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用差异显示PCR法筛选与血管外膜细胞表型转化相关的基因 总被引:8,自引:2,他引:6
为筛选血管外膜成纤维细胞(adventitial fibroblast,AF)与肌成纤维细胞(myofibroblast,MF)间表型转化有关的基因,实验建立了大鼠胸主动脉AF和MF两种细胞模型,用差异显示聚合酶链反应(DD-PCR)技术获得表达差异片段,对差异片段进行克隆和测序分析,并用定量PCR和Northern blot对差别显示结果进行验证。用反义核酸转染技术观察骨桥蛋白(osteopontin,OPN)对AF迁移的影响。结果表明,两种表型细胞存在明显的基因表达差异,其中一个在MF下调的差异片段与GenBank中NADH脱氢酶亚单位5(NADH dehydrogenase subunit 5,Nd5)基因高度同源。另一个在MF上调的差异片段与OPN基因同源。上述差异表达结果被定量PCR及Northern blot证实。此外还有4个表达序列标志(expressed sequence-tag,EST)在GenBank中未查到同源序列。反义OPN寡脱氧核甘酸可抑制AF的迁移活动。结果提示,AF转化为MF可能与ND5基因下调、OPN上调及其它未知基因的表达改变有关。应用反义技术适度抑制OPN表达在防治血管重塑中具有重要作用。 相似文献
94.
用RDA技术寻找肝再生相关基因的初步研究 总被引:2,自引:0,他引:2
利用表达性差异显示分析 (RDA)技术 ,研究大鼠 2 /3肝部分切除后 1h肝组织中基因的选择性表达 ,建立了大鼠 2 /3肝部分切除术后 1h再生肝组织选择性表达基因EST库。该库约含 3× 10 4 个独立克隆 ,其中 95 %以上的克隆含有插入片段 ,长度约 2 0 0~ 70 0bp不等 ,对随机挑出的 5 2个克隆的序列分析表明其中大多数基因与肝再生调控相关 (38/5 2 )。 10株未报道序列经RNA杂交证实 ,其中 6株与肝再生相关。 相似文献
95.
四种十足目甲壳动物遗传差异的RAPD分析 总被引:16,自引:0,他引:16
采用RAPD技术,对分类阶元不同的四种十足目甲壳动物:克氏原螯虾、汉水华溪蟹、日本绒螯蟹合浦亚种和中华绒螯蟹,进行了遗传多态性的研究。四个物种DNA库的扩增结果表明,随着亲缘关系由近变远,物种间的相似率依次减小,由56.1%下降至22.3%.用UPGMA方法作聚类分析构建出物种的系统树图、反映出四个物种对应的种、科间、科间以上遗传差异逐步增大,这与以形态标记为主的分类结果相一致。在同工酶分析难以揭 相似文献
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小麦品种间感染纹枯病的差异及普遍率与严重度的关系 总被引:4,自引:0,他引:4
通过人工接菌方法比较了6个小麦主栽品种间感染纹枯病的差异,结果表明,高感类型有阜阳861、温麦4号和皖麦19,中感类型有扬麦158、豫麦18和豫麦21.各品种苗期病株率反映不出品种感病程度的差异,以灌浆后期的病情指数为标准比较品种间抗感染程度较为适宜.认为寄主生育阶段影响小麦纹枯病的IS关系.回归分析表明,按内茎和外茎发病程度分级可减少田间调查误差,且省时省工. 相似文献
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本文对mRNA差异展示法进行了改良,利用一组随机引物与来源于mRNA翻译起始位点区域的引物组合进行RT-PCR,使差异展示的片段来源于蛋白编码区,并对差异展示的条件进行了优化。应用此法对人鼻咽上皮与软腭口腔粘膜上皮扔基因表达进行了比较研究。得到了10个在鼻咽上皮特异表达的cDNA片段,并对其中的5个片段进行了亚克隆和序列分析。通过与GeneBank数据库中的序列进行同源性比较,确定其中两个片段为未 相似文献
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随着质谱技术的快速发展,蛋白质组学已成为继基因组学、转录组学之后的又一研究热点,寻找可靠的差异表达蛋白对于生物标记物的发现至关重要.因此,如何准确、灵敏地筛选出差异蛋白已成为基于质谱的定量蛋白质组学的主要研究内容之一.目前,针对该问题的研究方法众多,但这些方法策略的适用范围不尽相同.总体来说,基于质谱技术筛选差异蛋白的统计学策略可以分为3类:基于经典统计学派的策略、基于贝叶斯学派的统计检验策略和其他策略,这3类方法有各自的应用范围、特点及不足.此外,筛选过程还将产生部分假阳性结果,可以采用其他方法对差异表达蛋白的质量进行控制,以提高统计检验结果的可靠性. 相似文献
100.
我国华东沿海4种石磺形态学比较 总被引:6,自引:0,他引:6
我国华东沿海分布有瘤背石磺(Onchidium struma)、平疣桑椹石磺(Platevindex mortoni)、里氏拟石磺(Paraoncidium reevesii)、紫色疣石磺(Peronia verruculata)4属4种石磺,后3种为我国大陆沿海新纪录种。通过野外实地调查和实验室暂养分别观察了其生态习性及外部形态,测定外形主要生物学性状指标进行统计分析;同时解剖比较4种石磺的生殖系统和消化系统等内部结构。结果显示,4种石磺的生活区域分别从潮间带中潮区至高潮区再到潮上带而呈现梯度分布状态,生活区域的不同导致生活习性、呼吸方式的不同;4种石磺外部形态差别明显,身体背部和腹足的颜色不同,平疣桑椹石磺没有背眼,腹足灰黑色或灰白色,惟紫色疣石磺有树枝状鳃;在内部结构中,平疣桑椹石磺无阴茎附属腺,里氏拟石磺无阴茎牵引肌且与紫色疣石磺一样不具有肛门腺。主要生物学性状数据分析得出足长和足宽是典型代表数据,判别分析得出呼吸孔至身体末端距离与肛门至呼吸孔距离的比例是属种间具有显著性意义的观察指标,从外形及内部主要结构比较发现将它们分属4个种是准确的。外部形态的特殊结构以及内部结构主要差异可作为石磺科分类的主要依据;比较我国华东沿海石磺的形态学差异能为石磺科贝类模式种资料的重新修订提供良好的研究基础。 相似文献