基于R的结构方程模型在生态学中的应用

结构方程模型已经成为当前生态数据分析的主要方法之一。与其他多变量统计方法不同,结构方程模型的建模过程由理论假设驱动,且可以同时量化多个变量间的直接和间接因果关系。然而,由于结构方程模型引入国内生态学领域的时间相对较短,研究者经常在实际应用中遇到各种问题,各种使用错误也屡见不鲜。对此,本文系统阐述了结构方程模型的建模原理、建模流程、模型评价、模型修正等方面内容,并且结合具体研究案例介绍了结构方程模型分析的两个主流R包—lavaan和piecewiseSEM。其中,lavaan可以分析纳入了潜变量的结构方程模型,piecewiseSEM则可以解决各观测数据不独立以及响应变量残差不满足多元正态分布等问题。本文将有助于研究者准确理解结构方程模型并能扩大其在生态学中的应用。     

Increased complexity of gene structure and base composition in vertebrates

How the structure and base composition of genes changed with the evolution of vertebrates remains a puzzling question. Here we analyzed 895 orthologous protein-coding genes in six multicellular animals: human, chicken, zebrafish, sea squirt, fruit fly, and worm. Our analyses reveal that many gene regions, particularly intron and 3' UTR, gradually expanded throughout the evolution of vertebrates from their invertebrate ancestors, and that the number of exons per gene increased. Studies based on all protein-coding genes in each genome provide consistent results.We also find that GC-content increased in many gene regions (especially 5' UTR) in the evolution of endotherms, except in coding-exons.Analysis of individual genomes shows that 3′ UTR demonstrated stronger length and CC-content correlation with intron than 5' UTR, and gene with large intron in all six species demonstrated relatively similar GC-content. Our data indicates a great increase in complexity in vertebrate genes and we propose that the requirement for morphological and functional changes is probably the driving force behind the evolution of structure and base composition complexity in multicellular animal genes.     

岷江干旱河谷植物群落的复杂性

通过对岷江干旱河谷植被及环境因子的系统取样调查,研究了该地区植物群落复杂性及其与环境因子的关系,探讨了群落复杂性与多样性、均匀度、物种丰富度之间的关系.随着海拔的增加,群落总复杂性和结构复杂性均表现为“高-低-高”的变化趋势,表明高海拔和低海拔段有较高的复杂性,中海拔段复杂性较低;位于干旱河谷核心区的样带3、4较北部过渡区样带1、2和南部过渡区样带5、6有着较低的群落总复杂性;不同坡位、坡形及坡向,群落总复杂性和结构复杂性,均表现为上坡位＞下坡位＞中坡位,凹坡＞平破＞凸坡,阴坡＞半阴半阳坡＞阳坡.华帚菊-小黄素馨灌丛的总复杂性最高,西南野丁香灌丛、驼绒藜灌丛的总复杂性最低,橿子栎灌丛和群小花滇紫草灌丛的结构复杂性较高; 群落总复杂性与有机质、全N、土壤含水量、水解N、速效K呈现出显著的二次曲线关系,与全K、全P、速效P、pH值没有明显的相关关系.总复杂性与多样性、均匀度、物种丰富度的关系密切,均呈现显著的线性正相关关系.均匀度和结构复杂性呈现极显著的线性负相关,表明结构复杂性随均匀度的增加而减小.作为群落总复杂性与多样性的区分,结构复杂性对群落内物种数的变化较为敏感,不仅与均匀度有关,还与群落物种数量有关.结构复杂性和多样性作为群落总复杂性的两个组成部分,对总复杂性的影响随着研究区域和群落的不同而不同.     

