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高通量测序分析DNA提取引起的对虾肠道菌群结构偏差 总被引:2,自引:0,他引:2
【目的】通过高通量测序技术,评价不同DNA试剂盒提取引起的对虾肠道菌群结构偏差,了解健康凡纳滨对虾肠道菌群结构特征。【方法】分别以细菌、粪便和组织DNA试剂盒3次重复提取凡纳滨对虾肠道总DNA(分别编号为SIB,SIS和SIT),检测DNA含量、纯度及其16S r DNA V4区可扩增性,进一步采用Illumina Mi Seq高通量测序比较SIB和SIS样品菌群组成和多样性。【结果】细菌试剂盒提取的虾肠总DNA效果最好,粪便试剂盒次之,而组织试剂盒所提DNA含量低且难以被扩增。从SIB和SIS样品分别获得52151±5085和55296±5147条有效序列,同一(46800条)测序深度下,SIS样品OTU(operational taxonomic unit)数量和Shannon多样性指数均显著高于SIB的,而SIB样品间OTU重复性则优于SIS样品间的。从SIB和SIS样品鉴定的优势门一致,均包括变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、浮霉菌门(Planctomycetes)、放线菌门(Actinobacteria)和蓝细菌门(Cyanobacteria),但不同分类水平上绝大多数优势菌群丰度在两种样品间差异明显。【结论】高通量测序分析表明对虾肠道菌群结构因DNA提取方法不同而呈现显著偏差;本研究健康凡纳滨对虾肠道核心菌群主要由发光杆菌属(Photobacterium),乳球菌属(Lactococcus),弧菌属(Vibrio),Aliivibrio和3个分类未定属构成。 相似文献
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烟草品种和温度对B型烟粉虱和温室白粉虱生物学参数的影响 总被引:4,自引:0,他引:4
在室内20℃、26℃和30℃三个设定温度条件下,研究了CF-965、NC-89和NC-82三个烟草品种对B型烟粉虱和温室白粉虱生长发育和繁殖的影响.结果表明:26℃时两种粉虱在CF-965、NC-89和NC-82三个烟草品种上的发育历期没有明显差异,但温室白粉虱卵期和若虫期的发育历期较烟粉虱依次分别延长了1.32d、2.81d和 2.04d.在CF-965上,B型烟粉虱卵期和若虫期的总存活率和平均单雌产卵量分别为54.19%和55.17粒,温室白粉虱仅分别为31.99%和39.17粒;在NC-89上,B型烟粉虱卵期和若虫期的总存活率和平均单雌产卵量分别为23.47%和37.50粒,温室白粉虱仅分别为15.75%和17.25粒;两种粉虱在NC-82上卵期和若虫期的总存活率和平均单雌产卵量差异不大,表明B型烟粉虱对CF-965和NC-89的适应能力较温室白粉虱强.两种粉虱在20℃时的发育历期最长,32℃时最短,26℃时居中.20°C时烟粉虱卵期和若虫期的存活率20.96%为最低,26℃和32℃时分别达54.19% 和53.29%;而温室白粉虱在32℃条件下存活率11.66%为最低,20℃和 26℃时分别达31 34% 和31.99%.温室白粉虱在20℃时产卵量大于烟粉虱, 在26℃时的产卵量小于烟粉虱,30℃时则不能产卵,但烟粉虱成虫30℃时的产卵量仍可达21.06粒.由此说明烟粉虱在较高温度条件下的适应能力显著强于温室白粉虱.山东烟区烟草生长中期的田间平均温度多在22~30℃,适合B型烟粉虱的发生,应引起高度重视. 相似文献
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几种药剂对桃蚜和两种瓢虫的毒力选择性研究 总被引:1,自引:0,他引:1
