植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化分析

Ⅲ型聚酮合酶(type Ⅲ polyketide synthase,PKSⅢ)广泛存在于细菌、真菌和植物中,目前数据库中已积累了大量的序列资料。为了进一步了解植物Ⅲ型聚酮合酶基因家族的分子进化,以及其作为系统进化研究材料的可能性,选取了75条来自不同植物物种包括苔藓类植物、蕨类植物、裸子植物、单子叶植物和双子叶植物的PKSⅢ蛋白序列,用CLUSTAL X软件对其氨基酸序列进行了比对,并用邻位相接法构建了系统进化树。结果表明,尽管不同来源的PKSⅢ序列表现了很大的差异,但保守结构域CHS-like所包含的主要功能位点半胱氨酸(Cys184)、苯丙氨酸残基(Phe236和Phe286)、组氨酸残基(His335)、天冬酰氨残基(Asn369)在各植物物种中具有很好的保守性;同时发现,在植物PKSⅢ序列中多数的Cys位点均具有较好的保守性,而且蕨类植物PKSⅢ和单子叶植物PKSⅢ在Cys保守位点有很好的相似性;进一步构建分子进化树表明,PKSⅢ基因基本上首先根据功能而聚类,明显地划分为CHSs和non-CHSs两类,其次按照不同的植物物种聚类。     

密植条件下种植方式对夏玉米群体根冠特性及产量的影响

选用平展大穗型品种鲁单981(Ludan981,LD981)和紧凑中穗型品种鲁单818(Ludan818,LD818),在两种种植密度(60000和90000株/hm2)和两种种植方式(单株和双株)下,研究了密植及种植方式对夏玉米冠层和根系结构与功能以及子粒产量等的影响.研究发现,随种植密度增加,冠层垂直分布呈现干重比例权重上移的趋势,根系则呈现下移的趋势.密植条件下,LD981冠层对生长空间更为敏感,其根系对生长空间的竞争强于冠层,其群体产量限制因素是子粒库容;LD818根系对生长空间更为敏感,冠层对生长空间的竞争强于根系,其群体产量限制因素是单位面积穗数.60000株/hm2下,LD981的群体结构质量和功能较优,双株种植可缓解其冠层竞争,根、冠协调,表现增产;在90000株/hm2下,LD818的群体结构质量和功能较优,双株种植可缓解其根系竞争,部分改善冠层群体结构质量和功能,根、冠协调,表现增产.     

VersusSNP:一种单碱基突变的筛选及分类工具

单碱基突变的筛选和分类是SNP分析的基础。为解决手工进行突变位点挖掘工作的困难,编写了VersusSNP软件。它可以解析并过滤序列比对结果,并根据突变类型将位点加以分类,以图形界面呈现给用户。使用VersusSNP,用户可以直观地了解基因组中单碱基突变的情况。其程序及源代码可以从http://sourceforge.net/projects/versussnp下载。     

一种结合单张芯片序列捕获和高通量测序技术测序外显子组的方法

随着高通量测序技术的发展,全外显子测序已经成为一种研究人类疾病的重要方法.本文展示了一种通过Nimblegen2.1M芯片进行外显子DNA序列捕获和高通量测序的方法,包括两步法文库制备.测序的平均覆盖深度达33倍时,95.6%的34M目标区域得到均衡覆盖,特异性达到80%.对比全基因组鸟枪法测序的结果,此方法在检测SNP时的假阳性率为0.97%,假阴性率为6.27%.本方法对于全基因组扩增的DNA也适用.结果显示,全外显子测序技术可以在大规模的群体研究和医学研究中起到重要作用.     

环氧化物水解酶1基因(EPHXl)多态性与新生儿出生体重间关系分析

为研究母亲环氧化物水解酶1基因(EPHXl)多态性与新生儿出生体重间关系.收集了某纺织厂342名女工的资料,用PCR-限制性片段长度多态性法分析母亲EPHXl基因型,采用多元线性逐步回归模型分析母亲EPHXl多态性与新生儿出生体重关系.结果发现调整主要混杂因素后EPHXl的His139Arg/AG139Arg基因型与新生儿出生体重有显著性相关(β±SE＝-149g±56,P＝0.0083).经被动吸烟分层分析,结果显示仅在有被动吸烟史人群中EPHXl的Hus139Arg/Arg139Arg基因型与新生儿出生体重有显著性相关,(β±SE=-234g±88,P＝0.0088);而根据工作紧张程度分层分析后发现,仅在有工作紧张史人群中发现EPHXI的His139Arg/Arg139Arg基因型与新生儿出生体重有显著性相关(β±SE＝-157g±59,P＝0.0079).我们的结果显示母亲EPHXl多态性与新生儿出生体重有显著性相关,并存在基因-环境的交互作用.     