2015-2016年宿州市肾结石患病现况调查及危险因素分析

摘要 目的：分析2015-2016年安徽省宿州市肾结石患病情况,并分析该地区肾结石患病的危险因素,为肾结石的防治提供依据。方法：选择2015年1月~2016年12月间于我院就诊的肾结石患者110例作为研究组,选择同期本院体检的健康志愿者110例作为对照组。调查两组基本信息、临床资料、饮食习惯等,并应用单因素和多因素Logistic回归分析分析肾结石患病的危险因素。结果：108名肾结石患者年龄18~75岁,45~55岁所占比例最高,占34.04%,其次是35~44岁,占25.53%,55~64岁,占17.02%。单因素分析显示,宿州市肾结石患者发病与吸烟指数、饮酒指数、饮食习惯、每日饮水量、直系亲属肾结石史、尿路感染史、BMI有关（P<0.05）,与文化程度、月收入无关（P>0.05）。多因素Logistic回归分析结果显示饮酒指数≥200、喜食肉蛋、喜食海鲜、每日饮水量<1000 mL、直系亲属有肾结石史、有尿路感染史、体质量指数(BMI)>24 kg/m²是宿州市肾结石患者发病的危险因素（P<0.05）。结论：宿州市肾结石患者发病年龄多集中于45~55岁,且该地区发病的危险因素包括饮酒指数≥200、喜食肉蛋、喜食海鲜、每日饮水量<1000 mL、直系亲属有肾结石史、有尿路感染史、BMI>24 kg/m²,可作为防治肾结石的参考依据。     

输尿管软镜与经皮肾镜碎石术对≤2 cm肾结石患者血清IL-6、IL-10、Cor水平的影响及安全性研究

目的:比较输尿管软镜碎石术(FURL)与经皮肾镜碎石术(PCNL)治疗≤2 cm肾结石的疗效及对患者血清白介素(IL)-6、IL-10、皮质醇(Cor)水平的影响以及手术治疗的安全性。方法:选择2015年2月~2017年2月我院泌尿外科收治的132例直径≤2 cm的肾结石患者作为研究对象,其中行FURL治疗者72例,行PCNL治疗者60例,比较两组围手术期相关临床指标、治疗前后肾功能以及血清IL-6、IL-10、Cor水平的变化。结果:FURL组术后住院时间较PCNL组显著缩短,术后输血率较PCNL组显著降低(P0.01);两组手术时间、结石总清除率比较差异无统计学意义(P0.05)。PCNL组术后24 h Hb值较术前显著降低(P0.01),FURL组无明显变化(P0.05);两组术后24 h WBC值较术前显著升高(P0.01),但两组组间比较无明显差异(P0.05)。两组术后1h血清IL-6、IL-10、Cor水平均较术前显著升高,术后1、3、5d逐渐降低,FURL组术后1 h、1、3、5 d血清IL-6、IL-10、Cor水平均较PCNL组各时点显著降低(P0.01)。两组术后6 h、1、2 d尿Kim-1及血清CysC水平均较术前显著升高(P0.01),FURL组尿Kim-1水平于术后3 d恢复至正常水平,PCNL组为术后5d恢复正常,PCNL组血CysC水平于术后3 d恢复至正常水平,FURL组为术后5 d恢复正常;FURL组术后2、3 d尿Kim-1水平显著低于PCNL组同时点(P0.01),术后1、2、3 d血Cys C水平显著高于PCNL组同时点(P0.01)。结论:FURL与PCNL治疗直径≤2cm的肾结石均能取得满意的取石效果,但FURL手术创伤更小、出血更少,术后应激反应更轻,更有利于术后机体恢复。     

基于复杂性度量的表面肌电信号分类方法

提取表面肌电信号的复杂性测度信息,利用原始数据的复杂度指标构造特征矢量对四种前臂动作进行分类,取得了较好的识别效果.通过比较,发现基于原始数据的复杂度指标在分类性能上要优于基于重构序列的复杂度.肌电信号的复杂度算法简单,适合短数据运算,能够满足实时处理的要求.作为一种新的肌电信号特征,复杂性测度也为生理与病理分析提供了新的思路.     

复杂性结石患者术前应用3D数字打印肾脏仿真技术及手术过程模拟的效果分析

摘要 目的：探讨复杂性结石患者术前应用3D数字打印肾脏仿真技术及手术过程模拟的效果。方法：选入2020年9月至2021年5月在本院就诊的复杂性肾结石患者60例,分为对照组与研究组,各30例。对照组行经皮肾镜碎石术（PCNL）联合输尿管软镜手术,研究组在对照组基础上应用3D打印技术。评价并比较两组的围术期情况、肾功能指标、结石清石率、术后并发症情况等。结果：研究组总手术时间等围手术期指标较对照组低（P＜0.05）;研究组术后血清Scr水平明显低于对照组,BUN显著高于对照组（P＜0.05）,两组术后血清Cys-C水平无明显差异（P＞0.05）;研究组残留结石直径明显小于对照组,结石清除率显著高于对照组（P＜0.05）;两组并发症发生率无明显差异（P>0.05）。结论：术前应用3D数字打印肾脏仿真技术及手术过程模拟可帮助术者快速、准确定位结石位置,提高手术效率及一次性结石清除率,减轻肾脏损伤,降低手术风险。     

