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紫外交联免疫沉淀(UV cross-linking immunoprecipitation,CLIP)技术最初建立于2003年。通过紫外交联、免疫沉淀、逆转录及后续的高通量测序等步骤,可在全转录组范围鉴定特定RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBP)的靶标RNA序列和结合位点。在近20年的应用过程中,该技术被不断改进和完善,可操作性、实验结果的准确性都有所提升,技术的应用范围也有所拓展。本文对CLIP技术的基本原理、实验方法、实际应用进行介绍,着重比较几种主流CLIP技术的异同,并对如何选择具体的技术路线提出建议。 相似文献
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生物破乳剂的开发可以降低油田乳状液对石油工业和生态环境的负面影响并减少化学破乳剂的使用量。本研究建立了一套高效、便捷的破乳菌筛选方法, 并对破乳菌的特性进行研究。利用大庆油田受石油污染土壤作为菌种来源, 将Tween 60-water(0.072%, V/V)和Span 60-oil (0.028%, V/V)以6.5:3.5体积比配置出可以稳定200 h以上的O/W型乳状液, 用于破乳菌破乳效能的评价。经过分离纯化、血平板试验、排油试验和破乳试验最终筛选出2株24 h平均排油率在80%以上的优势破乳菌, 初步鉴定为芽孢杆菌属(Bascillus)。通过该破乳菌发酵条的件优化得到, 当温度为25°C, 摇床转数为160 r/min, pH值为9, 接菌量为20%时对该破乳菌生长速率最快, 积累发酵产物的量最多; 当温度为35°C, 摇床转数为120 r/min, pH值为9, 接菌量为2%时该破乳菌代谢产物的破乳活性最高。 相似文献
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葡萄糖异构酶突变体酶GIGl38P和GIG138P-G247D在变铅青链霉菌中的高效表达及检测 总被引:1,自引:0,他引:1
将含有G138P单点突变和G138P-G247D双点突变的GI结构基因,分别克隆入E.coli-链霉菌穿梭载体pHZ-1272,成功构建了穿梭表达载体pHZGI1和pHZGI2。通过原生质体的转化,将穿梭表达载体异入变铅青链霉菌TK54菌株。30℃振荡培养24h,加入2μg/mL硫链丝菌素诱导表达12h。SDS-PAGE电泳表明,两个穿梭载体在TK54菌株内表达出42.5kD特异性条带。薄层扫描显示,突变体酶GIG138P和GIG138P-G247D分别约占可溶性蛋白的19%和22%。Western杂交进一步证实GIG138P和GIG138P-G247D在变铅青链霉菌TK54中获得了表达。 相似文献
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