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目的:找出胶质瘤病变发生机制相关的基因群,并在此基础上建立预测胶质瘤病变发生的预测模型。方法:收集GEO中胶质瘤芯片数据,使用关联特征选择(Correlation-based Feature Subset, CFS)和最小冗余最大相关性(Minimum Redundancy MaximumRelevance, mRMR)特征选择方法筛选出差异基因,分析这些差异基因的功能,然后使用Adaboost算法建立胶质瘤的预测模型,并对模型的预测能力进行评估。结果:通过特征筛选,得到了19个和胶质瘤病变相关的的基因;以该19个基因建组成特征子集,结合AdaBoost算法建立了胶质瘤的预测模型,经验证,模型的预报准确率可以达到95.59%。通过对19个差异基因的GO和KEGG分析,发现这些基因和肿瘤的发生发展有一定作用。结论:CFS-mRMR特征筛选方法可以有效地发现与胶质瘤疾病有关的基因,所筛选的19个差异基因具有生物学意义,且以此构建的胶质瘤预测模型,可以有效地对预测胶质瘤的发生。 相似文献
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浮游动物化学计量学稳态性特征研究进展 总被引:5,自引:1,他引:4
稳态性是有机体的基本属性,也是生态化学计量学理论成立的前提和基础。一般来讲,浮游植物的元素组成变化较大,而浮游动物具有明显的稳态性特征。浮游动物稳态性特征的研究不仅有助于了解水生生态系统的能量流动和物质循环,同时也对研究营养元素如何调节生物生长、繁殖和代谢起到促进作用。在综述生态化学计量学研究的基础上,主要介绍了稳态性的概念和浮游动物稳态性特征的基本框架及变化规律,以期为促进国内相关研究工作的开展提供参考。 相似文献
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2004年8月通过对三亚珊瑚礁水域纤毛虫进行表、底层采集分析,共鉴定6纲14目33属58种浮游纤毛虫,其中旋毛纲41种,叶口纲6种,寡膜纲5种,叶咽纲4种,前口纲和伪纤毛纲各1种。在14个目中,以旋毛纲环毛亚纲砂壳目纤毛虫种类最多,达到31种。主要优势种为布氏拟铃虫 Tintinnopsis bütschlii、小拟铃虫 Tintinnopsis minuta、丁丁急游虫Strombidium tintinnodes和具沟急游虫Strombidium sulcatum等,底层纤毛虫数量和种类都较表层高,底、表层平均丰度分别为375个/L和346 个/L,表、底层纤毛虫种类差异明显,表层主要由浮游纤毛虫组成,以旋毛纲环毛亚纲砂壳目纤毛虫为主,急游目纤毛虫次之;而底层主要由缘毛目组成,如长圆靴纤虫 Cothurnia oblonga、透明鞘居虫Vaginicola crystalline、钟虫Vorticella sp.以及吸管目的壳吸管虫 Acineta sp. 等。结果显示,在活珊瑚覆盖率高的站位(S4,S7和S9)纤毛虫数量明显低于珊瑚覆盖率低或没有珊瑚覆盖的站位,这暗示了珊瑚对纤毛虫的摄食作用。典型对应分析结果表明,影响三亚湾海域纤毛虫分布的主要因素有Chla、颗粒悬浮物SS和活性磷,以及水体溶解有机碳含量。通过对纤毛虫数量与环境因子关系的分析表明,三亚湾珊瑚礁水域纤毛虫的数量与叶绿素呈明显的正相关性。 相似文献
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