人类SR蛋白超家族新成员——SFRS12(SRrp508)的基因克隆和特性分析

采用生物信息学方法克隆出全长3811bp的人类RC508cDNA片段,经核酸和蛋白质分析为人类新基因（Gen-Bank登记号：AF459094）,利用RT－PCR方法从人类胰脏组织中扩增出包含码508个氨基酸残基最大开放读码框架（ORF）的1680bp cDNA片段,经核酸测序证明与电子克隆结果完全一致。该基因具有启动子和TATA-box,ORF前同一相位有多个终子码,后有加尾信号,显示为客观存在基因。该基因含有12个外显子（96－2093bp)和11个内含子（140－5153bp),定位于人类5号染色体5q11.2-q12.1,无任何连锁基因存在。该基因ORF342－1868（1527）横跨10个外显子,所编码508氨基酸蛋白的全长序列与大鼠丝氨酸－精氨酸二肽富含性（SR）剪切调控蛋白86（1527）横跨10外显子,所编码508氨基酸蛋白的全长序列与全长序列与大鼠丝氨酸－精氨酸二肽富含性（SR）剪切调控蛋白86（SRrp86)高度同源,在核酸和蛋白水平的同源性分别为84％和86％,与其他已知蛋白无论在核酸水平是在氨基酸水平几乎均无整体的同源性。结果表明,所克隆的508氨基酸蛋白才是大鼠SRrp86的人类同源物,从而修正了Barnard(2000)所指出的人类同源物为人类精氨酸富含性核蛋白54（p54)这一论断,并提示它是日益增长的SR蛋白超家族的又一个新成员。该基因组织表达谱广泛,有可能具有转录因子活性,暂命名为SR相关剪切调控蛋白508（SRrp508)。国际人类基因命名委员会已将其命名为丝氨酸－精氨酸二肽含性剪切因子12（splicing factor,arginine/serine-rich),缩写为SFRZS12,化名为DKFZp564B176,SRrp86。     

不同栽培措施对降香黄檀内源激素含量的影响

为了了解不同栽培措施对降香黄檀叶片内源激素的影响,本研究通过铺设修枝、移植、钾肥、乙烯4个试验,分析各处理叶片激素含量特征。结果表明：修枝实验中,重度修枝处理IAA、GA₃、ZR、ABA含量均最大,分别为69.849、6.619、8.805、77.998 ng·g^-1。移植各处理中,去冠移处理IAA、ZR含量最高分别为73.195和9.472 ng·g^-1,而其ABA含量最低为52.001 ng·g^-1,GA₃含量最高的为断根处理8.418 ng·g^-1。IAA、ZR、GA₃含量K1钾肥配比最高分别为75.188、8.383、6.127 ng·g^-1;ABA最大含量71.082 ng·g^-1为CK处理。乙烯试验中,CK处理的IAA、GA₃含量最高分别为47.762、4.967 ng·g^-1;E2.5%处理的ABA含量96.94 ng·g^-1最高。E0.1%处理的ZR含量最高为9.378 ng·g^-1。修枝对GA₃/ABA和ZR/GA₃影响较大,其最小值分别比最大值降低了29.7%、19.0%。移植对IAA/ABA、GA₃/ABA影响较大,最小值比最大值依次降低了52.47%和51.47%。树干注射乙烯和钾肥对IAA/ABA、GA₃/ABA影响较大,乙烯试验最小值分别比最大值降低了55.4%、49.2%,钾肥试验最小值分别比最大值降低了48.8%和37.1%。     

蛋白质结构基因序列不同区域的两个统计参量

蛋白质结构基因序列不同区域的两个统计参量凌伦奖，徐军，沈如群，孙键，陈润生（中国科学院生物物理研究所１００１０１）ＤＮＡ序列数据库正以每年约增加５０％的速度飞速膨涨。在这种形势下，对繁多序列进行分析成了繁重的工作，单靠实验手段已无法适应要求，因而借助...     

计算生物大分子溶剂可及表面积的快速算法

提出了一种新的计算生物大分子溶剂可及表面的算法。这种算法由“立方体算法（ｃｕｂｅａｌｇｏｒｉｔｈｍ）”发展而来，运用二级网格方法建立了水合原子的立方体剖分数据库，大大提高了计算速度，而且可以通过调节格子的大小来选择合适的计算精度，适用于需要进行大量可及表面计算的蛋白质分子结构预测和模拟。