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1.
利用微卫星标记分析中国地方鸡种的遗传多样性   总被引:17,自引:0,他引:17  
中国幅员辽阔, 拥有丰富的鸡种遗传资源. 由于中国地方鸡种生产性能相对较低, 很难与国内外家禽公司育成的商业品种竞争, 现存数目较少, 有些已经濒临灭绝. 为了进一步了解中国地方鸡品种的遗传多样性状况, 本研究采集了分布于中国各地的78个地方鸡品种血样, 并利用分布于13条染色体上27个微卫星标记进行分析. 通过对2740个样本的检测分析发现, 在所有27个微卫星座位中, 等位基因数从6~51个不等, 平均值为18.74. 所检测的78个品种的杂合度(H)均在0.5以上, 所有品种的平均杂合度值为0.622, 多态信息含量(PIC)平均值为0.573. 与国外的同类研究相比, 这一结果表明中国的地方鸡品种具有更加广泛的遗传多样性. 在27个微卫星座位中, 总群内亚群的固定系数(FST)从0.065(LEI0166)到0.209(MCW0078)不等, 平均值为0.106. 在检测的位点中, 只有LEI0194位点在所有的群体中均偏离了Hardy-Weinberg平衡(HWE), 而其他位点基本上都处于Hardy-Weinberg平衡状态. 由于小群体中的基因漂移及非随机交配, 一些保种场保存的地方品种(如狼山鸡)的杂合度相对较低, 而保种区的品种由于保种群群体较大, 杂合度也就相对较高. 中国地方鸡品种的高杂合度与其表型多样性是一致的. 通过Nei氏遗传距离和邻接法将中国地方鸡种进行聚类, 结果表明, 中国地方鸡品种可以分为六大类, 分类结果与品种的地理分布基本一致. 通过分子生物学手段进行中国地方鸡品种的遗传多样性分析, 将对中国地方鸡品种的利用和保护提供重要的理论依据.  相似文献   
2.
采用微卫星DNA标记分析部分地方鸡种保种场的保种效果   总被引:11,自引:0,他引:11  
采用28对微卫星引物分析了我国两个地方鸡种大骨鸡和北京油鸡不同保种场的保种效果。检测了大骨鸡和北京油鸡共计125个个体的基因型,通过计算等位基因数、等位基因频率、遗传杂合度(H)、多态信息含量(P,G)、F统计量、Nei氏遗传距离,并采用UPGMA聚类法分析了大骨鸡和北京油鸡群体内与群体间的遗传变异,比较了两个鸡种不同保种场的保种效果。在所检测的4个群体中,各群体均有较高的多态性,其杂合度都超过了0.55,各位点等位基因的数目为2~22。除LE110194和MCW0032外,其余26个微卫星位点都处于基因平衡状态。结果表明,4个保种场均较好的保存了这些品种的遗传多样性,但同一品种保种场间保种群体已经产生了差异。  相似文献   
3.
利用微卫星标记分析蛋鸡配套系的遗传关系   总被引:4,自引:0,他引:4  
李显耀  曲鲁江  杨宁 《遗传学报》2004,31(12):1351-1355
选用20个微卫星标记分析了2001年和2002年引进的H高产蛋鸡配套系祖代各品系之间的遗传关系,计算杂合度、多态信息含量(PIC)、有效等位基因数、Nei氏遗传距离等统计量,分析了品系内和品系间的遗传变异,并采用非加权类平均法(UPGMA)对各品系进行聚类。结果显示:每个微卫星位点的平均等位基因数为3.250,平均有效等位基因数为2.395,20个微卫星标记共有等位基因65个,各位点的PIC在0.102—0.729之间变动,平均为0.454;各位点杂合度的变动范围是0.108—0.765,各品系杂合度的分布范围是从A2001的0.390到D2001的0.452之间,各品系的杂合度较低,群体内变异较小。配套系各品系是经过高度选育的,所以群体内变异较小,本研究结果与育种实际相符合,也从另一方面说明了品系的遗传特征能够由各微卫星位点的多态性得到真实的反映。A、B两系之间的遗传距离为0.005—0.016,遗传相似系数大于0.984;C、D两系之间的遗传距离为0.094~0.119,遗传相似系数为0.900左右。这些结果表明,A、B应为同一个品系或遗传关系非常近的两个品系,C、D是两个遗传关系较远的品系。  相似文献   
4.
