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1.
Zhang L  Luo L 《Nucleic acids research》2003,31(21):6214-6220
Based on the conservation of nucleotides at splicing sites and the features of base composition and base correlation around these sites we use the method of increment of diversity combined with quadratic discriminant analysis (IDQD) to study the dependence structure of splicing sites and predict the exons/introns and their boundaries for four model genomes: Caenorhabditis elegans, Arabidopsis thaliana, Drosophila melanogaster and human. The comparison of compositional features between two sequences and the comparison of base dependencies at adjacent or non-adjacent positions of two sequences can be integrated automatically in the increment of diversity (ID). Eight feature variables around a potential splice site are defined in terms of ID. They are integrated in a single formal framework given by IDQD. In our calculations 7 (8) base region around the donor (acceptor) sites have been considered in studying the conservation of nucleotides and sequences of 48 bp on either side of splice sites have been used in studying the compositional and base-correlating features. The windows are enlarged to 16 (donor), 29 (acceptor) and 80 bp (either side) to improve the prediction for human splice sites. The prediction capability of the present method is comparable with the leading splice site detector—GeneSplicer.  相似文献
2.
青藏高原草地植物群落冠层叶片氮磷化学计量学分析   总被引:25,自引:1,他引:24       下载免费PDF全文
 叶片氮(N)和磷(P)的化学计量学研究涉及到植物生态学的众多领域与多个尺度, 然而各个尺度上的化学计量学研究并未同步展开。通过对青藏高原47个草地样地连续3年的调查, 分析了当地群落水平上的植物叶片N、P含量及其化学计量学特征, 并结合温度和降水气候数据研究了N、P含量及N:P比值与这两个气候因子的相关关系。研究结果显示: 青藏高原草地群落水平的叶片N含量变化范围为14.8–36.7 mg·g–1, 平均为23.2 mg·g–1; P含量变化范围为0.8–2.8 mg·g–1, 平均为1.7 mg·g–1; N:P比值变化范围为6.8–25.6, 平均为13.5。群落叶片N含量与P含量呈显著正相关关系, 叶片的N:P比值与P含量呈显著负相关关系, N:P比值的变化主要由P含量变化决定。另外发现: 群落水平叶片N、P含量及N:P比值存在着显著的年际变化, 叶片的N、P含量及N:P比值与年平均气温之间存在着极显著的相关关系。通过该研究结果推测: P含量较高的变异系数及其与环境因子表现出的显著相关性, 在一定程度上体现了植物群落对当地气候条件的一种适应。  相似文献
3.
牛乳腺上皮细胞的分离培养及其生物学特性   总被引:24,自引:0,他引:24       下载免费PDF全文
采用胶原酶消化法和胰蛋白酶选择性消化法分离、培养和纯化牛乳腺上皮细胞。形态学观察表明,培养的细胞具有典型的上皮细胞形态特征;染色体分析结果表明,培养的细胞具有正常的染色体数目。通过荧光免疫细胞染色方法鉴定了培养的细胞表达上皮细胞特异的角蛋白5和8。该细胞在添加胰岛素、氢化可的松以及羊催乳素的无血清培养液中诱导培养时,用RT-PCR方法检测到了β-酪蛋白基因的转录。这些结果表明,分离培养的细胞是乳腺上皮细胞,这些细胞在诱导培养的条件下能够转录表达β-酪蛋白。  相似文献
4.
Based on the concept that the structural class of a protein is mainly determined by its secondary structure sequence, a new algorithm for prediction of the structural class of a protein is proposed. By use of the number of alpha -helices, beta -strands, and betaalphabeta fragments, the structural class of a protein can be predicted by an algorithm based on the increment of diversity (ID), in which the sole prediction parameter-the increment of diversity is used as the index of prediction of structural class of a protein. The results indicate that the high rates of correct prediction are obtained for complete set (standard set) from Brookhaven Protein Data Bank-CD ROM (PDB) published in October 1995 and the test set newly released from Brookhaven Protein Data Bank-CD ROM (PDB) before July 1998, respectively.  相似文献
5.
乌梁素海沉积物中有机质和全氮含量分布特征   总被引:19,自引:0,他引:19       下载免费PDF全文
针对乌梁素海富营养化日趋严重和湿地面积逐渐萎缩,系统地研究了其生态环境地球化学效应.结果表明,乌梁素海表层沉积物中的全氮含量存在明显的经向和纬向分异特征;沉积物中全氮养分含量与有机质含量显著相关(r>0.93);沉积物中C/N的平均值介于12.07~19.95之间,表明有机质主要来源于湖中水生植物,水体富营养化具有显著的内源性.TN和有机质在不同粒级表层沉积物中的粒度效应明显,且TN和有机质在IV粒级的含量分别为I粒级的3.1~7.6倍和2.5~8.0倍.  相似文献
6.
