DNMT在幽门螺杆菌感染与非感染胃粘膜组织的差异表达

DNA甲基转移酶（DNA methyltransferase, DNMT）是表观遗传学研究热点. 本文分析DNMT1、DNMT2、DNMT3A、DNMT3B、 DNMT3L在成人胃粘膜的表达,并初步研究DNMT抑制剂对胃粘膜细胞的影响. 免疫组织化学法对60例成人胃粘膜组织分析发现 ,5种DNMT均在组织中表达,以DNMT2、DNMT3B表达率较高,DNMT3L、DNMT3A次之,DNMT1较低.进一步分析发现,幽门螺杆菌 感染与非感染的胃粘膜组织有DNMT表达差异,以感染组中DNMT1、DNMT2、DNMT3B表达增强较显著. 免疫荧光法及Western免 疫印迹法对胃粘膜细胞株GES 1分析发现,5种DNMT亦在细胞中表达;且DNMT1为胞核胞浆共表达,DNMT2为胞核表达, DNMT3A、DNMT3B、DNMT3L为胞浆表达. 噻唑蓝比色法研究GES-1发现,DNMT抑制剂5-氮杂-2′-脱氧胞苷可抑制GES 1增 殖,并呈时间剂量依赖. 研究提示,DNMT在成人胃粘膜表达并发挥作用,幽门螺旋杆菌感染可能与DNMT表达异常相关.     

生物信息学对番茄LeNHX1基因的研究

应用生物信息学的方法和工具对番茄LeNHX1蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域、功能分类和同源性进行分析.结果表明此蛋白为疏水性稳定蛋白,包含一个保守的氨氯吡嗪咪结合位点LFFIYVLPPI区域,相对分子量为59.0 kD,等电点为6.60,存在10个跨膜区域,蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,功能分类和蛋白质同源性分析表明番茄LeNHX1属于液泡膜Na+/H+反向转运蛋白.     

番茄LeABI3基因的生物信息学分析

对所克隆到的番茄LeABI3基因测序结果进行序列分析,发现得到LeABI3基因的2种转录本.应用生物信息学的方法和工具对LeABI3蛋白质的理化性质、跨膜区域、疏水性/亲水性、二级结构、结构功能域和同源树进行分析,结果表明此蛋白是包含一个保守B3结构功能域的亲水性不稳定蛋白,相对分子量为65.4 kD,等电点为6.54,可能存在2个跨膜区域.蛋白质二级结构中的主要构成元件是α-螺旋和不规则卷曲,蛋白质同源分析发现番茄LeABI3和马铃薯vp1-ABI3类蛋白相似度最高,同源性为89%.     

STRs-PCR分型技术在法医学上的应用

短串联重复序列 (STRs)是广泛存在于人类基因组的一类具有长度多态性的DNA序列 ,属高信息基因座。概述了STRs PCR的法医学应用特点以及它们在亲子鉴定、个体识别等领域的法医学应用及其理论基础、现状和前景。     

D3S1358、D21S11和FGA复合扩增系统的研究

目的：研究D3S1358、D21S11和FGA3个STR基因座复合扩增的最佳体系。方法：设计正交实验优化复合扩增最佳反应条件,然后采用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离显带技术检测扩增片段。结果：获得复合扩增条件各反应因素较为满意的参数。     

黑龙江省次生林主要组成树种光合能力与叶片含氮量研究

以黑龙江省次生林主要组成树种蒙古栎、白桦、水曲柳、山杨、胡桃楸、黄波罗为研究对象,测定自然状态下这6个树种的光合能力,并分析光合能力与叶片含氮量之间的关系.研究结果表明,树种的光合能力存在明显的季节变化,不同树种间的光合能力、光合潜力存在差异.生长季中,胡桃楸具有最高的光合能力最大值,白桦具有最高的年平均光合能力,蒙古栎具有最大的光合潜力.蒙古栎叶片含氮量与光合能力线性正相关(r=0.97),白桦、水曲柳叶片含氮量与光合能力呈二次曲线相关(r=0.61,r=0.51).     

