海南岛宽额鳢(Channa gachua)群体遗传变异与生物地理过程

为了解海南岛宽额鳢(Channa gachua)的群体遗传分化和亲缘生物地理过程,采集了云南元江和海南岛5个水系(昌化江、陵水河、藤桥河、万泉河及南渡江)共6个种群168个宽额鳢个体,基于线粒体细胞色素b(Cyt b)基因全序列(1142 bp)对其遗传多样性和遗传分化程度进行了评估,并探讨了地质和气候等因素如何塑造了这一物种的亲缘地理结构及演化历史。基于Cyt b序列构建的系统树结果将所有个体分成两个主要谱系(A和B),谱系A包括海南岛所有种群,其中,部分昌化江个体形成独立的亚支(A2),其余个体聚为另一亚支(A1),谱系B为云南元江的全部个体,各谱系间的遗传分化指数均较高。种群历史动态分析表明,各谱系均没有发生种群扩张,但A1亚支与谱系B曾在约1万年前发生过有效种群数量减小的事件。根据研究结果推测,更新世冰期期间,北部湾因海平面下降而暴露,大陆和海南岛的水系发生接触,越南北部水系(包括元江/红河)通过一条联系雷州半岛和海南岛的古河道流入南海,因而冰期期间宽额鳢有机会从元江(红河)扩散至海南岛西南部,随后在海南岛内部,宽额鳢进一步扩散,并以五指山为种群间基因交流的重要地理障碍,各水系间种群发生基因交流和遗传分化。     

鄱阳湖浮游动物群落结构及其与环境因子的关系

数量庞大、体积微小、高度多样化的浮游生物对淡水生态系统功能具有重要影响。为探究中国第一大淡水湖——鄱阳湖浮游动物（包括轮虫、枝角类和桡足类）群落特征及其与环境因子之间的关系,本研究在鄱阳湖设置50个采样点,分别于2017年8月（夏季）、11月（秋季）、2018年2月（冬季）和5月（春季）进行浮游动物群落与生境调查,统计分析结果表明：鄱阳湖浮游动物共记录43属99种,其中轮虫31属83种,枝角类8属11种,桡足类4属5种,春夏季节种类较为丰富。浮游动物平均丰度为1155.29 ind./L,具有极显著的季节差异（P< 0.01）,夏季（3150.37 ind./L）显著高于其他三季。四季共确定优势种14种,轮虫中优势度最高的为广布多肢轮虫（Polyarthra vulgaris）,浮游甲壳动物中仅有简弧象鼻溞（Bosmina coregoni）在秋季形成优势。优势种的季节更替明显,夏秋季节间的更替率（86.00%）高于其他季节（77.00%,66.67%）。优势种、多样性和均匀度的结果均显示鄱阳湖浮游动物群落结构较复杂,具有较好的稳定性。聚类分析（Cluster analysis）和分类回归树分析（Classification and regression trees, CART）表明,每个季节均有多种群落类型,其中春夏两季中浮游动物群落类型的划分与叶绿素a（Chlorophyll a,Chla）密切相关,化学需氧量（Chemical Oxygen Demand,COD）是影响秋季群落划分的关键环境因子。非度量多维尺度分析（Non-metric multidimensional scaling,NMDS）结果表明,温度（Water Temperature,WT）、Chla、电导率（Conductivity,Cond）是造成四季浮游动物群落显著差异的最主要环境因子。冗余分析（Redundancy analysis,RDA）显示,除Chla外,总氮（Total Nitrogen,TN）、总固体悬浮物（Total Suspended Solids,TSS）和酸碱度（Hydrogen ion concentration,pH）也是影响浮游动物群落结构和优势种分布的重要因素。     

中华真地鳖共附生放线菌DB2C2的筛选和鉴定

利用稀释平板法从中华真地鳖体内分离得到52株共附生放线菌,活性筛选表明菌株BD2C2具有较好的抗菌活性,其发酵液对金黄色葡萄球菌的抑菌圈直径超过23mm,对枯草芽胞杆菌的抑菌圈直径约17.5mm,对大肠杆菌也有一定的抑制作用。进一步研究表明其活性物质主要集中在中等极性部位。在供试浓度为每张滤纸片30μg时,菌株BD2C2发酵液的乙酸乙酯提取物对金黄色葡萄球菌、枯草芽胞杆菌和大肠杆菌的抑菌圈直径分别约27.5、22.4和10.7mm,其抑制活性与阳性对照硫酸庆大霉素相当。利用形态学观察和分子生物学方法初步鉴定该菌为Streptomyces sp.,为一个潜在新种。作为微生物源杀菌剂,DB2C2具有一定开发潜力,值得进一步研究。     

鸭源H6N6亚型AIV荧光定量PCR方法的建立及应用

[目的]为检测鸭感染H6N6亚型AIV后排毒及在组织器官病毒分布情况。[方法]通过建立H6N6亚型AIV荧光定量PCR检测方法,以H6N6亚型AIV M基因保守序列设计特异性引物,将分离到的H6N6亚型AIV病毒反转录为cDNA,进行pMD18-T-M基因克隆质粒构建,以其为标准品建立荧光定量PCR标准曲线,并进行敏感性和重复性试验,利用所建立的方法检测鸭感染H6N6亚型AIV后排毒及在组织器官病毒分布情况。[结果]该方法灵敏度高,最低检测到1.0×10^(1) copies/μL,从而可以得出拷贝数与Ct值之间的线性关系曲线表达式:Ct=-3.408×lg Copynumber+33.773(R^(2)=0.998),线性范围为1.0×10^(7)~1.0×10^(1)拷贝/μL,熔解峰的熔解温度在83℃左右。[结论]表明建立的鸭源H6N6亚型AIV荧光定量PCR检测方法,特异性强,重复性好,为后续实验研究提供了技术和数据支撑。