利用微卫星和线粒体标记分析北京鸭的起源与驯化   总被引:1,自引:0,他引:1  
北京鸭是我国最著名的家鸭品种. 为分析北京鸭的起源与驯化, 本实验采集了包括北京鸭在内的6个中国地方鸭种共190只个体, 及来自辽宁省的14只野生绿头鸭(Anas platyrhynchos)血样. 利用15个微卫星标记对这6个家鸭品种的186只个体进行遗传关系分析. 并对其中88只家鸭个体及14只野鸭个体线粒体的DNA控制区(mtDNA D-loop)的部分序列进行了扩增和测序. 利用微卫星标记计算出的遗传距离(DS)及FST分析结果表明, 北京鸭与其他中国地方鸭种的遗传分化程度较高. 聚类结果显示巢湖鸭、高邮鸭、绍兴鸭和金定鸭聚为一类, 建昌鸭、北京鸭聚为另一类. 线粒体DNA D-loop区序列分析结果表明, 虽然北京鸭群体含有所有鸭种所共有的单倍型H01, 但北京鸭的单倍型与其他家鸭仍有较大差异, 北京鸭群体具有12个独特的家鸭单倍型, 其中H02, H04, H08及H22等4个单倍型比较相近并形成单倍群A, 且H02和H22单倍型与中国绿头野鸭共有, 说明北京鸭起源于绿头鸭, 其驯化过程也基本独立于其他家鸭品种.  相似文献   
5.
藏鸡群体遗传多样性研究   总被引:18,自引:1,他引:17  
藏鸡的体型外貌和生活习性与红色原鸡非常相似,是具有自己独特群体遗传特性的高原地方鸡种。为了有效保护并合理利用这一遗传资源,我们采用多重PCR与半自动荧光标记微卫星聚丙烯酰胺凝胶电泳相结合的方法检测了20个微卫星基因座的多态性,并随机抽取藏鸡群体中部分个体进行个体体形特征与生产性能的统计。结果表明藏鸡群体的20个微卫星基因座的多态等位基因数为4~10个,平均值为7.25个/基因座,多态信息含量(CPI)和杂合度(H)平均值分别为0.67、0.74。大染色体较小染色体的微卫星标记多态性程度要高。藏鸡群体的微卫星基因座多态性丰富,也解释了生产性能不均,外貌表现迥异的群体遗传特性。 Abstract: Morphological traits and living habit of Tibetan chicken, which is an aboriginal chicken breed on plateau with its own characteristic populational genetic features, are in great common with the Red Jungle Fowl, the assumed ancestry of domestic chicken. To fully exploit this chicken resource, Multiplex PCR with semi-automated polyacrilamide gel electrophoresis (PAGE) using fluorescently labeled microsatellite primers was used to detect the polymorphism at 20 microsatellite loci. At the same time, we randomly test the individual morphology and performance. It showed that numbers of polymorphic alleles were 4-10, with mean value 7.25 per locus. Polymorphism Information Content (CPI) and Heterozygosity (H) had mean values 0.67 and 0.74, respectively. Macrochromosomes had relatively higher polymorphism than microchromosomes(P>0.05). In all, high polymorphisms at microsatellite loci related to the uneven production performance and morphological discrepancy of population genetic characteristics in Tibetan chicken.  相似文献   
6.
显性白羽基因座是影响鸡羽色形成的重要基因座位之一,该基因座上的显性等位基因I会抑制黑色素合成,从而使携带该基因的个体全身羽毛呈现白色。目前已确认鸡显性白羽基因座编码PMEL17蛋白:是一种黑素细胞特异性蛋白,在黑素细胞的分化与成熟中起到重要作用,并证明PMEL17基因的突变与显性白羽的形成有关。文章利用混合样本池建立了一种低成本、高效率,并能在大规模群体中检测PMEL17基因突变的方法,称为PCR产物混合样本池法。该方法的基本步骤如下:首先,提取个体基因组DNA,并设计相关引物对每一个体单独进行PCR扩增;其次,将PCR产物等比例混合,10个样品混在一个池中;然后,将PCR产物混合池样品于非变性聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳;最后,待电泳结束后进行银染,根据凝胶上所显条带判定是否存在突变体。此外,文章还将这种方法与传统基因组DNA混合样本池法进行了比较试验,并利用该方法对试验鸡群显性白羽基因PMEL17突变进行检测,证实该方法具有较高准确度。  相似文献   
7.
微卫星PCR产物变性与非变性PAGE-银染检测方法的比较   总被引:24,自引:0,他引:24  
曲鲁江  李显耀  杜志强  张龙超  杨宁 《遗传》2004,26(4):522-524
用鸡的微卫星引物对6个中国地方鸡种的两个微卫星位点进行PCR扩增。将扩增产物在变性与非变性聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)上进行电泳,经银染,表明微卫星产物在二者上的电泳结果有明显的差异。在非变性聚丙烯酰胺凝胶中,表现为有较多的非特异带,而在变性胶中微卫星扩增产物条带清晰,易于鉴定。Abstract:The genomic DNAs from six chicken breeds in China were amplified using two microsatellite primers. The PCR products were detected by non-denatured and denatured PAGE gels respectively, and the gels were dyed by silver. There were distinct differences between the two kinds of gel. In non-denatured gels. There were many nonspecific bands while clear purposed bands were showed in denatured gels.  相似文献   
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