网翅蝗科九种蝗虫的酯酶同工酶研究(直翅目:蝗总科)   总被引:18,自引:0,他引:18  
应用聚丙烯酰胺凝胶电泳技术,对网翅蝗科Arcypteridae3属9种蝗虫进行了酯酶同工酶的研究,研究结果表明,同一属分类单元中各个种间的酯酶同工酶谱带相似程度明显高于不同属分类单元种间相似程度,较高分类单元之间酯酶谱带椒似程度低于较低分类单元之间的相似程度。  相似文献
7.
西鄂尔多斯地区土壤与四合木微量元素含量特征分析   总被引:18,自引:3,他引:15       下载免费PDF全文
从西鄂尔多斯地区生境适宜性特征的角度,研究四合木(Tetraena mongolia)的生态适应性,探讨迁地保护不易成活的原因,对不同生境条件下四合木分布区土壤和植株微量元素含量的测定结果表明,四合木分布区土壤中Cu、Fe、Mn、Zn、B、Mo、Se、Co、CI9种微量元素中,除B的含量明显高于国内土壤平均含量水平和荒漠区土壤平均含量水平;其它元素都低于国内土壤的平均含量;迁地实验区土壤中除Cu的有效量略低于荒漠区土壤和四合木分布区土壤的含量外,Fe、Mn、Zn、B、Mo的有效量均略高于荒漠区土壤和四合木分布区土壤,四合木植株中Fe、Cu、Zn、B、Se、Co的含量远高于各种类型草原植物,而Mo含量高于植物体含量均值,但低于荒漠草原植物,仅为荒漠草原植物的50%,四合木分布区土壤与四合木成株、幼苗9种微量元素相关性不显著,而且植物体中9种元素含量远远大于土壤中的有效量,从四合木植株中各元素含量与各类型草原植物(包括荒漠草原植物)和土壤中含量比较表明,四合木在生长过程中对各种元素呈富集特征,可见土壤微量元素的含量不是四合木迁地种植的制约因子。  相似文献
8.
内蒙古托克托地区景观格局特征分析   总被引:17,自引:2,他引:15       下载免费PDF全文
内蒙古托克拖地区位于我国农牧交错带黄河中游,农业历史悠久、应用遥感影像,结合地面调查,绘制了研究区植被类型现状图,在GIS支持下,选取多种景观指数,分别从斑块数、斑块面积、班块周长和多样性指数等方面对研究区景观结构特征和多样性进行分析,结果表明,整个研究区景观是一个显著的农林牧景观嵌体,农田面积281.72km^2,占研究区总面积的34.64%,林地景观占22.0%,草地景观占6.65%。研究区东北部景观基底为农田景观,在该基底上,基本上以居民点为中心较密集与规律地分布着杨树+榆树林班块,共89块,斑块密度达2.568个·km^-2,斑块平均面积仅为0.39km^2,基底与斑块2种景观单元在该区域十分典型。杨树+榆树林和丘陵沟壑景观类型边界密度值较大,说明杨树+榆树林景观类型的破碎化程度较大,而丘陵沟壑边界切割破碎,可以认为,该地区在人类活动的影响下,景观结构呈现较明显的人类干扰特征。  相似文献
9.
用简易的外科手术对阿白羊,盖县红山羊及二者杂交改良型绒山羊在梳绒后于其颈部皮下埋植一种含褪黑素的胶囊,经5周后受试羊群开始长绒,而对照群羊则未见绒生长。在9月中旬天然生绒开始时,受试群羊绒已分别长至3-5cm,,而对照群则刚开始生长至2cm。表明上述各受试群当年被成功地诱发二次生绒。  相似文献
10.
四合木种群的生态适应性   总被引:17,自引:7,他引:10       下载免费PDF全文
杨持  智颖飙  征荣 《生态学报》2006,26(1):91-96
通过四合木异地播种生长量比较、以及四合木对土壤的适应性和对水热综合因子的适应性分析,得到如下结果:(1)四合木生长量高低的顺序为乌海区的东胜土(12.12g)〉乌海区的乌海土(10.62g)〉东胜区的乌海土(3.10g)〉东胜区的东胜土(2.59g)。同一地区不同土壤间四合木生长量之间没有差异(P≥0.05),不同地区相同土壤间的生长量之间却有十分显著的差异,说明了土壤条件对四合木的生存影响是次要的,气候条件是保证四合木生存的最重要的条件。(2)四合木分布区与异地保护区之间9种土壤微量元素具有差异,但由于四合木植株中的微量元素含量均高于土壤中的有效量,说明四合木对微量元素具有富集作用,土壤微量元素含量不是四合木成活与生长的限制因子。(3)四合木分布区与异地保护区之间各月平均温度差异显著;全年气温日较差以及温暖指数、寒冷指数、湿润指数和水热综合因子指数差异显著;生长季地表地温昼夜温差具有特殊性,这可能是异地保护不易成功的限制因子之一。  相似文献
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