鲟鳇鱼网箱养殖环境微生物菌群结构及潜在病原菌分析

为探究鲟鳇鱼网箱养殖环境中的细菌群落结构组成和潜在致病菌的种类与数量, 文章用高通量测序对中华鲟Acipenser sinensis、施氏鲟Acipenser schrenckii、达氏鳇Huso dauricus、大杂交鲟A. schrenckii♂×H. dauricus♀等网箱养殖水体的细菌群落结构特征和潜在病原菌属进行分析, 同时应用实时荧光定量PCR方法对鲟鳇鱼养殖水体中的典型病原菌种进行定量检测。研究结果表明, 在同一水域同一管理条件下, 不同品种鲟鳇鱼网箱养殖水体中细菌群落结构组成相似度高, 优势菌门由Proteobacteria、Actinobacteria、Bacteroidetes、Verrucomicrobia和Planctomycetes组成, 占到所有样品序列总数的88.81%—93.94%; 在属水平上, 各样品未分类的细菌(unclassified)占比较大, 共发现鲟鳇鱼潜在致病细菌菌属7个: Aeromonas、Acinetobacter、Chryseobacterium、Edwardsiella、Flavobacterium、Pseudomonas和Vibrio。实时荧光定量PCR结果显示, 养殖水体中鲟鳇鱼病害常见的病原菌种Aeromonas hydrophila的丰度最高, 丰度值为(7406±1892) copies/mL; 其次为Flavobacterium columnar[(4889±1649) copies/mL]和Pseudomonas fluorescens[(3259±1117) copies/mL]。研究结果为该区域的鲟鳇鱼集约化养殖及疾病防控提供科学依据。     

小瓜虫在澳洲龙纹斑鳃器官上的分布及其影响

【目的】小瓜虫病是澳洲龙纹斑苗种阶段危害巨大的寄生虫病。探究小瓜虫在澳洲龙纹斑鳃器官上的分布及其影响可以丰富小瓜虫的致病性及病理学方面的研究内容,也可以为渔业生产中小瓜虫病的防治提供参考。【方法】采用光镜及扫描电镜技术确定病原,并观察小瓜虫在澳洲龙纹斑鳃丝、鳃小片及鳃盖上的分布情况及这些器官的变化情况。【结果】小瓜虫侵染澳洲龙纹斑的鳃器官后,分布在鳃丝、鳃小片及鳃盖的表面,上皮细胞之下及鳃小片之间,或是包裹在黏液细胞里,但侵染后期在鳃丝及鳃小片上的数量明显少于鳃盖。侵染后期,鳃丝、鳃小片及鳃盖出现一定程度的膨胀变形,黏液细胞分泌增多,鳃小片末端膨大变形甚至黏连融合,顶端充血呈球状或棒状。【结论】对于鳃部而言,侵染后期小瓜虫主要分布在澳洲龙纹斑的鳃盖上。小瓜虫主要通过侵染引发澳洲龙纹斑鳃部器官的变形膨大,使其丧失正常的功能,造成血液循环受阻、渗透压调节失衡,最终导致鱼体缺氧死亡。     

武夷山常绿阔叶林土壤微生物多样性的季节动态

为了解武夷山自然保护区常绿阔叶林土壤微生物群落特征和季节变化,采用Illumina Miseq高通量测序技术分析了土壤微生物多样性的季节响应。结果表明,武夷山常绿阔叶林土壤为典型的南方酸性土壤,有效钾、土壤温度四季内存在显著差异,其他理化指标均无显著差异。土壤中的微生物多样性比较丰富,已鉴定出23门206属细菌和2门17属的古菌。夏季反映细菌总数的Chao指数最高,但反映细菌多样性的Shannon指数比春季低0.21,夏季古菌的Chao指数和Shannon指数分别比冬季高21.7%和0.27%。4个季节共有的细菌和古菌分别占总数的83.1%和70.0%,说明武夷山常绿阔叶林土壤不同季节的核心微生物组成具有很好的稳定性。在门和属水平的聚类树分析表明,春季和冬季的细菌和古菌群落组成最为接近,而夏季与其他3个季节的差异最大。冗余分析和热图分析结果表明,土壤p H是决定和影响细菌和古菌多样性的主要环境因子,有效钾、有效碳和总氮对微生物群落组成均有很大的影响。因此,随季节变化武夷山常绿阔叶林土壤微生物多样性呈现出规律性变化。