火龙果茎基因组DNA提取方法改良

火龙果(Hylocereus undulatus)是近年发展起来的一种新兴热带水果, 其茎富含多糖、多酚及其它次生代谢物, 黏性极大, 很难从中提取高质量的DNA。特别是一年生以上的老茎, 目前尚未有较好的DNA提取方法。为了解决这一难题, 该研究对CTAB+Tris-HCl洗涤法进行了3种方式的改良。结果表明, “改进三”方法可不受取样时期和取样部位的限制, 从一年生以上火龙果茎中提取的DNA质量最好且不含黏性物质, 可用于酶切与分子标记等生化和分子生物学实验。该研究探索了一条较为理想的火龙果茎DNA提取方法, 值得推广应用。     

幽门螺旋杆菌阳性胃癌组织microRNA-1290、microRNA-134表达与肿瘤增殖基因、侵袭基因和预后的关系分析

摘要 目的：探讨幽门螺旋杆菌（Hp）阳性胃癌组织中微小核糖核酸-1290（miR-1290)、微小核糖核酸-134（miR-134）的表达及其与肿瘤增殖基因、侵袭基因和预后的关系。方法： 选取2016年1月至2017年1月重庆大学附属三峡医院收治的126例胃癌患者为研究对象，根据Hp检测结果分为Hp阳性胃癌组（n=84）和Hp阴性胃癌组（n=42），另同期60例慢性胃炎患者为对照组。实时荧光定量聚合酶链反应检测各组组织中miR-1290、miR-134、增殖基因[磷脂酰肌醇3催化亚基A（PIK3CA）、C-myc癌基因（c-myc）]和侵袭基因[碱性螺旋环-螺旋转录因子(Twist)、N钙黏素（N-cad）]的表达。Pearson相关分析Hp阳性胃癌组织miR-1290、miR-134与肿瘤增殖PIK3CA、c-myc和侵袭基因Twist、N-cad表达的相关性，比较不同临床病理特征Hp阳性胃癌患者miR-1290、miR-134表达差异。Kaplan-Meier生存曲线评估miR-1290、miR-134表达与Hp阳性胃癌患者生存预后的关系。结果：Hp阳性胃癌组患者癌组织miR-1290表达高于Hp阴性胃癌组癌组织及对照组胃粘膜组织，miR-134表达低于Hp阴性胃癌组癌组织及对照组胃粘膜组织，差异有统计学意义(P<0.05)。Hp阳性胃癌组织中miR-1290表达与增殖基因PIK3CA、c-myc和侵袭基因Twist、N-cad mRNA表达呈正相关性（r=0.620～0.725，均P<0.05），miR-134与增殖基因PIK3CA、c-myc和侵袭基因Twist、N-cad mRNA表达呈显著负相关性（r=-0.670～-0.784，均P<0.05）。不同肿瘤TNM分期、浸润深度及淋巴结转移Hp阳性胃癌患者癌组织中miR-1290、miR-134表达比较，差异具有统计学意义(P均<0.05) 。Hp阳性胃癌组患者中，miR-1290高表达组和低表达组5年总体生存率分别为48.78%（20/41），75.61%（31/41）。miR-1290高表达组患者累积生存率明显低于miR-1290低表达组(Log rank χ²=6.366，P= 0.012)。miR-134低表达组和高表达组患者5年总体生存率分别为42.86%（18/42），82.50%（33/40）。miR-134低表达组累积生存率显著低于miR-134高表达组(Log rank χ²=10.640，P=0.001)。结论：Hp阳性胃癌组织miR-1290表达增加，miR-134表达降低，两者可能通过促进肿瘤增殖和侵袭基因的表达，导致肿瘤恶性进展及不良预后。     

水稻金属耐受蛋白基因OsMTP2生物信息学及表达分析

为了解水稻(Oryza sativa)响应重金属污染及对重金属积累的机制,利用生物信息学手段对水稻金属耐受蛋白(metal tolerance protein, MTP) OsMTP2的结构特征进行预测,并分析OsMTP2基因的表达特征。结果表明,该蛋白由415个氨基酸组成,具有很强的疏水性。mRNA原位杂交结果表明,OsMTP2在叶片输导组织中有较强的表达,但在根、花药中没有检测到明显的杂交信号。这说明水稻金属耐受蛋白基因OsMTP2主要在输导组织中表达,并在金属离子运输中发挥重要作用。     

非洲菊试管苗叶柄愈伤组织的诱导与分化研究

以非洲菊(Gerbera janesonii Bolus)品种‘Sunanda'试管苗幼叶的带叶叶柄为材料,研究了培养基、外植体类型和继代次数等因素对愈伤组织诱导及分化的影响.结果表明:培养基上附加不同植物生长调节剂所诱导出的愈伤组织在形态和分化能力上存在显著差异,叶柄基部诱导愈伤组织的最适培养基是MS+TDZ 0.3 mg L-1+NAA0.1 mg L-1.外植体以叶片长度＞0.5 cm,叶片已舒展,颜色嫩绿的幼叶最佳,继代培养基以MS+KT 1.0 mg L-1较适宜,愈伤组织在分化培养基MS+6-BA 2.0 mg L-1+NAA 0.1 mg L-1上分化出芽的同时还会增殖,分化率达87.4%,继代培养2次的愈伤组织分化率可提高至95%.不定芽在生根培养基1/2MS+IBA0.6 mg L-1上的生根率达100%,试管苗移栽45 d后,成活率达97%以上.     

