糖单孢菌16S rDNA的PCR RFLP分析

PCRRFLP分析适用于种和种间水平的多相分类研究。文章对PCRRFLP方法应用于糖单孢菌属分类的具体方法进行了探讨;报道了一组适于糖单孢菌属PCRRFLP分析的限制性内切酶,并用这组酶对6株糖单孢菌属分离株进行了研究,进一步探讨了实验菌株在该属的分类地位。同时指出了PCRRFLP方法应用中应注意的问题。     

一种从土壤样品中选择性分离假诺卡氏菌的方法

为提高假诺卡氏放线菌的分离效率,根据其营养特性和对抗生素的敏感性,设计、检验了5种选择性分离培养基;实验检测了模式菌株在不同培养基上的生长情况,结果表明培养基S1和S2对假诺卡氏菌的生长有显著的选择性。经该方法从韩国、印度尼西亚和中国广西地区不同土样中分离到一些假诺卡氏放线菌。     

除莠活性链霉菌的系统发育研究及其活性产物分析

从云南地区土壤中分离到一株具有除莠活性的放线菌（Actinomycetes）,对其产生的活性物质进行了分离、纯化及分析。从该菌株的发酵液中获得了有除莠活性的黄色结晶,薄板层析的结果表明,该结晶为多组分混和物,且每一组分均具有除莠活性。通过红外分析对其组分作了初步鉴定。同时对该菌株进行了形态、化学及系统发育学研究,根据16S rDNA全序列构建了系统发育树,结果表明此菌株应属于链霉菌属（Streptomyces）,同时具有耐低温和耐盐的特性。     

微生物学研究型设计性实验教学改革与实践

生命科学及生物产业的迅速发展对高校学生实践能力和创新能力的培养提出了更高要求。为了提高生物技术和生物工程专业学生的实践能力和科研创新能力,我们在微生物学实验教学中开展了研究型设计性实验教学改革,并针对研究型设计性实验项目的内容特点及其在教学过程中存在的常见问题,总结出一套较为完善的教学设计方式和过程管理模式。为期12年的实践表明,开展研究型设计性实验教学对于促进学生的专业学习,提高其实践能力及科研创新能力作用显著。研究型设计性实验教学是具有推广意义的教学新模式。     

假诺卡氏菌科的分类学研究进展*

假话卡氏菌科是一类进化上相近、形态各异、胞壁肽聚精含有Meso－－DAP（内消族二氨基庚二酸）、全细胞水解液中含有半乳糖和阿拉伯糖、不含枝菌酸的放线菌[1-3]。该科的许多成员都能产生重要的生物活性物质,见表1[4],包括抗生素、酶类、维生素等。其中如红霉素、利福霉素等已商业化,产生了巨大的社会和经济效益。在当今的生物活性物质筛选中,这类放线菌被看作是最有希望获得新的抗生素、酶制剂等生物活性物质的资源菌;此外,该科在环境污染的治理上也有广阔的前景,如假诺卡氏菌属的一些种可以将工业上大量产生的甲基硫化物分解为无…     

链孢囊菌属3种分子分类方法的对比

链孢囊菌属（Streptosporangium）是链孢囊菌科（Streptosporangiaceae）的模式属,包含13个种．种的鉴别通常是多相分类方法,其中尤以DNA同源性分析为国际公认的定种标准;全基因组杂交同源性在70%以下的为不同种．但在进行大量菌株的比对时操作比较复杂．本实验以链孢囊菌属15株标准菌株为实验菌株,选择适宜引物,对其基因组DNA的16S-23S rDNA 间隔区序列（ITS）和REP序列进行了扩增,分别获得了两种基因指纹图谱,并通过UPGMA聚类法构建了相应的进化距离树图．结果表明,对于链孢囊菌属中不同种的区分,两种基因图谱技术的分辨力相当,且两种方法呈现的菌株间同源性与DNA-DNA杂交的结果吻合,有望为链孢囊菌属分类学的研究提供简单、准确、快速的标准程序．     

α-变形菌纲新的保守特征性插入缺失

在基于16S rRNA基因的分类系统中α-变形菌被定为变形菌门的一个纲。本文根据系统发育基因组学分析,首次发现并鉴定了α-变形菌纲普遍存在的5个保守特征性插入缺失(CSIs)。23S rRNA基因具有1个98~105 nt的特征性缺失和1个5~7 nt的特征性插入,DNA复制解旋酶(DnaB)具有1个17~29 aa的特征性插入,精氨酰-tRNA合成酶(ArgRS)具有1个15 aa的特征性插入,DNA促旋酶A亚基(GyrA)具有1个27~63 aa的特征性插入。α-变形菌纲的这些CSIs使得该纲与包括变形菌门其他纲在内的其他细菌显著区分开来,为该群细菌系统发育及系统分类研究提供了可靠手段。     

糖单孢菌16S rDNA的PCR-RFLP分析

ＰＣＲ－ＲＦＬＰ分析适用于种和种间水平的多相分类研究。文章对ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法应用于糖单孢菌属分类有具体方法进行了探讨;报道了一组适于糖单孢菌属ＰＣＲ－ＰＦＬＰ分析的限制性内切酶,并用这组酶对６株糖单孢菌属分离株进行了研究,进一步探讨了实验菌株在该属的分类地位。同时指出了ＰＣＲ－ＲＦＬＰ方法应用中应注意的问题。     

脆弱拟杆菌在炎症性肠病、结直肠癌促进、调控及防治中的作用

近年来人们越来越重视肠道菌群在肠源性疾病的发生、发展及防治中所发挥的作用。脆弱拟杆菌(Bacteroides fragilis,BF)是定殖于人体肠道中的共生菌,对肠道健康有多种影响,是健康人群及腹泻、腹膜炎、腹内脓肿、败血症、炎症性肠病等临床病例最常见的肠道微生物。随着人们对脆弱拟杆菌的深入研究,发现脆弱拟杆菌与炎症性肠病(inflammatory bowel disease,IBD)、结直肠癌(colorectal cancer,CRC)有密切关系。通过对脆弱拟杆菌与IBD、CRC之间的关系进行综述,探究脆弱拟杆菌在IBD、CRC促进、调控及防治中的作用,为IBD、CRC的早期干预和治疗提供新思路,为开发基于脆弱拟杆菌的药物提供数据与思路。     

“微生物学”教学内容须与时俱进：对放线菌的认知演变及研究进展

“微生物学”是生物科学类各专业的专业基础课,同时也是一门实践性和科研性很强的学科,学科理论的发展与生物技术的革新是互相促进、相辅相成的。在科学技术高速发展,科研成就层出不穷的今天,“微生物学”教学内容必须与时俱进,紧跟学科发展步伐,体现出学科前沿探究的最新成果。本文以放线菌的认知及其分类地位的演变为例,阐述“微生物学”课程中放线菌篇章的内容革新,旨在促进更加合理的“微生物学”课程教学体系的建设,以期提高教学水平,为高质量培养生物科学类专业技术人才奠定基础。