蚕豆根尖细胞微核试验——Ⅴ.经二甲基肼处理的小鼠粪便诱变效应及抗诱变效应

昆明种小鼠随机分为4组,3组皮下注射二甲基肼(DMH),并分别饮用自来水,嗜酸性乳酸菌Shahani菌株发酵奶及牛奶。第4组为溶剂乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA)对照组。在实验第20周,用蚕豆根尖细胞微核试验检测各组小鼠粪便乙醚提取物的诱变及抗诱变性能。结果发现:DMH饮自来水组小鼠粪便提取物有明显诱变性,并有显著的剂量效应关系;发酵奶能明显抑制DMH处理小鼠粪便的诱变性;诱变性和大肠肿瘤发生有关。我们认为Shahani菌株发酵奶可作为抗结肠癌的饮食。蚕豆根尖细胞微核试验可作为一种新的简便及可靠的粪便诱变性检测途径。     

西安城市绿地生态功能研究

通过调查,将西安市片状绿地按种植结构分为乔灌草、乔草、灌草、乔木、灌木和草坪6种类型,并定点定时测定绿地中心和对照点的光强、湿度、温度、噪音、空气中细菌数.结果表明,在片状绿地中,除草坪外,其他绿地均具有一定的遮荫效应,不同结构绿地遮荫效应依次为灌木＞乔灌草＞乔草＞灌草＞乔木＞草坪;各绿地也有明显的降温效应,降温效应依次为乔灌草＞乔木＞灌木＞乔草＞灌草＞草坪;各绿地还有一定的增湿效应,增湿效应依次为乔草＞乔灌草＞乔木＞灌木＞灌草＞草坪;各绿地也具有降噪效应,降噪效应依次为乔灌草＞乔草＞乔木＞灌草＞灌木＞草坪;各绿地在灭菌方面也有明显的作用,灭菌效应依次为乔灌草＞乔草＞乔木＞灌草＞灌木＞草坪.相同种植结构的绿地中复层结构绿地的生态效益均大于单层结构的绿地.最后,根据以上结论提出了提高城市绿地生态功能的措施.     

蚕豆根尖细胞微核试验V．经二甲基麟处理的小鼠粪便诱变效应及抗诱变效应

昆明种小鼠随机分为4组,3组皮下庄射二甲基肪(DMH),并分别饮用自来水,嗜嗽性乳酸菌Shahani菌株发酵奶及牛奶。第4组为溶剂乙二胺四乙酸二钠盐(EDTA）对照组。在实验第20周,用蚕豆根尖细胞微核试验检测各组小鼠粪便乙醚提取物的诱变及坑诱变性能。结果发现：DMH饮自来水组小鼠粪便提取物有明显诱变性,并有显著的剂量效应关系;发酵奶能明显抑制DMH处理小鼠粪便的诱变性;诱变性和大肠肿瘤发生有关。我们认为Shahani菌株发酵奶可作为抗结肠癌的饮食。蚕豆根尖细胞微核试验可作为一种新的简便及可靠的粪便诱变性检测途径。     

水稻中受体激酶的系统树分析

植物受体激酶(RLKs)在植物细胞内的反应中发挥着重要作用。为了比较拟南芥(Arabidopsis thaliana L.)和水稻(Oryza sativa L.)中受体激酶的进化关系,作者通过对北京华大基因研究中心(BGI)的籼稻蛋白质数据库进行BLASTP搜索,找到267个受体激酶类似基因,根据它们的胞外结构域可以将这些基因分为不同的类型。与拟南芥中受体激酶的系统树比较分析表明,不同类型的受体激酶具有不同的序列保守性,说明在植物进化过程中,不同类型的受体激酶具有不同的进化关系。水稻受体激酶与拟南芥受体激酶BRI1的多序列匹配结果也表明二者可能具有不同的磷酸化位点。     

