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1.
微卫星评价牙鲆雌核发育二倍体纯合性   总被引:29,自引:1,他引:28       下载免费PDF全文
采用8个微卫星座位分别对牙鲆减数雌核发育二倍体家系和卵裂雌核发育二倍体家系的纯合性进行检验。卵裂雌核发育二倍体在所有检测座位全部纯合。减数雌核发育二倍体在部分座位发生纯合,但未发现在所有座位全部纯合的个体,在Poli9TUF、Poli9-8TUF、Poli11TUF、Poli13TUF、Poli23TUF、Poli30TUF、Poli123TUF和Poli130TUF座位,杂合子比例分别为1·0000、1·0000、0·1944、0·9459、0·8611、1·0000、0·7778和0·8000,平均杂合子比例为0·8224。由此表明,牙鲆除了Poli11TUF外,在其余7个座位均具有很高的重组率。研究结果显示,牙鲆卵裂雌核发育二倍体一代即可形成纯合子;而减数雌核发育二倍体由于具有较高的重组率,使其与母本的遗传同质性较高。  相似文献
2.
应用微卫星多态分析四个鲤鱼群体的遗传多样性   总被引:27,自引:1,他引:26       下载免费PDF全文
选择12个斑马鱼功能基因的微卫星标记和12个鲤鱼微卫星标记,检测黑龙江鲤(Cyprinus carpiohaematopterusTemminck et Schlegel)、散鳞镜鲤(C.carpio)、荷包红鲤抗寒品系(C.carpiovar.wuyuanensis)、松浦鲤(C.carpioSongpu carp)的群体遗传多样性。共检测到3882个扩增片段,长度为126~489bp,在群体间扩增出1~5个等位基因不等,共计59个等位基因,平均等位基因2.46个。数据经PHYLIP V3.6软件估算和MEGA3软件作图,确立4个群体间的亲缘关系。并应用Bootstrap检验估计系统树中节点的自引导值,并进行了系统发生分析。结果表明①4个群体检测的有效等位基因数都在55个以上,平均观测杂合度为0.36~0.43,平均期望杂合度为0.49~0.53,平均多态信息含量为0.21~0.25,说明这几个群体多态性属于中度偏高水平,遗传多样性较高;②群体间相似系数都在0.84以上,遗传距离较近,为0.067~0.170,与前人研究结果一致。聚类分析显示,松浦鲤与散鳞镜鲤亲缘关系最近,荷包红鲤抗寒品系与它们的亲缘关系较黑龙江鲤更近;③在3个斑马鱼功能基因相关的微卫星位点上,黑龙江鲤缺失特异扩增条带,这可能与几种鱼类的育成史有关。  相似文献
3.
Biology, fisheries, and conservation of sturgeons and paddlefish in China   总被引:26,自引:0,他引:26  
This paper reviews five of the eight species of acipenseriforms that occur in China, chiefly those of the Amur and Yangtze rivers. Kaluga Huso dauricus and Amur sturgeon Acipenser schrenckii are endemic to the Amur River. Both species still support fisheries, but stocks are declining due to overfishing. Acipenseriformes of the Yangtze River are primarily threatened by hydroelectric dams that block free passage to spawning and feeding areas. The Chinese paddlefish Psephurus gladius now is rare in the Yangtze River system, and its spawning activities were severely limited by completion of the Gezhouba Dam in 1981. Since 1988, only 3–10 adult paddlefishes per year have been found below the dam. Limited spawning still exists above the dam, but when the new Three Gorges Dam is complete, it will further threaten the paddlefish. Artificial propagation appears to be the only hope for preventing extinction of P. gladius, but it has yet to be successfully bred in captivity. Dabry's sturgeon A. dabryanus is a small, exclusively freshwater sturgeon found only in the Yangtze River system. It is concentrated today in reaches of the main stream above Gezhouba Dam. The fishery has been closed since 1983, but populations continue to decline. Acipenser dabryanus has been cultured since the 1970s, and holds promise for commercial aquaculture; availability of aquacultural methods offers hope for enhancing natural populations. The Chinese sturgeon A. sinensis occurs in the Yangtze and Pearl rivers and seas of east Asia. There is still disagreement about the taxonomy of the Pearl and Yangtze River populations. The Yangtze River population is anadromous. Adults begin spawning at about age 14 years (males) and 21 years (females), and adults spend over 15 months in the river for reproduction. Spawning sites of A. sinensis were found every year since 1982 below the Gezhouba Dam, but it seems that insufficient suitable ground is available for spawning. Since 1983, commercial fishing has been prohibited but more measures need to be taken such as establishing protected areas and characterizing critical spawning, summering and wintering habitats.  相似文献
4.
