基于转录组的池蝶蚌系统发育及其遗传分析

池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)和三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)的亲缘关系一直存在争议, 为了更深入地对淡水珠蚌进行系统发育分析, 研究对池蝶蚌及其3个近缘物种三角帆蚌、褶纹冠蚌(Cristaria plicata)和背角无齿蚌(Anodonta woodiana)的转录组进行了比较分析。对它们共有单拷贝同源基因进行多序列联配后计算这4种淡水珠蚌之间的遗传距离, 结果表明池蝶蚌和三角帆蚌的遗传距离只有0.00746(小于1%), 而其他淡水珠蚌之间的遗传距离几乎是它的10倍(平均大于6%)。系统发育分析表明, 小方蚌亚科与无齿蚌亚科大约在5144万年前发生分歧, 而池蝶蚌和三角帆蚌发生分化的时间大约在424万年前。进一步的遗传差异分析鉴定了池蝶蚌转录组中的特有基因, 其中KEGG 通路富集的结果表明这些基因主要富集在免疫细胞膜分子和蛋白消化吸收等通路上。同时, GO注释结果表明有很多特有基因与池蝶蚌的优良性状相关, 如与发育相关的生长发育、系统发育和动物器官发育等生物学过程, 及与免疫相关的免疫系统过程、抗原处理和呈递等生物学过程。以上结果表明, 池蝶蚌和三角帆蚌具有更近的亲缘关系, 它们可能是同一物种的不同亚种或不同种群, 这对淡水珠蚌种质资源的保护和遗传育种具有重要参考意义。此外, 相比于三角帆蚌, 池蝶蚌可能具有一些与生长发育及免疫相关的特有基因, 这为探究相关的分子机制提供了线索。     

颈动脉粥样硬化及主动脉瓣钙化与动脉粥样硬化性肾动脉狭窄的关系

目的:探讨颈动脉粥样硬化、主动脉瓣膜钙化(aortic valve calcification,AVC)与动脉粥样硬化性肾动脉狭窄(atherosclerotic renal artery stenosis,ARAS)的关系。方法:对我院162例行选择性冠脉造影合并肾动脉造影的患者进行颈动脉超声和超声心动图检查,测量颈动脉内中膜厚度(carotid artery intima-media thickness,CIMT)和主动脉瓣钙化的情况,根据患者是否患有ARAS进行分组,比较两组的性别、年龄、吸烟、病史、血脂水平、CIMT、颈动脉粥样硬化发生率和AVC发生率,计算颈动脉粥样硬化和AVC对ARAS的预测价值。结果:ARAS组高血压病史患者的构成比、胆固醇水平、CIMT、颈动脉粥样硬化发生率、AVC发生率均显著高于对照组,有明显的统计学差异(P0.05)。颈动脉粥样硬化预测ARAS的灵敏度较高,特异度偏低;AVC的灵敏度低,而特异度高;二者联合特异度明显增高。结论:颈动脉粥样硬化、AVC对ARAS的诊断有一定的参考价值,可用于排除诊断。     

Atg11的功能研究进展

Atg11利用自身众多螺旋结构域作为支架蛋白,主要介导选择性自噬过程中自噬体的形成.选择性自噬可特异性清除损坏的生物大分子和细胞器,在真核生物的胞内物质周转及细胞器质量控制中起重要作用.本文首先介绍了Atg11的结构特点,其次重点介绍了Atg11在3种选择性自噬(细胞质到液泡靶向(Cvt)途径、过氧化物酶体自噬和线粒体自噬)中的作用,最后概括了Atg11的其他功能.本文系统总结了近几年关于Atg11的研究进展,以期为自噬体形成机制研究及Atg11在自噬体形成过程中的功能研究提供参考.     

BMI及LDL-C水平与冠脉慢血流的相关性研究

目的:探讨低密度脂蛋白胆固醇及身高体重指数与冠状动脉慢血流现象(Coronary slow flow phenomenon,CSFP)的相关性。方法:在我院2013年上半年因不典型胸痛行冠脉造影术患者中,选取冠脉官腔无明显狭窄(40%)且至少一支冠脉根据校正的TIMI血流分级方法被评为慢血流的患者进入慢血流组(CSFP组)79例,选取同期无明显狭窄且血流速度正常的患者71例为对照组,对两组入院各项常规检查检验指标进行分析,筛选导致冠脉慢血流的危险因素。结果:在两组比较中,CSFP组的慢血流组吸烟率、身体质量指数(Body Mass Index,BMI)、甘油三酯(Triglyceride,TG)、低密度脂蛋白胆固醇(Low density lipoprotein cholesterol,LDL-C)、尿酸(Uric acid,UA)水平明显高于对照组;亚组分析中显示BMI、LDL-C水平随受累血管数量增多呈上升趋势,且具有统计学意义;经回归分析,显示BMI、LDL-C水平的升高对冠脉慢血流的发生有显著影响,且与冠脉血流速度(帧数)呈正相关。结论:BMI、LDL-C水平与冠脉慢血流的发病的密切相关。     

池蝶蚌IκBα和c-Rel的结构特征及在LPS刺激下的表达分析

为研究淡水贝类NF-κB/Rel信号通路中核因子κB(Nuclear factor-κappaB, NF-κB)和NF-κB抑制因子(Inhibitors of NF-κB, IκB)的功能,对池蝶蚌(Hyriopsis schlegelii)IκBα和c-Rel(以下简称HsIκBα和Hsc-Rel)的序列结构、表达特征及Hs IκBα和Hsc-Rel之间的相互关系进行了分析。结果表明, Hs IκBα的c DNA全长为1783 bp,其开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)为1083 bp,编码360个氨基酸。Hsc-Rel的cDNA为2414 bp, ORF为2298 bp,编码765个氨基酸。通过构建HsIκBα-ORF-GST和Hsc-Rel-RHD-HIS重组质粒、原核诱导表达和纯化,进行GST-pull down,通过SDS-PAGE和Western Blot检测研究,发现HsIκBα和Hsc-Rel-RHD存在直接的相互作用。通过对池蝶蚌进行脂多糖(Lipopolysaccharide, LPS)刺激后,分别在7个时间点(0、6h、12h、24h、...     

老年主动脉瓣钙化与冠心病合并心律失常的相关性探讨

目的:探讨老年患者主动脉瓣钙化与冠心病合并心律失常的相关性。方法:纳入解放军总医院疑诊为冠心病的老年住院患者276例,行冠状动脉造影,同期行超声心动图和24 h动态心电图检查,详细记录患者病史。根据超声结果,将患者分成主动脉瓣钙化(AVC)组和非主动脉瓣钙化(NAVC)组,比较两组冠心病合并心律失常的检出率,评价老年患者主动脉瓣钙化对冠心病合并心律失常的预测价值。结果:AVC组和NAVC组的年龄、吸烟史、高血压史、糖尿病史存在显著性差异(P0.05);AVC组冠心病的确诊率为93.7%,而NAVC组为80.6%,两组差异有统计学意义(P=0.002);AVC组冠心病合并心律失常检出率也显著性高于NAVC组(59.2%vs 35.1%,P=0.043)。结论:主动脉瓣钙化与冠心病合并心律失常密切相关,有望作为冠心病合并心律失常的高危患者有效的筛查指标。