云南省急性弛缓性麻痹病例中柯萨奇病毒B5感染情况及病毒基因特征分析

为了解云南省急性弛缓性麻痹(Acute flaccid paralysis,AFP)病例中柯萨奇病毒B组5型(Coxsackievirus B5,CV-B5)感染情况及病毒基因特征,采用回顾性研究的方法,收集AFP监测系数据资料,描述CV-B5感染AFP病例的流行病学特征及临床表现;对CV-B5分离株进行完整VP1区逆转录-聚合酶链反应扩增和核苷酸序列测定,测序结果进行同源性分析和系统发生学研究.结果显示,15例CV-B5阳性的AFP病例散在分布于7个云南省内州市、贵州省及缅甸;男女比例为1∶2,5岁以下儿童占73.3％,53.3％(8/15)的病例麻痹时伴发热,以双侧下肢麻痹(66.7％,10/15)为主,临床诊断多为肌炎(33.3％,5/15),1例病例残留麻痹.CV-B5云南株之间以及与原型株之间的核苷酸同源性分别为75.0％～100.0％和77.2％～82.0％.云南本地存在两个基因型的CV-B5共循环,大多数云南株(16株)与中国大陆CV-B5分离株均属于D基因型(D3亚型),另外两株云南株属于国外优势流行的C基因型,与其他云南株之间存在较大的核苷酸差异(20.4％～25.0％).本研究描述了 CV-B5云南地方株的分子流行病学特征,首次发现我国存在C基因型.研究显示分离自不同疾病来源及健康人群的CV-B5在亲缘关系树上无特异性区分.     

2018-2019年中国流行性腮腺炎流行特征和病毒基因特征分析

阐明中国(未包括香港、澳门特别行政区和台湾地区,下同)2018-2019年流行性腮腺炎(流腮)流行特征和病毒基因特征。对2018-2019年中国流腮流行病学和病毒学监测数据进行描述流行病学和分子流行病学分析。2018-2019年中国流腮年报告发病率分别为18.65/10万和21.48/10万,15岁以下儿童和青少年是我国流腮的高发人群,分别占总病例数的85.30%和82.56%。流腮的流行具有明显的季节性特征。全国各省、自治区、直辖市份均有流腮病例报告,西部和中部地区发病率高于东部地区。2018-2019年共获得160条腮腺炎病毒(Mumps virus,MuV)SH基因序列,其中150条(93.75%)序列鉴定为F基因型MuV,在我国11个省份检测到;10条(6.25%)序列为G基因型MuV,2019年在广东、湖北和新疆3个省份检测到。和我国既往流行MuV代表株相比,2018-2019年流行的F基因型MuV代表株序列在基因亲缘性关系树上相对集中。现阶段我国流腮的流行病学特征未发生明显改变,仍呈现病毒自然流行模式;F基因型作为优势流行基因型,在我国大部分地区持续流行,但毒株的遗传多态性有所降低,这可能和我国实施1剂次腮腺炎疫苗常规免疫策略有关。G基因型MuV主要在我国局部地区流行,但流行范围在逐渐扩大。建议进一步加强两剂次腮腺炎疫苗接种工作,降低我国腮腺炎易感人群。同时持续性开展MuV流行学和病毒学监测工作,为鉴别病毒的来源,确定病毒传播途径和评估腮腺炎疫苗免疫策略奠定重要的基础。     

云南省2006～2010年非脊灰肠道病毒分子流行病学特征分析

为了解云南省非脊髓灰质炎(脊灰)肠道病毒(NPEV)的基因型分布及分子进化特征,对2006～2010年间从急性迟缓性麻痹(AFP)病例中分离到的105株NPEVs进行VP1区部分核苷酸扩增和序列测定。所获得的云南地方株基因序列与各基因型原型株进行核苷酸与氨基酸同源性比较,并与GenBank中选取的代表株构建基因进化关系树。结果分析显示:105株NPEVs分别属于HEV-A、HEV-B、HEV-C,其中HEV-A 18株(7个血清型)所占比例为17.1%;HEV-B 77株(22个血清型)所占比例为73.3%,表明云南省AFP病例中流行的NPEV还是以HEV-B为主;HEV-C 10株(4个血清型)所占比例为9.5%;没有分离到HEV-D组肠道病毒;基因进化树中各种血清型病毒与对应原型株及代表株聚集一起,除CA2、EV90和EV76外,云南地方株与原型株位于不同分支。相同型别的毒株在5年的流行过程中变异程度亦不同,亲缘关系远近不一,表明这些病毒在云南省存在不同的传播链。     

