单增李斯特菌新疆分离株lmo2193基因克隆及序列分析

根据GenBank中的lmo2193基因序列设计特异性引物,利用PCR方法对lmo2193基因进行扩增,将扩增产物克隆到pMD19-T载体,测序后对基因核苷酸序列进行分析,预测其编码蛋白质的二三级结构,对其进行同源性及遗传变异分析。新疆分离株LM90SB2的lmo2193基因序列全长为1 303 bp,包含1 077 bp开放阅读框,共编码358个氨基酸;LM90SB2株lmo2193基因核苷酸序列与NTSN、F2365、81-0582、10-0809、02-1792相似性为99.99%;与SLCC2755、H34、WSLC1019相似性为99.3%～99.7%;与C1-387、L2625、10-4754、lm3136相似性为98.2%～98.3%。推导的氨基酸同源性为95.3%～99.7%。分子进化树表明,LM90SB2菌株lmo2193基因与4b型菌株的亲缘关系较近。蛋白质二级结构预测表明,LM90SB2 lmo2193蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,不形成跨膜结构。蛋白结构域预测,lmo2193蛋白为ATP酶。成功克隆LM90SB2基因,为进一步研究LM90SB2的lmo2193基因功能提供一定依据。     

单增李斯特菌lmo2192基因克隆与表达

[目的]对单增李斯特菌新疆绵羊脑炎临床分离株LM90SB2的lmo2192基因进行克隆及原核表达。[方法]利用PCR方法扩增lmo2192基因,连接p MD19-T载体进行克隆,筛选阳性菌进行测序比对。构建重组表达质粒p ET32a-2192,将其转入大肠杆菌感受态细胞,经诱导表达,利用SDS-PAGE与Western Blotting鉴定重组蛋白。[结果]扩增lmo2192基因序列长度为969 bp,与预期一致。该基因在大肠杆菌中大量表达,经SDS-PAGE和Western Blotting鉴定分析该产物为56 k Da左右的融合重组蛋白,与预期大小一致。[结论]成功克隆lmo2192基因,并获得大量表达,为进一步研究该基因功能奠定理论基础。     

单增李斯特菌新疆分离株lmo0160基因克隆及序列分析

【目的】单增李斯特菌是一种重要的食源性致病菌,常引起人和动物致病。其细胞壁表面LPXTG基序蛋白在单增李斯特菌致病过程中发挥重要作用,根据参考株全序列预测的41个LPXTG基序蛋白中仍有部分蛋白功能未知。对单增李斯特菌新疆绵羊脑分离株LM90SB2的LPXTG基序蛋白Lmo0160的基因进行克隆及生物信息学分析,为功能验证提供基础。【方法】根据GenBank中收录的lmo0160序列设计特异性引物,利用PCR方法对新疆分离株的lmo0160基因进行扩增,将扩增产物克隆到pMD 19-T载体,进行PCR、双酶切鉴定及序列测定,并对基因核苷酸序列和蛋白序列进行分析。【结果】分离株LM90SB2的lmo0160序列全长为1 708 bp,包含1 428 bp的开放阅读框,共编码475个氨基酸;LM90SB2株lmo0160核苷酸序列与CFSAN008100株(4b型,美国)、CFSAN023463株(4b型,美国)、J2-064株(4b型,美国)、F2365株(4b型,奶酪,美国)和NTSN株(4b型,绵羊脑,中国扬州)相似性为99.0%-99.1%;与M7株(4a型,牛奶,中国浙江)相似性为97.2%,与Finland1998株(1/2a型,美国)、N53-1株(1/2a型,熟火腿,瑞士)、N1546株(1/2a型,鱼,丹麦)和EGD-e株(1/2a型,美国)相似性为87.2%-91.1%;其推导的氨基酸序列与上述菌株相似性为91.8%-99.4%。系统进化树显示,LM90SB2菌株的lmo0160基因与CFSAN023463、F2365和NSTN菌株亲缘关系较近,处于同一分支上,而与标准株EGD-e菌株亲缘关系较远。蛋白质二级结构预测表明,LM90SB2的Lmo0160蛋白为亲水性蛋白,无信号肽,不形成跨膜结构。蛋白结构域预测表明Lmo0160蛋白含有胶原蛋白结合域和Cna B结构域。【结论】克隆了LM90SB2的lmo0160基因,为进一步研究LM90SB2的lmo0160基因功能奠定了基础。