蝴蝶兰实生苗不同器官的离体培养

蝴蝶兰实生苗不同器官的离体培养张秀清王志武刘玉敬王春英（山东省农业科学院玉米研究所,济南２５０１００）ＴＨＥＣＵＬＴＵＲＥＯＦＤＩＦＦＥＲＥＮＴＯＲＧＡＮＳＯＦＰＨＡＬＡＥＮＯＰＳＩＳＳＥＥＤＬＩＮＧＳＩＮＶＩＴＲＯＺｈａｎｇＸｉｕ－ｑｉｎｇＷａｎｇ...     

莱芜片姜生长点的离体培养与快速繁殖（简报）

莱芜片姜生长点离体培养与快繁时,浓底低于１ｍｇ／Ｌ的ＫＴ、６－ＢＡ、ＧＡ３等对生长点启动发芽有明显的促进作用。在１．０ｍｇ／ＬＫＴ＋０．５ＭＧ／ＬＩＡＡ的ＭＳ培养基上,芽的增值倍数高达１５．７,移栽成活率可达９５％以上,一代生姜繁殖倍数达１０－１８。     

广西主要人工林凋落物分解过程及其对淋溶水质的影响

为探讨不同人工林各组分凋落物分解过程特征及其释放物质对淋溶水质的影响,恒温(28 ℃)培养条件下,在室内人工定期淋水模拟自然环境中凋落物的淋溶过程,对1年生和4年生尾巨桉、7年生杂交相思、13年生马尾松以及软阔林5种人工林的凋落叶、凋落枝、凋落皮进行255 d的模拟淋溶.结果表明：1年生和4年生尾巨桉各组分凋落物分解0～105 d的淋溶液色度和化学需氧量（COD）、总N和总P含量显著高于杂交相思、马尾松、软阔林,淋溶液pH值显著低于其他3种林分人工林;至255 d,1年生和4年生尾巨桉凋落叶淋溶液的COD累积量（193.9和212.8 g·kg^-1）分别是杂交相思、马尾松、软阔林的4.2、4.0、4.3倍和5.3、4.4、4.7倍;1年生尾巨桉凋落叶质量损失率、N和P淋失率显著大于杂交相思、马尾松和软阔林,凋落皮显著大于马尾松,而凋落枝与后三者基本相当.1年生尾巨桉凋落叶和凋落皮比4年生尾巨桉更易被分解淋溶,但凋落枝差异不显著.5种林分凋落物不同组分间,凋落叶最易被分解淋溶,凋落枝难于被分解淋溶.尾巨桉凋落物淋溶液pH值与色度、COD含量呈显著负相关,COD与色度、总N和总P呈显著正相关.     

培养基成分对南方红豆杉细胞生长的影响

紫杉醇是 70年代发现的一种非常有发展前途的抗癌新药。通过红豆杉细胞培养技术获得紫杉醇是一条很有工业化生产前景 ,可大量提供紫杉醇的途径。本文采用二相培养技术 ,初步探讨了不同的基本培养基、不同浓度蔗糖 ,以及氨基酸对细胞生长的影响。实验材料为本室继代培养的南方红豆杉 (Ｔａｘｕｓｃｈｉｎｅｎｓｉｓｖａｒ ｍａｉｒｅｉ)Ｚ3细胞株。获得如下结果 :1 Ｂ5、ＳＨ、ＴＡ[张宗勤等 西北植物学报 ,1998,18(4 ) :488～ 492 ]、ＭＳ 4种培养基中 ,Ｂ5的盐类组合 (大量元素、微量元素、维生素 )对细胞的生长最为有利。在 40ｄ生长期…     

密度对玉米群体冠层内小气候的影响

 系统研究了两个玉米(Zea mays L.)品种不同密度群体冠层内光合有效辐射、CO2浓度、温度、风速、相对湿度等小气候因子垂直分布及其变化。指出,密度能显著影响小气候因子在群体中的分布,并最终反映在群体的有效贮积能量上。通过合理密植能调节群体结构、充分利用小气候资源,获得较高有效贮积能量。