sRNA (istR)在肠炎沙门氏菌抗活性氮氧中的作用分析

sRNA(Small non-coding RNA,sRNA)为新近发现的基因表达调控分子,转录后水平调控靶基因表达,在细菌毒力、应激及对外界环境感应方面起调控作用。沙门氏菌是一种重要的人畜共患病病原菌,可引起人类食物中毒、败血症及伤寒等。以肠炎型沙门氏菌为模型,研究sRNA(istR)在肠炎沙门氏菌抗活性氮氧中的作用,为沙门氏菌的防治提供新方向。参考已报道的沙门氏菌全基因组及istR序列,设计引物,PCR扩增istR突变用基因片段,运用Red同源重组系统对肠炎沙门氏菌(SE2472)的istR基因进行定点敲除,构建敲除菌株(SE2472△istR),比较野生株和敲除株对活性氮氧的敏感性;构建回复表达质粒pHDB3-istR,将其转入istR敲除株构建回复株SE2472△istR-comp,以回复表达istR,分析istR表达对沙门氏菌istR敲除株抵抗活性氮氧的回复作用。活性氮抑菌结果表明,SE2472在pH 5.0、NaNO2浓度为20 mmol/L的LB液体培养基中培养3 h,存活率为20.40%;培养6 h,存活率降至0.05%。同等培养条件下,SE2472△istR的存活率分别为0.70%和0,SE2472△istR-comp生长情况与SE2472类似,存活率分别为21.40%和0.08%。同时用H2O2分析istR在沙门氏菌抗活性氧中的作用,活性氧抑菌结果表明,SE2472和SE2472△istR两者对H2O2的抑菌作用无明显差异。综合上述结果,推测istR在沙门氏菌抗活性氮中起着调控作用,在抗活性氧作用中没有调控作用。     

体内表达新基因trag在猪链球菌的分布及其免疫反应性分析

【目的】trag(transfer gene G)是利用IVIAT(in vivo induced antigen technology)通量筛选鉴定的猪链球菌2型（Streptococcus suis type 2,SS2）感染相关因子,研究该基因在猪链球菌（Streptococcus suis,SS）中的分布情况,研究康复血清与免疫血清在免疫印迹中的反应性有无,间接证明其在体内感染与体外培养时表达差异。【方法】鉴于我国分离株trag与GenBank公布的SS2北美株89/1591的trag序列有95.8%的同源性,据此设计和合成一对检测引物,对SS2我国江苏及四川流行株、其他临床分离株和参考株及SS1、SS1/2、SS9、SS7及C群猪源链球菌共43株进行PCR扩增。另设计一对引物,扩增5株SS代表菌株trag的完整阅读框,并对扩增产物进行测序。据软件分析后,选择TRAG(Transfer protein G?)免疫原性良好的区域片段的核酸设计表达引物,PCR扩增后定向克隆至表达载体pET28a(+)构建表达质粒,表达蛋白转印到PVDF膜上,分别与SS2猪康复血清和猪高免血清反应。【结果】trag在SS2中94%(30/32)阳性,SS9中67%(4/6)阳性,SS7阳性,SS1、SS1/2及C群菌阴性。5株细菌TRAG的氨基酸序列与SS2中国株98HAH33、05ZYH33及北美株89/1591同源性>97%。所获得重组蛋白只能被康复血清识别。【结论】从SS 致病株中检出感染相关基因trag,提示该基因可能与SS 致病性有关,重组蛋白的免疫转印结果表明,TRAG可能与SS2体内感染相关。     

非编码小RNA(sraB)调控肠炎型沙门菌的抗蛋清抑菌作用

【目的】肠炎型沙门菌是一种食源性人畜共患病病原菌,可在禽蛋中存活并传播。sRNA为新近发现的基因表达调控分子,本实验以sRNA(sraB)为对象,探索sRNA与肠炎型沙门菌在禽蛋中存活的相关性,及研究其在细菌抵抗蛋清抑菌作用中的调控功能。【方法】参考已报道的沙门菌全基因组及sraB序列,设计并扩增sraB突变用基因片段,运用Red重组系统(red recombination system)对肠炎沙门菌野生株(SE2472)sraB基因进行定点敲除,构建出sraB敲除株(SE2472ΔsraB)。分析比较sraB敲除对沙门菌在蛋清中存活的影响;另构建表达sraB的回复表达质粒pHDB3-sraB,将其转入sraB敲除株构建回复株SE2472ΔsraB-comp,以回复表达sraB,分析sraB表达对沙门菌敲除株的回复作用;并分别以野生株、敲除株及回复株研究sraB在抵抗蛋清中几种抑菌因子(如溶菌酶和卵转铁蛋白)作用中可能的调控作用。【结果】敲除株在蛋清中存活率为野生型的61%-70%,回复株相比野生型的存活率比敲除株提高10%-33%;在转铁蛋白抑菌实验中,孵育8h和24h,敲除株的存活率分别为野生型存活率的38%和23%,孵育8h回复株相比野生型的存活率比敲除株提高15%,但孵育24h回复株的存活率未见提高;在溶菌酶抑菌实验中,孵育8h和24h后,敲除株存活率分别为野生型的41%和27%,回复株相比野生型的存活率分别比敲除株提高35%和23%。【结论】通过比较sraB敲除与否,研究肠炎型沙门菌在禽蛋中的存活及对抑菌因子的抵抗作用,结果表明sraB在肠炎沙门菌抵抗蛋清抑菌作用中起着重要调控功能。     