在室内分别测定了吡虫啉,吡虫啉+增效剂,氰戊菊酯,硫丹、乐果和灭多威6种杀虫剂对桃蚜Myzus persicae Sulzer,七星瓢虫Coccinella septempunctata Linnaeus和龟纹瓢虫Propylea japonica(Thunbery)的毒力,比较了药剂在桃蚜和两种瓢虫之间的选择毒力比值(STR),以及药剂之间选择性差异,研究了桃蚜对不同药剂相对适合度,结果表明:吡虫啉+增效剂(SVI)和吡虫啉对桃蚜的毒力均很高,LC50分别是4628mg/L和0.9535mg/L,吡虫啉在七星瓢虫和桃蚜之间,龟纹瓢虫和桃蚜之间的STR值分别是37.6和13.0,吡虫啉+增效剂的STR分别是9.84和7.75,硫丹的SR分别是54.0和7.28,都表现出显的毒力选择性,而氰戊菊酯,乐果和灭多威的STR值均很小(0.02-0.21),不仅对桃蚜毒力低,而且对两种瓢虫也不安全,用吡虫啉和吡虫啉+SV1的LC50浓度处理桃蚜,其存活个体的产仔率和单雌产仔量明显减少,与其它药剂处理相比,显降低了桃蚜的相对适合度,六种杀虫剂处理的桃蚜种群,其相对适合度大小排列为:乐果EC(0.92)>氰戊菊酯EC(0.67)>灭多威EC(0.66)>硫丹EC(0.51)>吡虫啉WP(0.40)>吡虫啉+增效剂(SV1)EC(0.18),由此证明,吡虫啉不仅对桃蚜毒力高,对天敌瓢虫杀伤力小,而且对桃蚜种群有持续控制作用。 相似文献
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【背景】某些假交替单胞菌可分泌几丁质酶,在降解利用几丁质为水产动物提供营养、免疫、抗病等方面有着重要潜力。【目的】克隆杀鱼假交替单胞菌(Pseudoalteromonas piscicida)C923的一个几丁质酶基因,实现其在大肠杆菌中的异源表达,并对重组几丁质酶的酶学性质进行研究。【方法】从菌株C923测序的基因组中注释到一个几丁质酶家族基因PpchiC,设计引物克隆该基因后进行生物信息学分析;构建载体进行异源表达并从温度、时间与诱导剂浓度进行表达优化;对表达蛋白进行最适温度与pH等酶学性质研究,同时比较了重组菌破碎后上清与沉淀及纯化的酶蛋白对几丁质的降解效应。【结果】基因PpchiC长1350bp,编码450个氨基酸,PpchiC蛋白理论分子量为48.76kDa,等电点为4.78,不稳定系数为29.08。结构域分析发现该蛋白含有一个类型Ⅲ几丁质结合域和一个糖苷水解酶18家族(glycosyl hydrolase 18,GH18)的催化域;PpchiC蛋白含有GH18家族几丁质酶的保守催化基序DxxDxDxE、YxR和[E/D]xx[V/I]。16℃、0.25mmol/L IPTG、诱导12h为其最优化表达条件,PpchiC在50℃、pH8.0时表现出最大酶活性;以胶体几丁质为底物时,PpchiC的Km值为2.58mg/mL、Vmax值为5.04mg/(mL·min)。降解结果表明,菌体的沉淀与上清及从上清中纯化的酶蛋白均有着较好的几丁质降解效应。【结论】杀鱼假交替单胞菌C923基因PpchiC编码GH18家族的几丁质酶,能被大肠杆菌高效表达且降解几丁质效应明显,这为PpchiC及菌株C923的应用提供了参考依据。 相似文献
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六种昆虫生长调节剂对葱蝇生长发育和繁殖力的影响 总被引:2,自引:0,他引:2
用灭蝇胺、氟铃脲等6种昆虫生长调节剂和对比药剂辛硫磷LC40-50浓度处理葱蝇1龄和3龄幼虫,观察对其生长发育和繁殖的影响;并且研究了葱蝇成虫取食药剂对其繁殖力的控制效应。结果表明:6种药剂中除虫酰肼外,其余都对葱蝇幼虫发育历期、化蛹率、成虫产卵前期、成虫寿命、产卵量有很大影响,对其生长发育和繁殖表现出显著不利性。其中灭蝇胺和氟铃脲处理1龄幼虫后,存活幼虫的历期和成虫产卵前期各延长3天,化蛹率降低26.7%~30.0%,成虫寿命缩短22.3~24.3天,产卵量降低35.5%~49.9%;处理3龄幼虫主要导致产生畸形蛹,且正常羽化的成虫寿命降低18.0~20.67天,产卵量降低45.7%~57.8%。成虫连续取食用牛奶稀释的2 000倍的药液,能导致产卵前期延长、产卵量减少、卵孵化率降低,幼虫死亡率极高,达95%以上。结果提示,利用成虫补充营养的特性,将灭蝇胺和氟铃脲等混入牛奶或糖水中诱集成虫取食,可有效降低成虫的繁殖力,有助于实现对葱蝇的无公害治理。 相似文献
