蛋白质序列的六维表示与相似性分析

给出了蛋白质序列的一种六维表示方法,根据这种表示方法有3种不同表示形式,利用这3种形式来构造距离矩阵的信息熵,然后通过信息熵向量的欧式距离、夹角来比较序列之间的相似性。     

寄主植物挥发物对梨小食心虫受孕雌虫的引诱作用初探

梨小食心虫Grapholita molesta(Busck),是一种世界性的蛀果害虫。利用产卵选择试验研究了15种寄主植物挥发物对梨小食心虫受孕雌虫的产卵引诱活性。室内试验表明:受孕雌虫对不同挥发物的产卵选择趋性不同,其中对叶醇和己酸丁酯表现出明显的产卵选择趋性。为验证寄主挥发物对受孕雌虫的实际诱捕效果,进行了田间诱捕试验。结果发现,挥发物中己酸丁酯、苯甲腈、叶醇、E-2-己烯醛以及乙酸己酯诱捕到的雌虫均为受孕雌虫,显著高于空白对照及其他物质,其中己酸丁酯的平均诱捕量最多,苯甲腈次之,E-2-己烯醛、乙酸己酯这两种物质的平均诱捕量分别为第三、第四,叶醇的诱捕量低于乙酸己酯,其余物质的诱捕量均较低。综合室内及田间试验结果发现,寄主植物挥发物对受孕雌虫的引诱作用也随它们之间的作用距离表现出一定的差异性。     

基于3-D图形表示的DNA序列的相似性分析

基于DNA序列的3D图形表示,通过L／L矩阵的规范化最大特征值组成的3维向量来刻画了DNA序列,并基于这种方法,用β-globin基因的第一个外显子分析了11个物种的相似性问题。     

RNA二级子结构的计数

多核苷酸的二级结构可视为一类顶点标号平面图,通常通过枚举每类RNA二级结构图的各种子图来计算其递推公式．本文给出了若干限制端环长度的RNA二级子结构的递推公式及渐近值。     

拓扑指数在生物序列相似性比较中的应用

在生物序列的二维图形表示的基础上,利用Balaban指数和信息分布指数比较生物序列的相似性,我们以包括人类等9种不同物种的DNA序列和yar029w等6种蛋白质为例来说明该方法的使用．     

RNA二级结构的最小自由能算法

RNA(即tRNA,rRNA,mRNA和SnRNA)有两大主要功能：一是某些病毒的遗传物质;二是参与蛋白质的合成,这些与细胞分化、代谢、记忆的储存等有重要关系,这些功能与RNA二级结构的稳定性。自由能密切相关．常用的计算自由能的方法有热力学微扰法及热力学微积分法等．本文以寻找最小自由能二级结构为目的,给出了RNA二级结构的最小自由能算法,该算法的时间复杂性不超过O(n^4)。     

解剖性肝叶切除与非解剖性肝叶切除治疗原发性肝癌的疗效对比研究

目的:对比解剖性肝叶切除手术(AH)与非解剖性肝叶切除手术(NAH)治疗原发性肝癌(PHC)的疗效。方法:回顾性分析2015年1月～2018年3月期间我院收治的103例PHC患者的临床资料,根据手术方式的不同将患者分为对照组(n=54)和研究组(n=49),对照组给予NAH治疗,研究组给予AH治疗,比较两组围术期指标、黑色素瘤抗原-1(MAGE-1)m RNA、甲胎蛋白(AFP)m RNA阳性表达、肝功能指标、术后并发症及复发转移情况。结果:两组患者术后7d丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(AST)、总胆红素(TBIL)均升高,但研究组低于对照组(P0.05)。研究组住院时间短于对照组,术中出血量、术中输血量、术后引流量少于对照组(P0.05),研究组手术时间长于对照组(P0.05)。两组术后28d的MAGE-1 m RNA、AFP m RNA阳性表达率均有所降低,且研究组低于对照组(P0.05)。研究组术后并发症发生率以及复发转移率均低于对照组(P0.05)。结论:与NAH术式相比,AH治疗PHC患者可有效减轻肝功能损害,下调MAGE-1 m RNA、AFP m RNA阳性表达,降低术后并发症及复发转移发生率。