鲤鱼体长性状的QTL定位及其遗传效应分析   总被引:23,自引:5,他引:18       下载免费PDF全文
张研  梁利群  常玉梅  侯宁  鲁翠云  孙效文 《遗传》2007,29(10):1243-1248
以大头鲤/荷包红鲤抗寒品系的重组自交系群体及其遗传连锁图谱, 利用Windows Map Manager 2.0的标记回归法进行QTL单标记定位分析和复合区间作图法进行QTL区间检测, 通过置换实验(1 000次重复)确定连锁群显著性水平阈值。在体长性状的标记回归研究中, 共7个标记达到显著水平(P<0.01), 对性状的贡献率为14.00%~27.00%, 其中3个标记达到极显著水平(P<0.001)。HLJ534, HLJ319, HLJ370座位可能与影响鲤鱼体长性状的主效基因连锁。在体长性状的QTL区间定位研究中, 共6个QTL达到连锁群显著水平(P=0.05), 对性状的贡献率为11.33.%~23.12%, 其中2个达到连锁群极显著性水平(P=0.01), 它们的加性效应方向并不一致。HLJ190-HLJ497区间和HLJ479-HLJ483区间是影响鲤鱼体长性状的主效QTL区间。  相似文献
5.
利用17个微卫星标记分析鳙鱼的遗传多样性   总被引:22,自引:5,他引:17       下载免费PDF全文
选用本实验室克隆的17个鳙鱼微卫星分子标记分析四川泸州和江西鄱阳湖的两个种群鳙鱼的遗传多样性及种质特性,计算和统计了杂合度、多态信息含量(PIC)、有效等位基因数、等位基因频率、遗传距离、遗传相似系数、Hardy-Weinberg平衡偏离指数等方面内容。结果表明:选择使用17个微卫星标记,其中有4个为单态标记,13个为多态标记。江西和四川鳙鱼群体每个微卫星位点的平均等位基因数分别为3.325及3.882,平均有效等位基因数分别为3.531及2.676,多态位点百分率分别为82.4及70.5, 17个微卫星标记共有等位基因71个,多态微卫星位点的PIC在0.114~0.960之间变动,平均为0.417 ,两群体位点平均观测杂合度为0.385和0.452,平均期望杂合度为0.360和0.422,两个群体间的遗传相似系数为0.897,群体间的遗传距离为0.109。  相似文献
6.
鲤鱼微卫星标记与体重、体长和体高性状的相关分析   总被引:21,自引:2,他引:19       下载免费PDF全文
张义凤  张研  鲁翠云  曹顶臣  孙效文 《遗传》2008,30(5):613-619
利用47个鲤鱼微卫星标记, 对柏氏鲤和荷包红鲤抗寒品系自交F2代的92个个体基因组DNA进行检测, 得到162个等位基因, 各座位等位基因数2~6个, 片段长度100~444 bp, 有效等位基因数1.3069~4.2288, 杂合度0.2361~0.7677, 位点多态信息含量0.5368。利用统计软件SPSS的GLM程序对47个微卫星标记与鲤鱼体重、体长和体高相关性进行了分析, 结果表明HLJ695、HLJ716、HLJ739、HLJ759、HLJ774、K16与体重、体长和体高相关, HLJ776与体高相关。对同一标记不同基因型间进行多重比较, 找到与3种性状相关的基因型。  相似文献
7.
