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1.
转录组研究新技术:RNA-Seq及其应用   总被引:8,自引:0,他引:8  
Qi YX  Liu YB  Rong WH 《遗传》2011,33(11):1191-1202
转录组是特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理。RNA-Seq作为一种新的高效、快捷的转录组研究手段正在改变着人们对转录组的认识。RNA-Seq利用高通量测序技术对组织或细胞中所有RNA反转录而成的cDNA文库进行测序,通过统计相关读段(reads)数计算出不同RNA的表达量,发现新的转录本;如果有基因组参考序列,可以把转录本映射回基因组,确定转录本位置、剪切情况等更为全面的遗传信息,已广泛应用于生物学研究、医学研究、临床研究和药物研发等。文章主要介绍了RNA-Seq原理、技术特点及其应用,并就RNA-Seq技术面临的挑战和未来发展前景进行了讨论,为今后该技术的研究与应用提供参考。  相似文献
2.
以北方农牧交错带为研究对象,分析了免耕对农田土壤风蚀的影响,评价了不同耕作方式下与土壤风蚀相关的土壤物理、化学和生物学特性的差异。研究结果表明:翻耕农田土壤风蚀量是免耕地的3~8倍,翻耕地和免耕地的地表粗糙度分别为0.032和0.417;与翻耕地相比,免耕地表层0~10cm土壤粘粒和粉粒含量较多;免耕地土层0~5cm和5~10cm的土壤容重、坚实度和土壤水分都大于翻耕地,其中0~5cm、5~10cm和10~20cm土层土壤坚实度分别是翻耕地的4.7、2.8倍和3.8倍。经过3年的免耕,0~5cm土层土壤全氮、有机质、有效磷和有效钾含量均高于翻耕土壤,有效钾含量比翻耕地增加了77%。所有测定土层的土壤有机质含量免耕地均高于翻耕地,在0~5cm和5~10cm土层达到5%显著水平。免耕地表层0~10cm土壤微生物量碳是翻耕地的2.1倍。  相似文献
3.
The relationship of species abundance to eight environmental variables was tested for 24 common species of crustacean zooplankton collected in the Atchafalaya River Basin during the summer of 1994. Stepwise regressions (α = 0.05) revealed significant relationships between zooplankton abundance and at least one environmental variable for 18 species ( R2 = 0.14-0.61, p < 0.0435-0.0001). The majority of these species' peak abundances were correlated with variables indicative of seasonal changes in floodplain habitat, as the Atchafalaya river receded, water temperature increased, and/or phytoplanktonic photosynthesis increased. Surface water temperature and the percent saturation of dissolved oxygen showed the most significant relationships, but specific conductance, current velocity, and Secchi disk depths were also related to abundance patterns of certain taxa. A principal components analysis of species abundances provided further insight into the partitioning of temporally-distinct zooplanton assemblages, showing that several species ( Bosmina longirostris, Daphnia parvula, Eurytemora affinis, and Ceriodaphnia quadrangula) predominated during early summer, and were supplanted by a distinct late-summer assemblage ( Diaphanosoma birgei, Moina micrura, Mesocyclops edax, and Daphnia lumholtzi) as time progressed. The transitional assemblage was dominated by Simocephalus serrulatus, Macrocyclops albidus, Microcyclops rubellus, and Thermocyclops inversus, all of which were most abundant in the hypoxic conditions characteristic of the latter stages of the Atchafalaya River flood-pulse. This revised version was published online in July 2006 with corrections to the Cover Date.  相似文献
4.
内葵杂3号染色体核型分析   总被引:2,自引:2,他引:0       下载免费PDF全文
对内蒙古地区的栽培品种内葵杂3号三交种和单交种了进行了核型分析。其结果为:内葵杂3号三交种和单交种的染色体数均为2n=34,各具一对随体染色体。三交种第2对染色体具随体且为近中部着丝粒染色体,其余为中部着丝粒染色体,染色体相对长度变异范围4.105%~7.703%,核型公式为2n=2x=34=32m+2sm(2sat),核型类型属于1A型;单交种均为中部着丝粒染色体,第4对染色体具随体,染色体相对长度变异范围3.661%~8.128%,其核型公式为:2n=2x=34=34m(2sat),核型类型属于1B型。  相似文献
5.