一种经济、简便和准确鉴定重组质粒的方法

目的：提高重组质粒的筛选效率,探讨一种经济、快速并准确的重组质粒鉴定方法。方法：取200μl菌液于Eppendorf管中高速离心1min,倒出上清,沉淀中加入20μl裂解缓冲液以裂解细胞并释放出内部质粒,10000r/min离心10min后取5～10μl上清液进行琼脂糖凝胶电泳,并比较其迁移位置来以判断重组质粒。结果：该方法鉴定结果和PCR鉴定结果完全一致。结论：该方法具有成本低廉、简便快速的特点,在对大量样品进行鉴定时具明显优势,适合在常规实验室推广。     

人类基因组STR等位基因阶梯的研制

研究建立一种制备STR等位基因阶梯标准的新方法。以单一来源的DNA链为模板,采用槽式PCR扩增法,并经过PAGE胶回收纯化制备等位基因阶梯标准。结果：该方法适合等位基因阶梯标准的制备,所制备的等位基因阶梯基本无杂带,效果较理想。     

CEA、CA125、CA-50、β2-MG对腮腺粘液表皮样癌的诊断价值分析

目的:探讨CEA、CA125、CA-50、β_2-MG对腮腺粘液表皮样癌的诊断价值。方法:选择2015年6月至2017年5月本院收治的腮腺粘液表皮样癌患者30例为恶性肿瘤组及同期收治的良性腮腺肿瘤患者30例为良性肿瘤组,并选择30例健康体检者为健康对照组。采用酶促化学发光免疫分析法检测各组血清、混合唾液、健侧/患侧腮腺液中CEA、CA125含量;放射免疫分析法检测血清、混合唾液、健侧/患侧腮腺液中CA-50、β_2-MG水平。比较各组腮腺液、唾液、血清中CEA、CA125、CA-50、β_2-MG水平;分别对健侧及患侧腮腺液、混合唾液、血清中的CA-50、β_2-MG水平与CEA、CA125水平进行相关性分析。结果:肿瘤组腮腺液、唾液、血清CEA水平均明显高于健康对照组(P0.05),恶性肿瘤组患侧腮腺液、血清CEA水平明显高于良性肿瘤组(P0.05)。肿瘤组患侧腮腺液、混合唾液中CA125水平明显高于健康对照组,且恶性肿瘤组明显高于良性肿瘤组(P0.01)。肿瘤组各检测标本中CA-50水平均明显高于健康对照组(β_2-MG水平均明显低于健康对照组),恶性肿瘤组高于良性肿瘤组(P0.01)。健侧腮腺液及血清中CA-50水平与CEA水平呈显著正相关,β_2-MG水平与CEA水平呈显著负相关(P0.05)。患侧腮腺液及混合唾液中CA-50水平与CEA、CA125水平呈显著正相关,β_2-MG水平与CEA、CA125水平呈显著负相关(P0.05)。结论:患侧腮腺液、混合唾液中CEA、CA125、CA-50、β_2-MG水平检测对腮腺粘液表皮样癌的诊断有较高的参考价值。     

广西巴马小型猪小RNA启动子U6和7SK的克隆及功能验证

为了探讨巴马小型猪启动子U6和7SK的功能以及为生产GGTA1基因沉默的广西巴马小型猪奠定基础,文章克隆并分析了siRNA启动子U6和7SK,并分别连接pMD18-shEGFP载体,分别与PEGFP-N1共转猪肾细胞,进行RNAi实验。以pMD18-hU6-shEGFP为阳性对照,无启动子的pMD18-shEGFP载体为阴性对照,单独转染PEGFP-N1为第一组空白对照,以ddH2O替代质粒为第二组空白对照组,验证这两种启动子在猪细胞中的功能。结果表明:广西巴马小型猪RNA聚合酶III型siRNA启动子U6和7SK的序列全长分别为553 bp和437bp。成功构建了pMD18-pU6-shEGFP和pMD18-p7SK-shEGFP干扰载体,转染猪源PK-15细胞,证明U6以及7SK两个启动子具有较高的siRNA表达活性,可以用于α-1,3半乳糖转移酶等猪源基因的沉默实验。