CRISPR/Cas系统：RNA靶向的基因组定向编辑新技术

CRISPR/Cas系统广泛存在于细菌及古生菌中, 是机体长期进化形成的RNA指导的降解入侵病毒或噬菌体DNA的适应性免疫系统。对Ⅱ型CRISPR/Cas系统的改造使其成为继锌指核酸酶(ZFNs)和TALE核酸酶(TALENs)以来的另一种对基因组进行高效定点修饰的新技术, 与ZFNs和TALENs相比, CRISPR/Cas系统更简单, 并且更容易操作。文章重点介绍了Ⅱ型CRISPR/Cas系统的基本结构、作用原理及这一技术在基因组定点修饰中的应用, 剖析了该技术可能存在的问题, 展望了CRISPR/Cas系统的应用前景, 为开展这一领域的研究工作提供参考。     

快速城市化过程中杭州市土地利用景观格局动态

基于1996、2000、2003和2006年杭州市SPOT高分辨率影像,运用多时相直接主成分分析（PCA）与合成分类器相结合的方法准确获取了研究区土地利用变化信息,并利用景观格局指数分析了研究期间杭州市土地利用景观格局的演化过程及特征.结果表明：1996—2006年间,快速城市化过程引发了研究区巨大的景观转化,在人为活动的强烈干扰下,景观格局已由1996年的以农业景观为主逐步变成2006年的以人工景观为主,且景观格局动态呈现多样性和复杂性;期间,耕地景观受城市化的影响最为严重,已经大规模、连片消失;园地景观本身规模很小,人为干预对其斑块结构的影响不是非常明显;林地景观主要呈大面积斑块聚集分布,景观格局对人为干扰的响应不是很敏感;水体景观受人为活动的影响很大,但由于是成片的消失,水体景观的破碎程度变化不明显;该区城市用地是变化规模最大、变化速度最快的景观类型,城市化过程对其结构产生了显著影响.     

光合细菌应用动态

光合细菌在养鱼、养虾、养鸡等方面作为饲料添加剂的应用和在作物方面作为生物肥料的应用,以及光合细菌净化水质,防病,治病方面的 应用。     

尿神经突起导向因子1、肾损伤分子-1、视黄醇结合蛋白水平与妊娠期高血压疾病早期肾损伤的关系研究

摘要 目的：研究尿神经突起导向因子1（Netrin-1）、肾损伤分子-1（Kim-1）、视黄醇结合蛋白（RBP）水平与妊娠期高血压疾病（HDCP）早期肾损伤的关系。方法：将我院从2017年2月～2020年2月收治的HDCP患者80例纳入研究,按照HDCP严重程度分作妊娠期高血压组22例、轻度子痫前期组32例、重度子痫前期组26例,另随机选取同期于我院接受规律孕产检以及分娩正常妊娠孕妇40例作为正常妊娠组,检测并比较各组尿Netrin-1、Kim-1、RBP水平。此外,将HDCP患者按照是否出现早期肾损伤分作肾功能损伤组42例和肾功能正常组38例,比较两组尿Netrin-1、Kim-1、RBP以及肾功能指标水平,并进行相关性分析,通过Logistic回归分析HDCP早期肾损伤的影响因素。结果：正常妊娠组、妊娠期高血压组、轻度子痫前期组、重度子痫前期组尿Netrin-1水平呈逐渐降低趋势,而尿Kim-1、RBP水平均呈逐渐升高趋势,多组数据间两两对比差异均有统计学意义（均P＜0.05）。肾功能损伤组尿Netrin-1水平低于肾功能正常组,而尿Kim-1、RBP以及血尿素氮、血肌酐、24 h尿白蛋白排出量（UAE）水平均明显高于肾功能正常组（均P＜0.05）。经Pearson相关性分析可得：HDCP早期肾损伤患者尿Netrin-1水平和血尿素氮、血肌酐、UAE均呈负相关关系,而Kim-1、RBP水平和血尿素氮、血肌酐、UAE均呈正相关关系（均P＜0.05）。经Logistic回归分析发现：尿Netrin-1是HDCP早期肾损伤的保护因素,而尿Kim-1、RBP是HDCP早期肾损伤的危险因素（均P＜0.05）。结论：随着尿Netrin-1水平的降低以及Kim-1、RBP水平的升高,HDCP早期肾损伤风险越高,检测尿Netrin-1、Kim-1、RBP水平可能有助于评估HDCP的病情严重程度和肾功能损伤。     

PCA 和PLS 应用于胃癌亚型分类研究

文章研究了基于微阵列基因表达数据的胃癌亚型分类。微阵列基因表达数据样本少、纬度高、噪声大的特点,使得数据降维成为分类成功的关键。作者将主成分分析(PCA) 和偏最小二乘（PLS）两种降维方法应用于胃癌亚型分类研究,以支持向量机（SVM）、K- 近邻法（KNN）为分类器对两套胃癌数据进行亚型分类。分类效果相比传统的医理诊断略高,最高准确率可达100%。研究结果表明,主成分分析和偏最小二乘方法能够有效地提取分类特征信息,并能在保持较高的分类准确率的前提下大幅度地降低基因表达数据的维数。     