TLR4在宫颈癌与不同HPV亚型宫颈癌细胞株中表达及意义

目的 探讨TLR4在正常宫颈组织、宫颈上皮不典型增生、宫颈癌组织以及不同HPV亚型宫颈癌细胞株中表达与意义.方法 采用SP免疫组织化（IHC）检测TLR4在12例正常宫颈组织、30例宫颈轻度不典型增生（cervical intraepithelial neoplasia Ⅰ,CINⅠ）、30例宫颈中-重度不典型增生（cervical intraepithelial neoplasiaⅡ-Ⅲ,CIN Ⅱ-Ⅲ）以及49例宫颈癌（invasive cervical carcinoma,ICC）组织中的表达;应用细胞免疫荧光法、逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测TLR4在不同HPV亚型宫颈癌细胞株HPV18（＋）HeLa、HPV16（＋）Siha以及HPV（-）C33a宫颈癌细胞株上的表达.结果 TLR4的表达随着宫颈病变程度的增高逐渐增强,在正常宫颈组织、CINⅠ、CIN Ⅱ～Ⅲ、ICC中阳性表达率分别为8.33 %（1/12）、20.00 %（6/30）、26.67 %（8/30）和55.10 %（27/49）,ICC与正常宫颈组织、CINⅠ、CINⅡ～Ⅲ之间均有显著性差异（P＜0.01）.TLR4表达与HPV感染有关,在HPV阳性宫颈癌细胞株上表达强于HPV阴性细胞株.结论 TLR4可能参与宫颈癌起始、发展,TLR4的表达与功能与HPV感染有关.     

基于GIS的榆林地区景观格局动态变化

采用陕西省1982和1998年2期土地利用图(1∶500 000)截取榆林地区的部分,借助相关地形图和野外实地调查资料,利用地理信息系统软件ArcView 3.2和ArcInfo 7.1,对其景观分类进行处理与分析。结果表明,1982~1998年,草地和林地的面积显著增加,沙地的面积减少最大。破碎化程度仍然较为严重,景观形状趋于复杂,多样性和均匀度有所降低,但幅度不大,其中灌溉水田、旱地、园地、林地、水体、盐碱地、沙地、裸土岩地主要向草地转变;水浇地、草地主要向旱地转变;居民地的增加主要来自旱地;工矿用地的主要增加来自盐碱地。     

大豆抗病基因同源序列的克隆与分析

已克隆的植物抗病基因序列存在一些相对保守的结构区域。利用根据核苷酸结合位点(NBS)结构域扩增所获得的大豆抗病基因同源片段为混合探针,进行大豆cDNA文库筛选。通过筛库和5′RAcE-PcR扩增后,获得一全长基因KR3。KR3的长度为2353 bp,编码636个氨基酸。KR3蛋白在结构上与烟草抗花叶病毒N基因蛋白有较高的同源性,具有Toll／白细胞介素-1受体(TIR)、NBS等抗病基因的分了特征。Southern 杂交显KR3在基因组中为低拷贝：RT-PCR分析表明,该基因的表达受外源水杨酸的诱导。     

大豆抗病基因同源序列的克隆与分析

已克隆的植物抗病基因序列存在一些相对保守的结构区域.利用根据核苷酸结合位点(NBS)结构域扩增所获得的大豆抗病基因同源片段为混合探针,进行大豆cDNA文库筛选.通过筛库和5'RACE-PCR扩增后,获得一全长基因KR3.KR3的长度为2353 bp,编码636个氨基酸.KR3蛋白在结构上与烟草抗花叶病毒N基因蛋白有较高的同源性,具有Toll/白细胞介素-1受体(TIR)、NBS等抗病基因的分子特征.Southern杂交显示KR3在基因组中为低拷贝;RT-PCR分析表明,该基因的表达受外源水杨酸的诱导.     

一种高效自动化的转录组差异性表达分析方法

差异性表达分析是转录组研究的核心目标之一,对于揭示基因功能和调控规律具有重要意义。但该分析属于多步迭代且耗时较长的计算密集型过程,软件之间具有复杂的数据依赖关系,输入输出格式不尽相同。传统方式下,软件安装与使用复杂、繁琐的手动操作、分析环境的不易迁移以及无法按需集成都是有待解决的关键问题。针对上述问题,文中首次将云开源项目Docker容器技术应用于生物信息领域,提出一种高效自动化的转录组差异性表达分析方法。首先将最佳实践流程在Docker容器中内置与集成,其次多脚本联动与Web服务相结合,最后形成一个轻量级、易迁移、高效自动化的转录组差异性表达分析"黑匣子"。实验结果表明,与传统方式相比,该方法的分析时间缩短约72%,效率提升2倍多,为研究人员提供了更高效的技术支持。