2018-2019年云南省15702例手足口病病原学监测结果分析

探讨2018-2019年云南省15 702例手足口病（Hand,foot and mouth disease,HFMD）病原学和流行病学分布特征,为手足口病防控工作提供依据。应用实时荧光定量PCR方法检测手足口病临床诊断病例标本中的EV-A71(Enterovirus 71,EV-A71)、CVA16(Coxsackievirus A16,CVA16)和其他肠道病毒。15 702份标本的病原检出率为75.78%(11 899/15 702),以其他肠道病毒为主,占阳性标本的48.85%(5 813/11 899);其次为CVA16,占阳性标本的40.98%(4 876/11 899);EV-A71感染较少。手足口病病例每月均有报告,高峰出现在4-7月。男性多于女性,性别比约为1.44:1。病例主要集中在1岁组和2岁组,分别占30.72%(4 824/15 702)和23.66%(3 715/15 702)。不同标本类型的阳性检出率存在统计学差异（χ2=128.857,P<0.001）,粪便>咽拭子、肛拭子。不同病例类型的标本阳性检出率不同,重症病例明显高于轻症病例,有统计学...     

云南省迪庆州城乡居民蔬菜水果、动物性食物摄入状况的分析

目的：了解迪庆州城乡居民蔬菜水果、动物性食物摄入状况,为该地区居民平衡膳食、合理营养提出建议。方法：采用多阶段分层整群抽样的方法抽取调查户,在调查户中随机抽取符合条件的调查对象。由培训合格的调查员开展面对面问卷调查。Epidata 3.1录入数据并核查数据质量,SPSS 19.0分析数据。结果：共调查3 650人,有效问卷3 590份。其中男性1 406人（39.2%）、女性2 184人（60.8%）;以15～44岁人口占多数,共1 778人（49.5%）,其中,城市居民845人（23.5%）、农村居民2 745人（76.5%）。迪庆州15岁及以上居民平均每人每日摄入蔬菜（男性191.8g、女性176.3g）、水果（男性124.7g、女性123.0g）、畜禽肉类（男性123.0g、104.5g）、蛋类（男性33.5g、女性33.1g）、水产品（男性9.5g、女性10.3g）。根据《中国居民膳食指南（2016）》的建议,该地区居民蔬菜、水果摄入未达标,动物性食物总量达标,但是畜禽肉类明显超标。结论：迪庆州城乡居民膳食结构仍然不合理,应加强倡导合理膳食,建议该地居民增加蔬菜、水果、蛋类、水产品摄入量,减少猪牛羊等红肉类摄入量。     

肠道病毒ECHO20血清型鉴定和VP1序列初步分析

肠道病毒(Enterovirus)是最常见的人类致病病毒之一,包括脊髓灰质炎病毒、柯萨奇A组病毒、柯萨奇B组病毒和ECHO病毒。一般认为大多数肠道病毒感染症状轻微或不明显,然而有时肠道病毒感染也可能是严重甚至致命的[1]。2004年云南省潞西县局部地区发生小规模的甲肝流行,我们从当地     

澜沧江流域北部中华蜜蜂有毒蜂蜜孢粉学和营养生态位分析

为分析澜沧江流域北部人食用蜂蜜中毒的原因,于2013年6—9月份,对该区域蜜蜂和蜜源植物的分布情况进行了调查,观察蜜蜂采集有毒蜜源植物的行为,并进一步调查了蜜蜂巢内蜂蜜、蜂花粉的储存情况,采集了中华蜜蜂蜂蜜样品,进行蜂蜜孢粉学与营养生态位分析。该区域有大量采用传统方式进行人工饲养的中华蜜蜂(Apis cerana cerana),及少量野生中华蜜蜂、黑色小蜜蜂(Apis audreniformis)、黑色大蜜蜂(Apis laboriosa smith)群体分布;人工饲养的中华蜜蜂蜂巢内部结构与野生中华蜜蜂蜂巢相似,为自然蜂巢,内有充足的蜜粉储存,部分蜂群蜂巢内虫害严重。该区域内主要蜜源植物为荞麦(Fagopyrum esculentum Moench),其他零星辅助蜜源较多,部分地点南烛(Vaccinium bracteatum Thunb)、昆明山海棠(Tripterygium hypoglaucum(Levl.)Hutch)连片集中分布。对中华蜜蜂蜂蜜进行孢粉学和营养生态位分析,结果表明:中华蜜蜂蜂蜜标本中含有有毒蜜源植物南烛、昆明山海棠花粉,部分样品中南烛、昆明山海棠的花粉含所占比例较高;中华蜜蜂的营养生态位宽度为0.22,比其他地区中华蜜蜂生态位指数小,推测澜沧江水电枢纽的修建等人为原因已对蜜蜂种类、蜜源植物的物种组成、群落结构造成了较大影响。     

