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目的 耐辐射奇球菌是一种对紫外线、电离、干燥和化学试剂具有较强抗性的极端微生物。然而,该菌在紫外辐照后恢复早期的分子响应还不完全清楚。本文的目的是揭示耐辐射奇球菌在这一阶段的转录组响应。方法 本研究采用RNA-seq技术,测定了正常和紫外辐照培养条件下耐辐射奇球菌的转录组。为确定关键的差异表达基因及其调控关系,进行了功能富集分析。选取部分关键差异表达基因,进行实时定量PCR实验验证。利用以往研究中的转录组数据,寻找紫外辐照、电离辐射和干燥胁迫条件下公共的差异表达基因。构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络;对蛋白质互作网络中的枢纽基因和主要模块进行了鉴定;对这些枢纽基因和模块进行了功能富集分析。结果 紫外辐照后的恢复早期,上调基因数量是下调基因数量的2倍以上,且多数与应激反应和DNA修复有关。恢复早期的修复途径主要有单链退火(SSA)途径(涉及基因:ddr A-D)、非同源端连接(NHEJ)途径(涉及基因:lig B、ppr A)和核苷酸切除修复(NER)途径(涉及基因:uvr A-C),前两种途径为同源重组(HR)做准备,而NER途径去除紫外线照射带来的嘧啶二聚体。通过比较紫外辐照、电离辐...  相似文献   
163.
尿路结石的发病率是由地理区域、种族分布、社会经济地位以及饮食习惯所决定的。在过去几十年间结石形成危险因素中的饮食习惯改变,不仅影响了结石的发病率,而且对结石的部位和化学成份的改变也产生了很大影响,但草酸钙结石的发病仍最为普遍。大量流行病学调查,阐明了结石发病机制中营养因素的重要性,并建议特定的饮食可作为结石预防和治疗最为适用的方法之一。  相似文献   
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