微卫星DNA标记探讨镜鲤的种群结构与遗传变异   总被引:17,自引:2,他引:15       下载免费PDF全文
全迎春  李大宇  曹鼎辰  孙效文  梁利群 《遗传》2006,28(12):1541-1548
采用30个微卫星分子标记, 对5个镜鲤群体的观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)和有效等位基因数(Ae)等进行了遗传检测, 根据基因频率计算遗传相似系数和Nei氏标准遗传距离, 以c2检验估计Hardy-Weinberg平衡, 以近交系数(FST)和基因流(Nm)分析群体的遗传分化。同时, 使用PHYLIP3.63软件绘制基于Nei氏标准遗传距离的UPGMA聚类图, 并进行bootstrap自举检验验证进化树的可靠性。在德国镜鲤选育系(Scattered Cyprinus carpio L.)和来自4个不同养殖场(松浦、东岗、奉城和辽中)的德国镜鲤群体中共检测到7 083个扩增片段, 长度在102 ~ 446 bp之间, 在群体内扩增出等位基因1~16个不等, 共计356个等位基因。结果表明: (1)5个群体检测的有效等位基因数在1.07~12.30个不等, 平均多态信息含量为0.74、0.74、0.69、0.75和0.75, 无偏期望杂合度的平均值为0.74、0.78、0.70、0.76和0.78, 说明这几个群体属于高度多态, 遗传多样性水平较高。(2)群体间相似系数在0.52以上, 相似性较高。聚类分析显示, 东岗、奉城和辽中3个养殖场的德国镜鲤群体聚类成一个分支, 而德国镜鲤选育系与松浦群体聚类成另一分支。聚类的先后与它们在地理分布上距离远近有一定的相关性。(3)在与功能基因相关的多个微卫星基因座位上, 扩增产物呈现不同程度的缺失现象, 这些无效等位基因的产生可能与结构基因在育种中受到人工选择的影响较大有关。  相似文献
8.
朱晓东  耿波  李娇  孙效文 《遗传》2007,29(6):705-713
摘要: 利用30对微卫星分子标记对长江中下游5个鲢群体进行了遗传多样性分析。结果表明: 在30个基因座中, 共检测到144个等位基因, 每个座位检测到的等位基因数为1~10个, 其中有25个座位具有多态性, 多态位点百分率为83.33,5个群体的平均等位基因数A为4.0/4.1, 平均有效等位基因数Ne为2.4445~2.6332, 平均观察杂合度Ho为0.3233~0.3511, 平均期望杂合度He为0.4421~0.4704, 平均多态信息含量PIC为0.4068~0.4286。对数据进行F-检验, Fst值表明群体间的遗传分化程度中等, 并对基因型进行了基于Hardy-Weinberg平衡的卡方检验, 所得P值说明5个群体均一定程度上偏离了平衡。5个群体间的遗传相似系数为0.8466~0.9146,遗传距离为0.0893~0.1665, 并根据Nei氏标准遗传距离用UPGMA方法对5个鲢群体进行亲缘关系聚类。  相似文献
9.
虾夷扇贝的多态性微卫星座位   总被引:15,自引:0,他引:15  
虾夷扇贝(Patinopectenyessoensis),为冷水性贝类,是世界最重要的养殖经济贝类之一。原产于俄罗斯千岛群岛的南部水域,日本北海道及本洲北部。中国80年代初从日本引种,并开始养殖,目前已经在黄海北部形成规模化和产业化养殖,其中以大连长海养殖规模最大,近10年来创造出了数十亿  相似文献
10.
虹鳟6个养殖群体遗传多样性的微卫星分析   总被引:12,自引:0,他引:12       下载免费PDF全文
赵莹莹  朱晓琛  孙效文 《遗传》2006,28(8):956-962
利用14对微卫星分子标记对虹鳟的6个养殖群体进行遗传多样性分析。结果表明:6个群体的平均等位基因数A为 2.89~4.22,平均有效等位基因数Ne 为2.15~2.78,平均观察杂合度Ho 为0.4801~0.6786,平均期望杂合度He 为0.5052~0.6211,平均多态信息含量PIC 为0.4298~0.5762;其中渤海站群体的等位基因数最多、多态信息含量最高,有效种群最大,通过基因型的P值发现6个群体只在位点AF375034符合Hardy-Weinberg平衡,在其他位点都不同程度的偏离平衡,同时对6个群体的遗传距离进行了估算,聚类分析发现挪威群体与其他群体遗传距离最远。  相似文献
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