沂蒙山区不同森林类型凋落物量及其动态特征

凋落物在森林养分循环中起重要作用,受森林类型、气候带等因素的影响。本文研究了沂蒙山区黑松(Pinus thunbergii Parl.)人工林、栓皮栎(Quercus variabilis Bl.)人工林和天然次生林的凋落物总量和组分的动态特征。天然次生林年凋落物总量(3368 kg/hm2)高于栓皮栎人工林(3256 kg/hm2)高于黑松人工林(3212 kg/hm2),森林类型间差异不显著。3种森林类型的凋落物月总量呈双峰曲线,最大峰值在10—11月,次峰值在4—5月,最小峰值出现时间不同:黑松人工林为12月,另两种森林类型为7月。针叶凋落量和比例、碎屑凋落量表现为黑松人工林高于天然次生林高于栓皮栎人工林,而阔叶凋落量和比例、果凋落量的比例则相反。枝凋落量在森林类型间无显著差异。线性回归分析表明,凋落物总量月动态受最低和最高气温的影响。针叶凋落量受最低气温、最高气温和最大降水量影响;阔叶凋落量受最低气温影响;枝凋落量受降水量、风速和最大降水量影响;果凋落量受气温、风速和降水量影响。结果阐明了暖温带森林类型对凋落物量及组分动态特征的影响,可为其养分循环特征提供数据支撑。     

柽柳(Tamarix spp.)和梭梭(Haloxylonammodendron)的"肥岛"效应

灌丛"肥岛"是全球干旱生态系统中的普遍现象,其发生和发展对干旱灌木、草原生态系统的结构和功能都具有重要影响,但其物种效应容易得到忽视.对准噶尔盆地南缘柽柳(Tamarix spp.)和梭梭(Haloxylon ammodendron)这两种不同地表形态灌木的冠下、冠缘和灌丛间地3种生境的土壤进行了采样、分析,结果表明:(1)柽柳和梭梭都存在"肥岛"现象,主要表现在土壤表层,其土壤性状与"岛"外土壤的差异随土壤深度增加而减弱;(2)生物性限制土壤养分由"岛"内向外梯度递减,而非生物性限制土壤要素可能高于、也可能低于"岛"外土壤,或者两者无显著差异;(3)从"肥岛"的空间尺度来看,柽柳"肥岛"的水平范围可能超出了本身冠幅覆盖区,而梭梭"肥岛"要小于本身冠幅覆盖区,其深度亦小于柽柳"肥岛";(4)相对于不同土壤要素而言,即使是同一物种,其"肥岛"也具有不同的空间范围.总的来看,研究区灌丛"肥岛"的发育具有明显的物种效应,相对梭梭而言,柽柳"肥岛"发育更广、更深,养分聚集更明显,其原因主要是柽柳的半球型树冠更利于保护和捕获凋落物,而较多的凋落物输入与土壤结构和土壤养分间的正反馈机制使柽柳冠下加速的生物地球化学循环能达到更广、更深的范围.灌丛"肥岛"的发育是干旱景观中生物过程与物理过程交互作用的产物,全面揭示其形成机理,探讨其对干旱生态系统结构、功能与动态的影响,需要更系统的研究.     

柽柳（Tamarix spp.）和梭梭（Haloxylon ammodendron）的“肥岛”效应

灌丛“肥岛”是全球干旱生态系统中的普遍现象,其发生和发展对干旱灌木、草原生态系统的结构和功能都具有重要影响,但其物种效应容易得到忽视。对准噶尔盆地南缘柽柳（Tamarix spp.）和梭梭（Haloxylon ammodendron）这两种不同地表形态灌木的冠下、冠缘和灌丛间地3种生境的土壤进行了采样、分析,结果表明：(1）柽柳和梭梭都存在“肥岛”现象,主要表现在土壤表层,其土壤性状与“岛”外土壤的差异随土壤深度增加而减弱;(2）生物性限制土壤养分由“岛”内向外梯度递减,而非生物性限制土壤要素可能高于、也可能低于“岛”外土壤,或者两者无显著差异;(3）从“肥岛”的空间尺度来看,柽柳“肥岛”的水平范围可能超出了本身冠幅覆盖区,而梭梭“肥岛”要小于本身冠幅覆盖区,其深度亦小于柽柳“肥岛”;(4）相对于不同土壤要素而言,即使是同一物种,其“肥岛”也具有不同的空间范围。总的来看,研究区灌丛“肥岛”的发育具有明显的物种效应,相对梭梭而言,柽柳“肥岛”发育更广、更深,养分聚集更明显,其原因主要是柽柳的半球型树冠更利于保护和捕获凋落物,而较多的凋落物输入与土壤结构和土壤养分间的正反馈机制使柽柳冠下加速的生物地球化学循环能达到更广、更深的范围。灌丛“肥岛”的发育是干旱景观中生物过程与物理过程交互作用的产物,全面揭示其形成机理,探讨其对干旱生态系统结构、功能与动态的影响,需要更系统的研究。     

不同水分条件下胡杨光响应曲线拟合模型比较

本研究通过测量不同水分条件下胡杨（Populus euphratica Oliv.）叶片的光响应曲线,并采用4种光响应模型对其光合特征参数拟合值与实测值进行比较,分析了不同水分条件下光响应曲线模型对胡杨适用性的影响机制。结果表明,当水分供应充足时,胡杨非直角双曲线模型对暗呼吸速率（R_d）的拟合效果最优,直角双曲线修正模型拟合光饱和点（LSP）、最大净光合速率（P_nmax）、光补偿点（LCP）的结果与实测值较接近;但当胡杨受到水分亏缺后,直角双曲线修正模型对P_nmax和光饱和点（LSP）的拟合效果最优,直角双曲线模型对R_d和LCP的拟合效果最佳。因此,水分条件有利时胡杨应用直角双曲线修正模型、非直角双曲线模型较好;水分亏缺条件下采用直角双曲线修正模型、直角双曲线模型更为适合。