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一种简便的海藻DNA提取方法 总被引:9,自引:0,他引:9
把包裹缠绕在大量粘性多糖中的海藻DNA提取出来是一个十分困难的。研究表明,DNA样品中的酸性多糖会抑制限制性酶切反应和PCR扩增,而海藻组织中主要的碳水化合物是硫多糖和羧酸多糖,而且比陆生植物的中性多糖更易水溶,使溶液高度粘稠,在DNA提取中很难去除... 相似文献
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对来自贵州6个不同地区的白三叶基因组进行甲基化敏感扩增多态性(methylation sensitive amplified polymorphism, MSAP)分析。结果表明:分析选出24对MSAP选扩增引物,共扩增产生7 643个位点,独山、赫章、晴隆、印江、天柱和从江地区白三叶扩增的位点数分别为1 211、1 348、1 297、1 300、1 255和1 232。其中总甲基化位点分别占73.37%、68.13%、71.68%、65.43%、70.41%和70.51%;全甲基化位点分别占55.32%、49.76%、53.20%、50.61%、51.35%和54.21%,表明白三叶基因组甲基化主要以双链甲基化为主。进一步分析不同地区白三叶之间甲基化模式的变化,结果显示:未发生甲基化模式改变的均值占36.22%;发生甲基化模式改变的比例均值为59.61%,其中去甲基化模式为29.15%,甲基化模式为30.46%,表明基因组发生甲基化和去甲基化比例超过未发生甲基化的比例。本研究中不同地区野生白三叶甲基化水平各不相同,同时各个地区之间甲基化模式变化也有差异,说明白三叶发生基因组甲基化具有时空特异性。 相似文献
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血管内皮生长因子A (vascular endothelial growth factor A, VEGFA)主要生理功能是增加小静脉血管与微血管的通透性,是血管生成过程最重要的正向调控因子。本研究采用RACE技术克隆布氏鲳鲹VEGFA基因和实时荧光定量PCR方法对该基因进行组织分布表达分析。结果显示,该VEGFA基因cDNA序列全长1 470 bp,5’UTR、3’UTR长度分别为617 bp和208 bp,ORF为645 bp,共编码214个氨基酸,其中包括一个信号肽和两个N-糖基化位点。理论分子量为25.23 kD,等电点为8.91。同源性分析结果表明,布氏鲳鲹VEGFA基因与同属鲈形目鱼类高体鰤的同源性最高(96.1%)。荧光定量PCR分析显示,VEGFA在布氏鲳鲹组织中均有表达,其中肝脏表达水平最高,其次是心脏,在小脑、胃、肠表达较低,在肾脏组织中的表达量最低,说明布氏鲳鲹VEGFA基因在生理代谢以及血管生成过程中可能发挥重要调节作用。本研究结果为深入研究布氏鲳鲹VEGFA基因的生理代谢调控功能提供理论依据。 相似文献
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为了评估青藏高原南北部林地、草地和农地的土壤质量状况,明确3种土地利用方式下生产力水平的关键影响因子,在青藏高原南部和北部采集了101个(0~30 cm)土壤样品测定土壤理化性质,通过主成分分析选择3个指标作为最小数据集(MDS),综合评估青藏高原南北部土壤质量。结果表明:3种土地利用方式下土壤理化特性在青藏高原南、北部差异显著。北部土壤有机质(SOM)、全氮(TN)、速效磷(AP)、速效钾(AK)含量均高于南部,且南北部的林地SOM、TN含量均显著高于农地和草地。土壤铵态氮(NH4+-N)含量表现为农地>林地>草地,且在南部差异显著,而南北部硝态氮(NO3--N)含量均表现为林地最高。农地的土壤容重(BD)和电导率(EC)显著高于草地和林地,且北部农地和草地的BD和EC高于南部。南部草地pH显著高于林地和农地,北部林地pH最高。北部土壤质量选取指标为SOM、AP和pH,林地、草地和农地的土壤质量指数依次为0.56、0.53和0.47;南部选取指标为SOM、全磷(TP)和NH4... 相似文献
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目的:研究尿液CMV-DNA联合血清CMV-Ig M检测对婴儿巨细胞感染的诊断价值。方法:选取2012年8月到2014年8月期间我院疑似巨细胞感染的婴幼儿70例,应用化学发光法检测血清CMV-Ig M,采用实时荧光定量PCR法(FQ-PCR)来检测尿液CMV-DNA,并比较经抗病毒治疗前和治疗后检测结果的变化。结果:单独检测尿CMV-DNA的阳性率为62.8%(44/70),单独检测血清CMV-Ig M的阳性率为55.7%(39/70),两者比较差异无统计学意义(P0.05);两者联合检测的阳性率为77.1%(54/70),与两种方法单独检测比较差异具有统计学意义(P0.05);经抗病毒治疗以后两种检测结果均显著降低,与治疗前比较差异具有统计学意义(P0.05)。结论:尿液CMV-DNA联合血清CMV-Ig M检测能显著提高婴儿巨细胞感染的阳性率。 相似文献