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1.
MicroRNA identification based on sequence and structure alignment   总被引:20,自引:0,他引:20  
MOTIVATION: MicroRNAs (miRNA) are approximately 22 nt long non-coding RNAs that are derived from larger hairpin RNA precursors and play important regulatory roles in both animals and plants. The short length of the miRNA sequences and relatively low conservation of pre-miRNA sequences restrict the conventional sequence-alignment-based methods to finding only relatively close homologs. On the other hand, it has been reported that miRNA genes are more conserved in the secondary structure rather than in primary sequences. Therefore, secondary structural features should be more fully exploited in the homologue search for new miRNA genes. RESULTS: In this paper, we present a novel genome-wide computational approach to detect miRNAs in animals based on both sequence and structure alignment. Experiments show this approach has higher sensitivity and comparable specificity than other reported homologue searching methods. We applied this method on Anopheles gambiae and detected 59 new miRNA genes. AVAILABILITY: This program is available at http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/miralign. SUPPLEMENTARY INFORMATION: Supplementary information is available at http://bioinfo.au.tsinghua.edu.cn/miralign/supplementary.htm.  相似文献
2.
深山含笑的组织培养和快速繁殖   总被引:16,自引:0,他引:16       下载免费PDF全文
组织培养深山含笑的实验结果表明:利用休眠芽和种子萌发时实生苗的上胚轴及下胚轴为外植体均能诱导出愈伤组织和不定芽,其中无菌实生苗的上胚轴最易诱导出不定芽,无菌实生苗的下胚轴最易诱导出愈伤组织。外体植体在MS+1.0-2.0mg L^-1 2,4-D培养基上只产生愈伤组织;在MS+3.0mg L^-1 BA+0.2mg L^-1 NAA培养基上产生较多的不定芽和较多的愈伤组织;在MS+2.0mg L^  相似文献
3.
EXCEL在农药田间药效试验统计分析中的应用   总被引:10,自引:0,他引:10  
冯岗  张静  李广泽  冯俊涛  何军  张兴 《昆虫知识》2006,43(1):126-129
根据方差分析原理,利用EXCEL编制了农药田间药效试验统计分析程序。用户只需输入试验的原始数据,即可快速、准确地计算出药剂的防治效果,方差分析结果及药剂间的多重比较。  相似文献
4.
带叶兜兰的无菌播种和离体快速繁殖   总被引:8,自引:2,他引:6  
1植物名称带叶兜兰(PaphiopedilumhirsutissimumPfitz)。2材料类别种子。3培养条件种子萌发培养基:(1)RE(Arditti1982);(2)VW;(3)1/4MS;(4)MS;(5)RE+活性炭2g·L-1;(6)RE;(7)RE+活性炭2g·L-1;(8)花宝1号(美国Haponex公司产品,N∶P∶K=7∶6∶19)2.5g·L-1。原球茎增殖和分化成苗培养基:(9)RE+6-BA2.0mg·L-1(单位下同)+NAA0.2;(10)RE+活性炭2g·L-1+6-BA2.0+NAA0.2;(11)花宝1号1.5g·L-1+花宝2号(美国Haponex公司产品,N∶P∶K=20∶20∶20)1.5g·L-1+活性炭2g·L-1+6-BA2.0+NAA0.2。生根壮苗培养基:(12)RE+NAA1.0+活…  相似文献
5.
将着外周血淋巴细胞mRNA注入非洲爪蟾卵母细胞胞乐内,借助卵母细胞折翻译系统,表达羊外周血淋巴细胞的M型乙酰胆碱受体并移植到卵母细胞膜上,用电压钳位仪检测表达受体电源。结果发现Ach可诱发卵母细胞产生电流反应,该反应能被M型Ach受体阻断剂硫酸阿托品阻断,但不能被N型受体阻断剂氯化筒箭毒阻断。  相似文献
6.
侯爱菊  朱延明  张晶  李杰  张彬彬 《遗传》2003,25(4):466-470
在基因转移过程中,人们常常使用标记基因来筛选转化细胞或组织。常用的筛选标记基因尤其是抗生素抗性基因的使用往往对环境及植物体的生长发育产生不良影响,且影响基因多重转化。为了消除这些弊端,一种全新的发展策略即获取无选择标记的转基因植物应运而生。本文主要综述转基因植物中有关筛选标记基因及其消除方法。 Abstract:Selective marker gene is usually used to select transformed cells or tissue during gene transfer.However,the use of selective marker gene,especially antibiotic-resistant gene,is harmful to environment,plant development and affects multi-transformation.A new strategy that offers a approach for the elimination of those disadvantages caused by the selectable marker gene is developed.We summarized correlative marker genes used in transgenic plants and some methods of its removal.  相似文献
7.
高效液相色谱法同时测定银凤桃中的赤霉素和脱落酸   总被引:5,自引:0,他引:5  
赤霉素(GA3)和脱落酸(ABA)是果实组织中的两个重要激素,本试验用SymmetryC18色谱柱(4.6mm×150mm),以乙腈和1.8%乙酸[V(CH3CN)∶V(1.8%CH3COOH)=1∶1]为流动相,流速为0.5mL·min-1,Wa-ters2487UV-检测器,在检测波长254nm,柱温25℃的条件下,同时分离并测定了银凤桃中的GA3和ABA。GA3和ABA的分离效果理想,回收率分别达到100.1%和99.8%,该方法测量灵敏度达10-2ng·g-1,精密度RSD%<0.1。  相似文献
8.
捕蝇草的组织培养和快速繁殖   总被引:4,自引:0,他引:4  
1 植物名称 捕蝇草 (Dionaeamuscipula)。2 材料类别 子叶、叶片。3 培养条件 种子培养基 :(1 )MS 6 BA0 .1mg·L-1(单位下同 ) NAA 0 .1。愈伤组织与不定芽诱导培养基 :(2 )MS 2 ,4 D0 .5 6 BA 0 .5 ;(3)MS 6 BA 0 .5 ;  相似文献
9.
非洲菊试管苗叶柄愈伤组织的诱导与分化研究   总被引:4,自引:0,他引:4       下载免费PDF全文
以非洲菊(Gerbera janesonii Bolus)品种‘Sunanda'试管苗幼叶的带叶叶柄为材料,研究了培养基、外植体类型和继代次数等因素对愈伤组织诱导及分化的影响.结果表明:培养基上附加不同植物生长调节剂所诱导出的愈伤组织在形态和分化能力上存在显著差异,叶柄基部诱导愈伤组织的最适培养基是MS+TDZ 0.3 mg L-1+NAA0.1 mg L-1.外植体以叶片长度>0.5 cm,叶片已舒展,颜色嫩绿的幼叶最佳,继代培养基以MS+KT 1.0 mg L-1较适宜,愈伤组织在分化培养基MS+6-BA 2.0 mg L-1+NAA 0.1 mg L-1上分化出芽的同时还会增殖,分化率达87.4%,继代培养2次的愈伤组织分化率可提高至95%.不定芽在生根培养基1/2MS+IBA0.6 mg L-1上的生根率达100%,试管苗移栽45 d后,成活率达97%以上.  相似文献
10.
楔叶铁线蕨的离体快繁   总被引:3,自引:3,他引:0  
1植物名称楔叶铁线蕨(Adiantum raddianum Presl.). 2材料类别叶背成熟孢子.  相似文献
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