动态神经元网络模型的复杂性问题

在动态神经元网络模型中,当神经元总数仅为３时就观察到了非周期振荡。运用Ｌｅｍｐｅｌ和Ｚｉｖ提出的复杂性度量对这种现象进行了分析,结果表明对于其中一个神经元所发出的脉冲序列来说,至少直到１０００个脉冲为止还不能发现任何的周期性,并且其复杂性可以和由ｌｏｇｉｓｔｉｃ映射所产生的时间序列当其参数落在混沌区中时所具有的复杂性相比拟．这些结果也表明这种方法是所观察的时间范围内区分长周期振荡和非周期活动的好方法。结果还提示神经生理实验记录中所谓的噪声,其中有些可能是来源于生物神经元本身的非线性性质。     

VCTDSA联合CT 灌乌司他丁联合硝苯地平控释片对ESWL 术后肾功能的保护作用

目的：观察乌司他丁(商品名天普洛安)和硝苯地平控释片(商品名拜新同)对体外冲击波碎石术(ESWL)所致急性肾功能损害 的保护作用。方法：将80 例接受ESWL治疗的肾结石患者,随机分为天普洛安组、拜新同组、天普洛安和拜新同联合组以及对照 组,每组20 例。检测并比较ESWL 前1 d 和后1、3、5 d 患者尿丙二醛(MDA)、N- 乙酰-beta-D- 氨基葡萄糖苷酶/ 肌酐(NAG/Cr)和 24 h尿beta2-微球蛋白(beta2-MG)的变化。结果：EWSL术后第1 天,对照组MDA、NAG/Cr和茁2-MG 水平均明显高于术前(P＜0.05), 且随着术后时间的延长,患者MDA、NAG/Cr 和beta2-MG 水平呈逐渐下降趋势,术后第1、3、5 天治疗组MDA、NAG/Cr 和beta2-MG 数值均明显低于相同时点对照组(P＜0. 05)。术后第1、3 天,联合用药组MDA、NAG/Cr和beta2-MG 水平明显低于单独用药的两组 (乌司他丁组和拜新同组)(P＜0.05),第5 天联合用药组MDA、NAG/Cr 和beta2-MG 水平与单独用药的两组(乌司他丁组和拜新同 组)比较均无明显差异(P＞0.05),单独用药的两组(乌司他丁组和拜新同组)之间在相同时点MDA、NAG/Cr 和beta2-MG 水平无明显 差异。结论：乌司他丁可显著减轻ESWL所致的肾损伤,与钙离子拮抗剂联合用药效果更佳。     

彩色多普勒超声引导下经皮肾镜取石术（PCNL）治疗复杂性肾结石的临 床分析

摘要目的：总结彩色多普勒超声引导下经皮肾镜取石术（percutaneous nephrolithotomy,PCNL) 治疗的复杂性肾结石的经验及其 安全性、有效性以及常见并发症。方法：回顾性分析我院2011 年7 月～2012 年8 月采用彩色多普勒引导下经皮肾镜治疗复杂性 肾结石患者56 例的临床资料。结果：所有患者均I期建立经皮肾通道,平均手术时间(107.5± 27.5)分钟,24 例行EMS 气压弹道联 合超声碎石(101.0± 27.9)分钟,20 例行钬激光联合超声碎石(119.4± 23.6)分钟,10 例行单纯超声碎石(108.2± 30.2)分钟,EMS 气 压弹道联合超声碎石组的手术时间少于钬激光碎石组,差异有统计学意义（P<0.05,单纯超声碎石组与另外两组比较无统计学意 义P>0.05)。术前肾功能损伤患者术后随访,肾功能明显改善。结石完全清除率91%,结石部分残留率9%。术中均无严重出血,无 周边脏器损伤。术后出现迟发出血5 例,反复发热4 例,均经对症治疗后缓解。结论：彩色多普勒超声引导除了具有普通超声引导 的优势外,还可有效避开肾实质大血管损伤,减少术中及术后出血风险。彩色多普勒超声引导下经皮肾镜碎石取石术是一种治疗 复杂性肾结石安全、有效的方法。