k-长DNA子序列频数分布研究

在详细阐述了生成DNA序列分形图像的Hao方法后,提出一种能够直观显示k-长DNA子序列频数分布差异性的三维频数分布图生成方法。把3D频数分布图转化为1D对数频谱图,突出显示了频数分布的局部特征,提出k-长DNA子序列频数区划分准则,并详细研究了甚高频数区的n阶零间隔现象,指出n阶零间隔分布就是基因组进化过程所留痕迹的假设,并给出对数频谱图特征的生物学解释。实验发现许多DNA序列频数概率分布近似服从非中心F分布,对于分布呈多峰现象的基因组序列,可采用多个非中心F分布的叠加来拟合。在比较非中心F分布与Gamma分布后,提出一种结合二者在拟合方面具有互补优势的新分布,实验证明这种新分布能够更好地吻合实际DNA序列的频数分布。最后研究了两种特异出现频数(最高出现频数与出现频数为1的k-长子序列个数)与k值的关系,发现不同物种的这两种关系具有良好的一致性。     

浙江煤山剖面二叠纪末的小有孔虫动物群

通过对浙江长兴煤山剖面长兴阶上部和二叠系三叠系界线地层进行系统切片和研究,共鉴别出小有孔虫化石18属50种。这一丰富的有孔虫动物群,不仅进一步完善了长兴阶标准剖面的化石资料,而且也为研究二叠纪末的生物灭绝形式提供了新的依据。     

浙江常山黄泥塘Didymograptus (Corymbograptus)deflexus带的笔石

浙江常山黄泥塘剖面是中奥陶统达瑞威尔阶的全球界线层型剖面点(GSSP)。文中讨论了黄泥塘剖面宁国组底部Didymograptus(Corymbograptus)deflexus带的笔石动物群,并描述了其中一部分属种。根据该带含牙形刺灰岩夹笔石页岩地层在常山、江山地区纵向和横向的分布,在宁国组下部建立了黄泥塘段。     

论泥盆纪和布克河珊瑚及其相关属

和布克河珊瑚（Hebukophyllum Liao and Cai,1987)产于新疆北部和布克赛尔蒙古族自治县上泥盆统洪古勒楞组。该属的特征明显,描述清楚,个体发育各个阶段的图影齐全,而且在国际学术界已经得到不少珊瑚专家的认可（Weyer,1994),但目前仍有一学者主张将它视为Circellia Ye and Wang 1983的同义名（Yu,1998,Pory and Boland,1996;Boland,1997)。经最近对这２属模式标本的进一步深入研究表明,虽然Ｈebukophyllum成年期的特征与Ｃircellia,Coniophyllum,Siphonophyllia等属有某些相似之处,但其幼年期的隔壁强烈加厚并在个体中央形成一个明显的轴管（aulos)明显不同于后３属,Ｈebukophyllum明显不属于caninoid型珊瑚;Circellia是一种隔壁成一个明显的轴管（aulos),明显不同于后３属。Hebukophyllum明显不属于caninoid型珊瑚;Circellia是一种隔壁构造十分不发育的小单体珊瑚,也不属于caninoid型珊瑚;Conilophyllum Poty and Boland,1996和Ｓiphonophyllia Scouler MS in McCoy,１８４４则属于典型的caninoid型珊瑚,因此,上述几个属之间并无密切的亲缘关系,它们应分属于不同的科：Ｆamily(科）Ａmplexidae Chapman,1893Genus（属）Circellia Ye and Wang,1983Ｆamily(科）Ｌaccophyllidae Grabau,1928,Genus(属）Hebukophyllum Liao and Cai,1987 Family(科）Caninidae Fomichev,1953,Genus(属）Conilophyllum Poty and Boland,1996Genus(属）Ｓiphonophyllia Scouler MS in McCoy,1844本文曾在１９９９年９月在日本仙台市如开第８次国际化刺丝胞与多孔类大会上（８th International Symposium on Fossil Cnidaria an Porifera)宣读,会上笔者曾与比利时珊瑚专家Ｐoty博士进行了交流和讨论,会后我们又特地向中国地质大学（武汉）王治平、叶干教授借阅了Circellia的模式标本进行了比较深入的研究,我们在此表示衷心的感谢。     