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黄荆精油对玉米象的杀虫活性成分、毒力及作用机制 总被引:2,自引:1,他引:1
为明确黄荆精油及其主要成分作为储粮保护剂的开发利用价值,采用水蒸气蒸馏法从泰山黄荆Vitex negundo Linn.叶片中提取精油,利用GC-MS技术进行了成分分析鉴定,研究了黄荆精油及其主要成分桉树脑和α-蒎烯对玉米象 Sitophilus zeamais Motschulsky 成虫的毒力及作用机制。结果表明: 黄荆精油中含量大于0.3%的成分有31种,其中石竹烯、桉树脑和α-蒎烯的含量分别为35.97%,8.21%和0.69%。桉树脑、α-蒎烯和黄荆精油对玉米象成虫的综合杀虫毒力都较高,并以桉树脑的毒力最高,LC50为0.7171 g·kg-1;在2.0 g·kg-1剂量下,桉树脑、α-蒎烯和黄荆精油对玉米象种群的抑制率分别达100%,85.45%和89.73%;3种药剂对玉米象72 h触杀LC50分别为0.2690,0.7529 和0.2969 mg·cm-2,毒力都很高;3种药剂在4 g·kg-1剂量下,对玉米象的驱避率分别为96.49%,84.26%和90.61%,防虫作用大;3种药剂对玉米象72 h的熏蒸LC50分别为14.053, 28.648 和21.429 μL·L-1,熏蒸杀虫毒力较高,其中以桉树脑的毒力最高。3种药剂对玉米象有干扰呼吸的作用,对离体乙酰胆碱酯酶、过氧化氢酶和羧酸酯酶都有抑制作用。这些结果明黄荆精油及其主要成分的作用机制具有多样性。 相似文献
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光复活对紫外线照射大肠杆菌后突变率的影响 总被引:1,自引:1,他引:0
通过改变UV照射时间、照射后的操作速度、光复活时的温度、时间和光强度,以光复活和暗处理后细胞存活数的比值为依据,研究了不同条件下E.coli受UV照射后的光复活效应。并以E.coli对5μg/ml链霉素抗性突变率为指标,比较了不同剂量UV照射后光复活和暗处理对E.coli突变率的影响。结果表明:光复活效应在温度10℃时最明显,且与照射时间、照射后的操作速度、光复活时间和光强度成正相关;在中、低剂量UV照射后,暗处理较光复活后E.coli对链霉素抗性突变率明显高,而在高剂量下,光复活则显著高于暗处理后的突变率。 相似文献
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黄荆提取物对小菜蛾幼虫毒力及对成虫的产卵忌避作用 总被引:12,自引:1,他引:11
系统地研究了黄荆种子和叶片的二氯甲烷、石油醚和甲醇提取物对小菜蛾2龄和4龄幼虫的毒力及其对成虫的产卵忌避作用.结果表明,6种提取物中,以二氯甲烷种子提取物对幼虫的毒力最高,二氯甲烷叶片提取物次之,甲醇叶片提取物的毒力最低.二氯甲烷种子提取物对2龄和4龄幼虫的毒力分别是甲醇叶片提取物的2.62倍和3.09倍,对4龄幼虫的毒力达辛硫磷的0.73倍,杀虫活性较高.甲醇叶片提取物和二氯甲烷种子提取物对小菜蛾成虫有较高的产卵忌避作用,在4 000 mg·L-1浓度下,处理后24 h,产卵忌避率分别为60.6%和55.2%,且持效性也较好,处理后72 h忌避率仍分别达50.9%和46.1%. 相似文献
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草坪害虫淡剑袭夜蛾生物学及防治技术的研究 总被引:5,自引:0,他引:5
淡剑袭夜蛾(Sidemia depravata Butler)在山东草坪草上1年发生4-5代,危害盛期在7-8月。田间发生量以冷季型草托亚黑麦草上最多,猎狗高羊茅和午夜早熟禾次之,暖季型草牙根上最少。4种草坪草品种对其幼虫发育历期、雌雄蛹重、单雌产卵量和存活率均有影响,但对蛹期影响不大。管理措施对幼虫的发生量有显影响,以长势好、田间湿度大、刈草不及时的地块发生重。拟除虫菊酯类的夜蛾必杀和高效氯氰菊酯。有机磷类的敌百虫、辛硫磷和奎硫磷对该虫都很敏感,在常用浓度下防效均达95%以上。Bt乳剂和灭幼脲3号对低龄期幼虫防治效果高,但速效性差。 相似文献