海南省及云南西双版纳州HIV-1的分子流行病学比较研究

目的调查比较HIV-1在海南省及云南西双版纳州的流行情况及分子流行病学分析高危因素传播的情况以及传播链的鉴定。方法我们与海南省CDC及西双版纳州CDC合作在其境内开展了HIV血清学调查,筛查了海南省（1991～2006）及西双版纳州（1996～2005）高危人群志愿者血清样本。在本次两地调查中,我们通过系统进化分析方法,对已诊断的HIV感染者进行分子流行病学的追踪,来分析其中的主要流行亚群以及结合个案追踪进行传播链的鉴定。结果我们共筛查了海南省499725人,共检出HIV阳性感染者523例（0.1%）,以注射器吸毒感染为主要传播途径（经共用注射器吸毒感染占69．2％、经性接触传播占19．3％、供血和使用血液／血液制品感染占3．3％、母婴传播占0．8％、不详占7．7％）。然而,在西双版纳州筛查中发现了较海南省高20倍的检出率：在25390受检人中,共检出HIV阳性感染者501例（2％）并以异性性传播为主（经异性性接触传播占77．3％、经共用注射器吸毒感染占21．1％、经同性性接触传播占0．4％、母婴传播占1．2％）。在海南省抽样的83人中,以CRF01_-AE重组亚型（70人,84．3％）为主要病毒亚型,其他病毒亚型包括B’亚型（8人）、C亚型（2人）、CRF08_BC重组亚型（1人）、B亚型（1人）和1个未报道过的CRF01～AE／B’重组亚型。同样,在版纳抽样的44人中,也以CRF01_AE重组亚型（27人,61．3％）为主要病毒亚型,其他病毒亚型包括CRF08_BC重组亚型（15人）、G亚型（1人）、和1个未报道过的B／C重组亚型。在海南省抽样中有66人（79．5％）分布于4个大小不同的传播群,传播群1（59人）较大（奠基效应）,属于CRF01_AE重组亚型,传播群2、3、4则较小,分别为3、2、2人,分别属于CRF01_AE重组亚型、C亚型和B’亚型。相反,在版纳抽样中有18人（40．9％）分布于8个较小的传播群（每群平均含2．25感染个体）。在海南省抽样中怀疑的6对异性性接触的传播链中,经系统进化分析方法确认了其中的4对,2对被拒绝。在版纳抽样中怀疑的8对异性性接触的传播链中,经系统进化分析方法确认了其中的5对,2对被拒绝,1对无法分析,此外还新发现了3对异性性接触传播群。结论HIV-1感染者的分子流行病学的追踪和分析对于追溯艾滋病流行的源头和地区性预防策略的制定有着重大的意义。     

滇西北高原藏区小型兽类体表寄生蚤的生态位特征

为探讨云南西北高原藏区小型兽类体表寄生蚤的生态位特征,根据海拔和地形等自然环境特点,在德钦县选取42个调查样点,划分为5个垂直带,4种生境,采用铗夜法和笼日法捕获小兽,梳捡其体表寄生蚤,运用生态位宽度指数（B_i）和生态位重叠指数（NO）对其生态位特征进行分析。结果：共梳捡寄生蚤1275头,隶属4科9亚科17属33种,其中迪庆额蚤和云南栉眼蚤为优势种,常见种12种,稀有种19种。在海拔资源轴上,B_i值前三分别是特新蚤德钦亚种0.698、棕形额蚤0.690、斯氏新蚤川滇亚种0.667;生境资源轴上,B_i值前三分别是：无值大锥蚤0.630、特新蚤指名亚种0.57、特新蚤德钦亚种0.537;寄主资源轴上,B_i值前三为绒鼠怪蚤0.584、迪庆额蚤0.567、棕形额蚤0.553;多维生态位宽度来看,特新蚤德钦亚种和迪庆额蚤B_i值较大,分别为1.031、1.019。海拔、生境、寄主生态位重叠指数中,有意义的重叠种对分别占比35.6%、39.39%、9.28%;完全不重叠的种对分别占比26.89%、18.56%、51.14%;完全重叠的种对分别占比2.27%、13.26%和0.19%。三种生态因子中,优势种和常见种的生态位宽度值较大,对资源的利用能力和竞争能力较强。不同生态因子的生态位重叠指数格局不同,与资源轴本身有关。有意义的重叠和完全不重叠的种对占比较多,前者多为优势种、常见种、稀有种两两之间重叠,重叠指数越高,竞争关系越激烈;完全不重叠的种对多为稀有种之间,无资源利用竞争关系。总体来说,德钦县小兽体表寄生蚤种类丰富,生态位分化较为均匀,本研究可为该地蚤传疾病的监测防控提供生态学依据。     

雷氏纤蚤雄性的记述及雌性的形态补充

根据采白云南泸水县高黎贡山橙腹松鼠(Dremomys lokriah)体的纤蚤属蚤类标本,首次对中华纤蚤亚属Sinorhadinopsylla Xie,Gong et Duan,1990和雷氏纤蚤Rhadinopsylla(Sinorhadinopsylla)leii Xie．Gong et Duan,1990雄性进行了记述,并对雌性的部分形念作了补充。