早寒武世马哈螺类的骨骼化特征、分类和演化意义

马哈螺类（maikhanellids)是已知最古老的单板类,以往缺乏系统研究,并在分类上争议较大,文中以滇东早寒武世梅树村阶微小骨骼化石的丰富材料为依据,详细阐述该类群的形态特征和超微结构,探讨其亲缘关系和演化趋势,研究表明,马哈螺类由6个属组成,包括Maikhanella,Ramenta,Ramentoides gen.nov.,Mediata gen.nov.,Yunnanopleure和Purella。各属之间壳形变化较大,但裸露的壳顶和普遍发育的鳞片状或条状突起表明它们在明显的亲缘关系,并显示两个演化方向,即Maikhanella Ramentoides gen.nov.Ramenta和Maikhanella Mediata gen.nov.Yunanopleura-Purella。马哈螺类分布于梅树村期早,中期,Maikhanella是最原始的马哈螺,最先出现在梅树村阶小歪头山段,也是中谊村段下磷矿层唯一的马哈螺,而在该段上磷矿层马哈螺类发生了明显的属种分异,在大少段所有的马哈螺类突然消失,马哈螺类的壳体曾被描述为：骨针状的外骨骼”,“骨片状外骼”和“包裹在中间基质中的骨针”,但当前研究表明,以Maikhanella pristinis和Ramenta cambrina为代表的马哈螺类的内壳层具有早期单板类中较常见的水平交错纤状结构,指示了马哈螺类具有致密成层的壳壁,文中新建2亚科,2属和5种,即Maikhanellinae subfamily nov.,Purellinae subfamily nov.,Maikhanella Perelegans sp.nov.,Ramenta superata sp.nov.,Ramentoides latispinus gen.et sp.nov.,Mediata kunyangensis gen.et sp.nov.,Yunnanopleura longidens sp.nov。     

极小种群博罗红豆所在群落物种组成和空间分布格局

为保护博罗红豆（Ormosia boluoensis）资源,基于广东象头山国家级自然保护区建立的0.6 hm²固定样地,研究了博罗红豆所在群落的物种组成、径阶结构、空间格局、种内关联及其与群落优势种的种间关联。结果表明,样地内共调查到胸径≥1 cm的木本植物4 503株,隶属于38科57属84种。优势种有甜槠（Castanopsis eyrei）、密花树（Rapanea neriifolia）、密花山矾（Symplocos congesta）、深山含笑（Michelia maudiae）和赤楠（Syzygium buxifolium）等,博罗红豆的重要值仅为1.84%,径阶结构呈倒“J”型,空间分布格局在0~22.1 m的尺度上呈现聚集分布,在22.2~30.0 m的尺度上呈随机分布。博罗红豆与甜槠无关联性,与赤楠在个别尺度上有微弱的负相关性,与密花山矾主要呈负关联性,与密花树、深山含笑主要呈正关联性。博罗红豆的成树和幼苗在0~3.7 m的空间尺度上呈现强正关联,小树和幼苗在0~5.9 m的尺度上呈正关联性,而成树与小树的关联性较弱。因此,推测博罗红豆的空间分布格局受负密度制约、种子扩散限制和生境异质性的作用,在后期的管理中可以适当移植幼苗和对群落中的灌木及小乔木进行适度的疏伐。     

山东枣庄峄城区石榴园寒武系馒头组顶部(徐庄阶)的三叶虫北大核心CSCD

首次在山东馒头组上部发现徐庄期三叶虫Sinopagetiajinnanensis带和Sunaspis laevis-Sunaspidella rara带,其中Sunaspis laevis-Sunaspidella rara带从馒头组上部延伸到张夏组底部,也是迄今为止所发现的张夏组在华北地区最低层位。文中共描述三叶虫3目,10科,15属(亚属),14种,5未定种,1未定属种,其中有5新种:Sestrostega cylindricasp.nov.,Pseudinouyia shiliuyuanensis sp.nov.,Erratojincella?decorasp.nov.,Iranoleesia(Proasaphiscina?)subconicasp.nov.,Shanxiella(Shanxiella)latilimbatasp.nov.,对于华北地区与国内外同期地层对比及三叶虫的分类和系统演化具有重要意义。     

福建上杭晚石炭世(竹蜓)类Profusulinella动物群及其地层意义

对福建上杭晚石炭世(竹蜓)类Profusulinella动物群的系统研究,共鉴定(竹蜓)类化石4属17种.根据它们在地层中的分布和垂向变化规律,自上而下建立一个(竹蜓)带、两个亚带:Profusulinella带,2). Profusulinella wangyüi-Eofusulina triangula亚带,1). Profusulinella staffellaeformis亚带.通过与华南、华北、西北沉积区和欧美同期地层的对比,认为本区含Profusulinella动物群的地层应归于上石炭统达拉阶下部,相当于国际地层表中的巴什基尔阶上部至莫斯科阶下部.     

中国晚石炭世达拉阶标准剖面的(筳)

详细研究达拉阶标准剖面的ting化石,计有14属74种及亚种,其中未定种1种,建立6个ting化石带,自下而上依次为：Profusulinella priscoidea-P．parva带,Profusulinella aljutovica-Taitzehoella taitzehoensis extensa带,Fusulinella obesa-F．eopulchra带,Fusulina lanceolata-Fusulinella vozhgalensis带,Fusulina pakhrPnsis-Pseu-dostaffella paradoxa带及Fusulina cylindrica-F,quasifusulinoides带。标准剖面的达拉阶应与国际地层表中的巴什基尔阶上部和莫斯科阶相当。     

后基因组时代生物信息学的发展趋势

介绍生物信息学产生背景、发展过程以及研究现状,讨论了后基因组时代分子生物学的主要研究领域功能基因组学、蛋白质组学、比较基因组学、药物基因组学之间的关系。在分析基因组时代和后基因组时代生物信息学所研究内容的差异基础上．说明了基于分层递阶结构的系统结构、特征分析方法以及相应的软件系统开发将成为生物信息学发展的基本趋势之一。