidea和蚜总科Aphidoidea)和头喙亚目Auchenorrhyncha[包括蜡蝉子亚目Fulgoromorpha(包括蜡蝉总科Fulgoroidea)和蝉子亚目Cicadomorpha(包括蝉总科Cicadoidea、沫蝉总科Cercopoidea、叶蝉总科Cicadelloidea和角蝉总科Membracoidea)]。近年来，形态学及分子学特征数据的支序分析研究表明，木虱总科、粉虱总科、蚧总科、蚜总科、蜡蝉总科、蝉总科、沫蝉总科、角蝉总科都是单系群；鞘喙亚目、胸喙亚目、蝉子亚目及蜡蝉子亚目也都是单系群，其相互之间的系统发育关系为：胸喙亚目 (蝉子亚目 (蜡蝉子亚目 (鞘喙亚目 异翅亚目(蝽类))))，它们共同组成了单系的半翅目Hemiptera。系统发育分析表明，在半翅目中，鞘喙亚目与异翅亚目具有最近的亲缘关系，蜡蝉子亚目与鞘喙亚目 异翅亚目是姊妹群，蝉子亚目是蜡蝉子亚目 (鞘喙亚目 异翅亚目)的姐妹群，胸喙亚目是半翅目中最早和最原始的一个分枝。因此传统的“同翅目”并不是一个自然的单系类群，而是一个人为的并系类群。目前，在国际昆虫学界，“同翅目”作为一个人为的并系类群已得到公认和普遍接受，并已不再作为昆虫纲的一个有效目被使用。然而，“同翅目”作为昆虫纲的一个有效目在国内一直被广泛使用，为此，作者建议我国的昆虫学工作者今后应停止使用“同翅目”这一人为的并系目名而使用单系的半翅目目名，即将长期以来一直置于“同翅目”的木虱、粉虱、蚧虫、蚜虫、蝉、沫蝉、叶蝉、角蝉及蜡蝉类昆虫与蝽类昆虫一起作为半翅目的成员对待。  

鲂属团头鲂、三角鲂及广东鲂种间遗传关系及种内遗传差异

采用形态判别、同工酶分析和RAPD分析相结合的方法，从3个层次研究分析了鲂属团头鲂、三角鲂和广东鲂的种间亲缘关系和种内遗传差异。结果表明：（1）3种鲂在形态可数性状上差异不显著，而可量性状与框架分析揭示团头鲂与三角鲂亲缘关系较近，它们同广东鲂差异较大；（2）团头鲂和三角鲂均具有MDH同工酶的s-Mdh-D位点，而广东鲂未见，引物S11扩增的结果在3种鲂间均显示种的特异性，这些同工酶谱带和DNA扩增带可作为3种鲂的种间分子标记；（3）3种鲂种间亲缘关系在三个研究层面上相互吻合：即广东鲂和头鲂、三角鲂差异较大，亲缘关系较远，而三角鲂和团头鲂之间差异小，亲缘关系较近；（4）同工酶和RAPD分析揭示，三角鲂种内遗传多样性显著地高于广东鲂和团头鲂。