对内蒙古西部公路绿化植物油松(Pinus tabulaeformis)、小叶杨(Populus simonii)及其根际土壤中重金属元素(Cd、Hg、Pb、Cu、Zn、Ni、Cr)和类金属元素(As和Se)含量以及根际土壤重金属(Cu、Zn、Pb、Ni和Cr)形态、土壤pH值进行了测定。对比分析了公路沿线不同绿化植物及其不同器官对重金属元素的吸收与积累特征。结果表明:绿化植物根际土壤对重金属元素的吸附及污染程度以Cd为最高。随原子序数的递增,小叶杨和油松两种植物的根部和茎叶两种营养器官中重金属的含量均表现出“N”字形变动趋势。而且重金属元素在不同植物不同器官中的含量具有Zn〉Cu〉Ni,Cr,As,Pb〉Cd〉Hg的基本规律。小叶杨茎叶对重金属元素Cr、Ni和Pb的富集能力较根部为强,油松茎叶对重金属元素Cr、Ni、Cu和Pb的富集能力较根部为强。绿化植物根际土壤重金属元素有效态占总量百分比的大小序列为Zn〉Pb〉Ni、Cr〉Cu,与重金属元素在不同植物不同器官中的含量大小序列Zn〉Cu〉Ni、Cr、As、Pb〉Cd〉Hg并非趋于一致。公路绿化植物对根际土壤中重金属元素的吸收和积累与重金属元素有效态所占的比例有关。  相似文献
6.
放牧方式对中蒙典型草原植物功能群特征的影响   总被引:1,自引:0,他引:1  
基于中蒙典型草原不同放牧方式,研究了不同放牧方式下中蒙典型草原植物功能群特征。结果显示,内蒙古定居放牧样地多年生草本比例显著低于其它放牧样地,比例为57.576%;而旱生植物比例显著高于其它放牧样地,比例为69.697%。蒙古四季游牧样地功能群多样性指数和优势度指数均高于内蒙古放牧样地,均匀度指数与多样性指数相反。功能群多样性指数与优势度指数间呈显著正相关(r>0.855,P<0.05);均匀度与多样性指数、优势度指数间均呈负相关。多年生和一年生草本植物、旱生和中旱生植物的生态位宽度均较大,从而导致多年生与一年生植物间、旱生与中旱生植物间生态位重叠值相应较大。说明,不合理的放牧导致草原植被群落退化,降低草原生态经济价值。  相似文献
7.
大沙鼠种群密度与降水量的关系   总被引:1,自引:0,他引:1  
大沙鼠(Rhombomys opimus)是中亚荒漠、半荒漠草原的典型鼠种,在荒漠草原多呈不连续的岛状分布,多集居于白刺(Nitraria sibirica)、盐爪爪(Kalidium foliatum)丛生的沙地或风成沙丘上的灌丛之间,是农、林、牧以及卫生防疫的重要害鼠。对其种群数量动态目前只有黄健和张大铭(2004)采用Leslie矩阵进行了研究。本文探讨了大沙鼠种群密度与降水量的关系,为其种群动态提供基础资料。  相似文献
8.
水、氮控制对短花针茅草原土壤呼吸的影响   总被引:1,自引:0,他引:1       下载免费PDF全文
在自然条件下,采用自动CO2通量系统(Li-8100, Li-COR, Lincoln, NE, USA)野外测定短花针茅(Stipa breviflora)草原土壤呼吸速率,并通过回归方程分析不同水分梯度和氮素添加与土壤呼吸速率间的关系。结果表明:(1)短花针茅草原整个生长季,增雨显著提高土壤呼吸速率(P < 0.05),土壤呼吸速率峰值出现在温度适中,土壤含水量最大的时期(8月初)。(2)从整个生长季来看,相同降雨量下,氮素添加对土壤呼吸速率增加有抑制作用,但在降雨较少的时(5月末到6月中旬,0月份),氮素添加对土壤呼吸速率有较少的促进作用。(3)土壤含水量和土壤呼吸速率的函数模型中一元二次函数模型明显优于线性、指数等模型。一元二次模型能更好地说明土壤呼吸速率的实际变化。  相似文献
9.
The involvement of melanocortin 4 receptor gene (MC4R) in food intake and body weight regulation is well characterized. MC4R mutations are the most frequent monogenic cause of human obesity. Significant associations have been revealed between MC4R mutations and productive traits in pigs, cattle and poultry. Herein, fluorescence-based conformation sensitive gel electrophoresis was used to identify two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the coding region (93G>A and 292G>A) and two SNPs in the 3′-UTR area (1016G>A and 1240T>C) of MC4R gene in 132 German Merino sheep. We found that the 1016G>A mutation in the 3′-UTR was significantly associated with body weight at 120 and 180 days, average daily gain, back fat thickness and loin-eye area. Allele A located at the 292th position of MC4R gene representing Arg98 was associated with significantly higher loin-eye area in sheep. For the synonymous 93G>A mutation, A allele carrier animals had higher back fat thickness. Our results provide evidence that the MC4R gene may be a candidate gene for growth and meat quality traits with MC4R SNPs being potentially valuable as genetic markers for economic traits in German Merino sheep.  相似文献
10.
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