厚藤脱水素基因IpDHN启动子IpDHN-Pro的克隆和调控转录活性分析

为了解厚藤(Ipomoea pes-caprae)脱水素基因IpDHN (GenBank登录号:KX426069)启动子的转录活性和对非生物胁迫和植物激素ABA的响应,通过染色体步移法克隆了IpDHN的上游启动子序列IpDHN-Pro,长度为974 bp。构建IpDHN-Pro调控下GUS转基因载体,转化拟南芥(Arabidopsis thaliana)植株获得IpDHN-Pro::GUS转基因植株并进行GUS染色,验证IpDHN-Pro启动转录活性以及在氯化钠、甘露醇、ABA处理后拟南芥GUS基因表达变化。结果表明,扩增获得的IpDHN-Pro序列包含多个顺式作用元件,包括1个ABRE、3个Myb转录因子结合位点、富含TC的重复序列以及Skn-1基序等。转基因拟南芥GUS染色及qRT-PCR表明该序列可驱动GUS基因在拟南芥稳定表达,且表达受高盐、渗透压及ABA的诱导。这表明IpDHN-Pro是一个盐旱、ABA诱导的启动子序列,可应用于相关的植物抗逆遗传工程研究。     

火龙果茎基因组DNA提取方法改良

火龙果(Hylocereus undulatus)是近年发展起来的一种新兴热带水果, 其茎富含多糖、多酚及其它次生代谢物, 黏性极大, 很难从中提取高质量的DNA。特别是一年生以上的老茎, 目前尚未有较好的DNA提取方法。为了解决这一难题, 该研究对CTAB+Tris-HCl洗涤法进行了3种方式的改良。结果表明, “改进三”方法可不受取样时期和取样部位的限制, 从一年生以上火龙果茎中提取的DNA质量最好且不含黏性物质, 可用于酶切与分子标记等生化和分子生物学实验。该研究探索了一条较为理想的火龙果茎DNA提取方法, 值得推广应用。     

胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA蛋白)与植物抗逆性研究进展

胚胎发育晚期丰富蛋白(LEA蛋白)在自然条件下主要在种子发育晚期大量积累,植物LEA基因也在多种非生物胁迫下诱导表达。植物LEA蛋白是植物应对失水胁迫(包括干旱、盐碱、冷冻等)逆境的一种广泛存在的亲水性应答蛋白,具有很强的热稳定性。本论文就LEA蛋白的结构、分类、功能及抗逆性分子机制进行了概述与总结,为分离新的LEA蛋白成员,进行功能分析以及进一步发掘其潜在应用价值提供参考。     

崇明东滩抛荒鱼塘的自然演替过程对水鸟群落的影响

人工湿地抛荒的现象普遍存在,但针对抛荒后的自然演替过程对水鸟群落影响的研究较少.于2007、2008、2011年对崇明东滩自然抛荒的人工鱼塘水鸟群落展开调查,探究抛荒后的自然演替过程对水鸟群落结构及不同水鸟类群的影响.3a累计观察到水鸟59种12819只,隶属6目12科.其中抛荒前最多,共53种11001只;抛荒第1年22种1673只;抛荒第4年最少,9种145只.鱼塘抛荒后水鸟种类和数量下降剧烈,物种多样性先上升再下降,均匀度逐年上升,优势度先下降再上升.方差分析结果表明,5个群落特征都存在极显著年度差异(P1＜0.01;P2＜0.01;P3＜0.01;P4=0.003;P5＜0.01).非参数检验结果表明,不同类群水鸟的种类和数量逐年下降趋势明显,且年际差异极显著.即抛荒后的自然演替过程对水鸟群落产生了不利影响.建议采取人工管理措施防止旱化,增加环境异质性,恢复水鸟群落多样性.     

厚藤ASR基因克隆及功能初步分析

通过对厚藤(Ipomoea pes-caprae(Linn.)Sweet.)cDNA文库的筛选,获得了一个编码厚藤ASR(ABA-stress-ripening)基因的全长cDNA,命名为IpASR。研究结果显示,IpASR编码区全长648 bp,共编码215个氨基酸;蛋白质等电点为5.42,分子量为24.57 k D。通过在酵母中表达,发现IpASR能够提高转基因酵母的耐盐性及抗氧化能力。进一步以厚藤成年植株及幼苗为材料进行实时荧光定量PCR分析,结果表明,IpASR基因在厚藤成年植株各组织中广泛表达;高盐、甘露醇胁迫和ABA处理可诱导该基因在厚藤幼苗中的表达。结合GFP融合蛋白的亚细胞定位和生物信息学分析,发现IpASR蛋白为核蛋白,推测IpASR基因参与了厚藤生长发育的调控,并可响应ABA和非生物胁迫的诱导。     

烟草花粉发育过程中的细胞凋亡及其与钙/钙调素依赖性蛋白激酶T1表达的关系(英文)

用原位末端标记及免疫组化显色方法,对烟草花药发育过程中的细胞凋亡进行了检测。结果表明绒毡层、环形细胞、药隔组织细胞在减数分裂后四分体时期开始凋亡(Plate I, C &D),而花药维管束细胞从小孢子母细胞时期就开始凋亡(Plate I, E)。这些特定的细胞在花药发育特定时期的凋亡担负着特定的作用。钙/钙调素依赖性蛋白激酶T1在这些凋亡细胞中大量特异表达(Plate II),表明钙信号途径参与了烟草花粉发育的细胞凋亡调控。