转录组与RNA-Seq技术

转录组是特定细胞或组织在特定时间或状态下转录出来的所有RNA的集合.通过对转录组的研究可以揭示生物体的基因表达、研究结构变异及发现新基因等.转录组分析的研究方法、研究平台发生着日新月异的变化,同时生物信息学分析的内容也在逐渐完善.RNA-Seq作为一种新的转录组研究手段,利用新一代测序技术能够更为快速、准确地为人们提供更多的生物体转录信息.主要比较近年来转录组研究的几种方法和几种RNA-Seq的研究平台,并着重介绍RNA-Seq的原理、用途、步骤和生物信息学分析等及在相关领域的应用等内容,为相关的研究和应用提供参考.     

山羊GOLA-DQA2基因多态性与血液免疫性状的相关分析

文章采用PCR-RFLP技术对莱芜黑山羊、波尔山羊、鲁波山羊3个山羊种群的GOLA-DQA2基因外显子2进行遗传多态性研究,并对其血液免疫指标的效应进行分析。结果表明,3个山羊种群共检测到4种基因型,由3个等位基因控制;GOLA-DQA2基因外显子2的第77、79、80和169位的碱基表现出多态性;多数血液免疫指标品种效应是主要效应;鲁波山羊中,AB基因型的红细胞计数、白细胞计数分别显著高于BB基因型、BC基因型(P<0.05);AB基因型的红细胞压积显著高于BB、BC基因型(P<0.05);BC基因型的噬中性粒细胞比率显著高于BB基因型(P<0.05);波尔山羊和莱芜黑山羊中,基因型与血液免疫指标之间也有一定的相关性,但没有达到显著水平。由上述结果初步推测,在鲁波山羊中,AB、BC基因型是影响红细胞计数、白细胞总数、噬中性粒细胞比率等血液免疫指标的重要因素。研究结果揭示GOLA-DQA2基因与血液免疫指标之间有一定的相关性,可为山羊的抗病育种提供一定的参考。