猪链球菌2型新的感染相关因子自溶素的鉴定与分析

根据Sanger研究所公布的猪链球菌2型(SS2)P1/7株的自溶素序列,设计检测引物,取SS2我国2次流行株、其它临床分离株和参考株,及猪链球菌1型、1/2型、7型和9型,共33株,分别以其DNA为模板,PCR扩增.结果表明,SS2除无毒株T15阴性外,其他临床分离株27株(含人源2株)均阳性;其它猪链球菌为,SS7阳性,SS1、SS1/2和SS9均阴性.同时设计引物向两侧扩增,以四川流行株ZY05719和江苏流行株HA9801的DNA为模板,扩增自溶素ORF完整的编码基因,软件分析结果显示,该基因含有6个重复的"GBS_Bsp-like"域和1个"N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸酰胺酶"域,与SS2欧洲株有较高同源性(99.8%),但与SS2加拿大株差异较大.在DNASTAR分析所编码蛋白的抗原性的基础上,另设计引物,以ZY05719株DNA为模板,PCR扩增具有良好免疫原性的片段基因,并定向克隆至表达载体pET30a( )中,进行重组表达,SDS-PAGE和Western blot表明,所获得重组自溶素具有良好反应原性.     

兔多杀性巴氏杆菌铁调节外膜蛋白（IROMPs）抗原交叉性试验

分别以含铁培养基和限铁培养基培养4株兔多杀性巴氏杆菌JS、C51—2、C51-3及C51—17株,用刚果红结合试验初步分析铁调节外膜蛋白(IROMPs)表达情况,同时破碎菌体,提取外膜蛋白,经SDS-PAGE比较这4株细菌在正常培养条件、富铁培养条件及限铁培养条件时外膜蛋白的表达差异,结果表明：限铁培养时,细菌表现出对刚果红染料较强结合性,且这4株巴氏杆菌均表达数种高分子量的IROMPs,主要有147kD、135kD、99kD、94kD、82kD及72kD蛋白带,4株之间存在一定的差异,而正常或富铁条件培养时均不表达上述条带。免疫印迹结果显示,正常条件培养的全菌(C51—17株)抗血清中不含有针对IROMPs的抗体,限铁培养的C51-17株IROMPs可诱导机体产生相应抗体,并且能与JS、C51—2及C51-3株的IROMPs发生抗原交叉性反应。同时用间接ELISA检测C51—17株3种IROMP(99kD、94kD和87．6kD)的交叉抗体效价,结果这3种抗血清均与其它3株的产生较高的交叉抗体滴度。     

甲型流感病毒流行毒株检测和分型基因芯片的研制

【目的】研制一种可同时对甲型流感病毒H1N1、H1N2、H3N2、H5N1和H9N2等5种流行亚型进行检测和分型的基因芯片。【方法】根据National Center for Biotechnology Information中Influenza Virus Resource数据库,针对H1N1、H1N2、H3N2、H5N1和H9N2等5种亚型甲型流感病毒的HA和NA基因设计46条特异性寡核苷酸探针和1条质控探针,点制成基因芯片。利用通用引物扩增流感病毒HA和NA基因,使用Klenow酶对扩增产物进行荧光标记和片段化,将标记后产物和芯片杂交,清洗、扫描后根据荧光信号判定检测结果。用18株不同种属来源的甲型流感病毒分离毒株和186份咽拭子对芯片特异性、敏感性和临床应用进行初步评价。【结果】所有18株分离毒株均能被芯片准确检测并分型,芯片检测灵敏度能达约1×104个病毒基因拷贝。同时8份咽拭子检测结果为H1N1阳性,4份咽拭子为H3N2阳性。【结论】研究表明该芯片具有较高的特异性和灵敏度,可为甲型流感病毒的监测提供一种有效的方法。